source: sans/Dev/branches/nxcansas_writer/NCNR_User_Procedures/Common/Packages/PlotManager/PlotUtilsMacro_v40.ipf @ 1167

Last change on this file since 1167 was 1167, checked in by krzywon, 3 years ago

Rename and move Reduction/SANS/WriteHDF5.ipf to Common/NIST_NXcanSAS_v709.ipf. Added a basic data loader for plotting.

File size: 77.2 KB
Line 
1#pragma rtGlobals=1             // Use modern global access method.
2#pragma version=4.00
3#pragma IgorVersion=6.1
4
5// This is to be used with the Analysis packages ONLY
6// there are a number of utility procedures here for loading
7// data and generating valid lists of data files that are
8// directly copied from the Reduction package
9// -- There WILL be name conflicts if you mix the two...
10//
11// 16 DEC 05 SRK
12// prepended function names with A_ to tag them for the
13// "A"nalysis parckage, though nearly all are duplicate procedures
14// so there will be no overlap with the reduction package
15//
16//
17// these extra procedures are used by:
18// Linearized fits (duplicated in Reduction - will need to handle gently)
19// Invariant (no overlap with reduction)
20//
21// SRK MAR 2005
22
23// create a KW=string; of model=coef correspondence as the models are plotted, rather than
24// some other hard-wired solution
25Function AddModelToStrings(funcStr,coefStr,paramStr,suffix)
26        String funcStr,coefStr,paramStr,suffix
27       
28        if(exists("root:Packages:NIST:paramKWStr")==0)
29                String/G root:Packages:NIST:coefKWStr=""
30                String/G root:Packages:NIST:paramKWStr=""
31                String/G root:Packages:NIST:suffixKWStr=""
32        endif
33        SVAR coefKWStr = root:Packages:NIST:coefKWStr
34        SVAR paramKWStr = root:Packages:NIST:paramKWStr
35        SVAR suffixKWStr = root:Packages:NIST:suffixKWStr
36        coefKWStr += funcStr+"="+coefStr+";"
37        paramKWStr += funcStr+"="+paramStr+";"
38        suffixKWStr += funcStr+"="+suffix+";"
39end
40
41// always pass this the function string
42//
43// this is new in the 2009 release, so make sure that it generates itself as needed.
44// Two options: (1) search and construct as needed, ask for intervention if I need it.
45// (2) since I'm passed the function, try to replot it to re-run the function
46// to fill in the strings. (Being sure to save the coefficients)
47//
48// using method (1) to fill in what I need with no intervention
49//
50Function/S getFunctionParams(funcStr)
51        String funcStr
52
53        String paramStr=""
54        SVAR/Z listStr=root:Packages:NIST:paramKWStr
55
56        if(SVAR_Exists(listStr))
57                paramStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
58                if(strlen(paramStr)!=0)                 //will drop out of loop if string can't be found
59                        return(paramStr)
60                endif
61        else    //global string does not exist, create it and fill it in
62                Variable/G root:Pacakges:NIST:gReconstructStrings = 1                   //coefficients old style and must be rebuilt too
63                String/G root:Packages:NIST:paramKWStr=""
64                SVAR/Z listStr=root:Packages:NIST:paramKWStr
65        endif   
66       
67        // find everything to rebuild only if the model has been plotted (if so, coefficients will exist)
68        String coef = getFunctionCoef(funcStr)
69        if(strlen(coef)==0)
70                //model not plotted, don't reconstruct, return null string
71                return(paramStr)
72        endif
73       
74        ///// NEED TO BE IN PROPER DATA FOLDER FOR SMEARED FUNCTIONS
75        // FUNCTION POP MENU WILL LOOK IN ROOT OTHERWISE
76        ControlInfo/W=WrapperPanel popup_0
77        String folderStr=S_Value
78        // this if/else/endif should not ever return an error alert     
79        // it should simply set the data folder properly       
80        if(Stringmatch(funcStr,"Smear*"))               //simple test for smeared function
81                if(DataFolderExists("root:"+folderStr))
82                        SetDataFolder $("root:"+folderStr)
83                else
84                        SetDataFolder root:
85                endif
86        else
87                SetDataFolder root:
88        endif
89       
90        // model was plotted, find the suffix to fill in the parameter wave
91        SVAR suffListStr=root:Packages:NIST:suffixKWStr
92        String suffix = StringByKey(coef, suffListStr  ,"=",";",0)
93       
94        String paramWave = WaveList("*par*"+suffix,"","TEXT:1")         //should be one wave name, no trailing semicolon
95        listStr += funcStr+"="+paramWave+";"
96
97        //now look it up again
98        paramStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
99
100        return(paramStr)
101End
102
103// always pass this the function string
104//
105Function/S getFunctionCoef(funcStr)
106        String funcStr
107
108        SVAR listStr=root:Packages:NIST:coefKWStr
109        String coefStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
110
111        return(coefStr)
112End
113
114// always pass this the Function string
115//
116// does NOT return the leading "_" as part of the suffix
117// may need to set the string correctly - so lost of messing around for back-compatibility
118Function/S getModelSuffix(funcStr)
119        String funcStr
120
121        SVAR listStr=root:Packages:NIST:suffixKWStr
122        String suffixStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
123
124        if(strlen(suffixStr) !=0)               //found it, get out
125                return(suffixStr)
126        endif
127       
128        // was the model plotted?
129        String coef = getFunctionCoef(funcStr)
130        if(strlen(coef)==0)             
131                //nothing plotted
132                return("")
133        else
134                //plotted, find the coeff
135                String suffix = StringByKey(coef, ListStr  ,"=",";",0)
136       
137                // add to the suffix list in the new style, if it was found
138                if(strlen(suffix) !=0)
139                        listStr += funcStr+"="+suffix+";"
140                endif
141                return(suffix)
142        endif
143       
144        return("")
145End
146
147
148/////////////////////////////
149
150
151
152
153// loads a 1-d (ascii) datafile and plots the data
154// will overwrite existing data if user is OK with this
155// - multiple datasets can be automatically plotted on the same graph
156//
157//substantially easier to write this as a Proc rather than a function...
158
159//
160Proc A_LoadOneDData()
161        A_LoadOneDDataWithName("",1)            //will prompt for file and plot data
162End
163
164// load the data specified by fileStr (a full path:name)
165// and plots if doPlot==1
166// if fileStr is null, a dialog is presented to select the file
167//
168// 3 cases (if)
169// - 3 columns = QIS, no resolution
170// - 6 columns = QSIG, SANS w/resolution
171// - 5 columns = old-style desmeared USANS data (from VAX)
172//
173// This loader replaces the A_LoadOneDData() which was almost completely duplicated code
174//
175//new version, 19JUN07 that loads each data set into a separate data folder
176// the data folder is given the "base name" of the data file as it's loaded
177//
178
179Proc A_LoadOneDDataWithName(fileStr,doPlot)
180        String fileStr
181        Variable doPlot
182       
183        A_LoadOneDDataToName(fileStr,"",doPlot,0)
184
185End
186
187
188///Function that takes output name as well as input
189Proc A_LoadOneDDataToName(fileStr,outStr,doPlot,forceOverwrite)
190        String fileStr, outstr
191        Variable doPlot,forceOverwrite
192       
193        Variable rr,gg,bb,refnum,dQv
194        String w0,w1,w2,n0,n1,n2
195        String w3,w4,w5,n3,n4,n5                        //3 extra waves to load
196        SetDataFolder root:             //build sub-folders for each data set under root
197
198// I can't see that we need to find dQv here.   
199//      if (exists("root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:gDQv"))
200//              //Running from USANS reduction
201//              Variable dQv = root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:gDQv
202//      endif
203//      if(exists("root:Packages:NIST:USANS_dQv"))
204//              //Running from SANS Analysis
205//              Variable dQv = root:Packages:NIST:USANS_dQv
206//      else
207//              //running from somewhere else, probably SANS Reduction, which uses common loaders
208//              Variable/G root:Packages:NIST:USANS_dQv = 0.117
209//      endif
210        String angst = StrVarOrDefault("root:Packages:NIST:gAngstStr", "A" )
211
212        // if no fileStr passed in, display dialog now
213        if (cmpStr(fileStr,"") == 0)
214                fileStr = DoOpenFileDialog("Select a data file to load")
215                if (cmpstr(fileStr,"") == 0)
216                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = ""
217                        return          //get out if no file selected
218                endif
219        endif
220
221        if (isXML(fileStr) == 1 || isNXcanSAS(fileStr) == 1)
222                if (isNXcanSAS(fileStr) == 1)
223                        LoadNXcanSASData(fileStr,outstr,doPlot,forceOverwrite)
224                else
225                        LoadNISTXMLData(fileStr,outstr,doPlot,forceOverwrite)
226                endif
227        else
228                //Load the waves, using default waveX names
229                //if no path or file is specified for LoadWave, the default Mac open dialog will appear
230                LoadWave/G/D/A/Q fileStr
231                String fileNamePath = S_Path+S_fileName
232//              String basestr = ParseFilePath(3,ParseFilePath(5,fileNamePath,":",0,0),":",0,0)
233
234                String basestr
235                if (!cmpstr(outstr, ""))                //Outstr = "", cmpstr returns 0
236//                      enforce a short enough name here to keep Igor objects < 31 chars
237                        baseStr = ShortFileNameString(CleanupName(S_fileName,0))
238                        baseStr = CleanupName(baseStr,0)                //in case the user added odd characters
239                        //baseStr = CleanupName(S_fileName,0)
240                else
241                        baseStr = outstr                        //for output, hopefully correct length as passed in
242                endif
243       
244//              print "basestr :"+basestr
245                String fileName =  ParseFilePath(0,ParseFilePath(5,filestr,":",0,0),":",1,0)
246//              print "filename :"+filename
247                Variable numCols = V_flag
248               
249                //changes JIL to allow 2-column data to be read in, "faking" a 3rd column of errors
250                if(numCols==2) //no errors
251                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
252                        Duplicate/O $("root:"+n1), errorTmp
253                        errorTmp = 0.01*(errorTmp)+ 0.03*sqrt(errorTmp)
254                        S_waveNames+="errorTmp;"
255                        numCols=3
256                endif
257               
258                if(numCols==3)          //simple 3-column data with no resolution information
259                       
260                        // put the names of the three loaded waves into local names
261                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
262                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
263                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
264                       
265                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
266                        w0 = CleanupName((basestr + "_q"),0)
267                        w1 = CleanupName((basestr + "_i"),0)
268                        w2 = CleanupName((basestr + "_s"),0)
269                       
270                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
271                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
272                                if (!forceOverwrite)
273                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
274                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
275                                                SetDataFolder root:
276                                                KillWaves $n0,$n1,$n2           // kill the default waveX that were loaded
277                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
278                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
279                                                endif
280                                                return  //quits the macro
281                                        endif
282                                endif
283                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
284                        else
285                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
286                        endif
287
288                       
289                        ////overwrite the existing data, if it exists
290                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
291                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
292                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
293       
294                        // no resolution matrix to make
295       
296                        SetScale d,0,0,"1/A",$w0
297                        SetScale d,0,0,"1/cm",$w1
298                       
299                endif           //3-col data
300               
301                if(numCols == 6)                //6-column SANS or USANS data that has resolution information
302                       
303                        // put the names of the (default named) loaded waves into local names
304                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
305                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
306                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
307                        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
308                        n4 = StringFromList(4, S_waveNames ,";" )
309                        n5 = StringFromList(5, S_waveNames ,";" )
310                       
311                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
312                        w0 = CleanupName((basestr + "_q"),0)
313                        w1 = CleanupName((basestr + "_i"),0)
314                        w2 = CleanupName((basestr + "_s"),0)
315                        w3 = CleanupName((basestr + "sq"),0)
316                        w4 = CleanupName((basestr + "qb"),0)
317                        w5 = CleanupName((basestr + "fs"),0)
318                       
319                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
320                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
321                                if(!forceOverwrite)
322                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
323                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
324                                                SetDataFolder root:
325                                                KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4,$n5               // kill the default waveX that were loaded
326                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
327                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
328                                                endif
329                                                return          //quits the macro
330                                        endif
331                                endif
332                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
333                        else
334                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
335                        endif
336
337
338
339       
340        ////overwrite the existing data, if it exists
341                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
342                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
343                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
344                        Duplicate/O $("root:"+n3), $w3
345                        Duplicate/O $("root:"+n4), $w4
346                        Duplicate/O $("root:"+n5), $w5
347       
348                        // need to switch based on SANS/USANS
349                        if (isSANSResolution($w3[0]))           //checks to see if the first point of the wave is <0]
350                                // make a resolution matrix for SANS data
351                                Variable np=numpnts($w0)
352                                Make/D/O/N=(np,4) $(baseStr+"_res")
353                               
354                                $(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]         //sigQ
355                                $(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]         //qBar
356                                $(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]         //fShad
357                                $(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]         //Qvalues
358                        else
359                                //the data is USANS data
360                                // marix calculation here, but for now, just copy the waves
361                                //$(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]               //sigQ
362                                //$(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]               //qBar
363                                //$(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]               //fShad
364                                //$(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]               //Qvalues
365                                dQv = -$w3[0]
366
367//DONE: this works correctly and can be included in either
368// a VSANS reduction experiment, or a standalone analysis package
369// -- since this is a Proc, not a function, #conditional compile does not work,
370// but, since it's a Proc, it is not compiled, so missing functions aren't flagged as a compile error
371//                              if (exists("NCNR_VSANS")==6)                    //defined in the main  VSANS #includes file.
372//                                      DoAlert 0,"**Treating data as VSANS data**"
373                                        Duplicate/O $w3,$(baseStr+"_dQv")                       //save a copy for VSANS
374                                        $(baseStr+"_dQv") = -$(baseStr+"_dQv")
375                                        USANS_CalcWeights(baseStr,dQv)
376//                              else
377//                                      DoAlert 0,"Treating data as USANS (normal slit-smeared data)"
378//                                      USANS_CalcWeights(baseStr,dQv)
379//                              endif                           
380
381                               
382                               
383                        endif
384                        Killwaves/Z $w3,$w4,$w5                 //get rid of the resolution waves that are in the matrix
385       
386                        SetScale d,0,0,"1/A",$w0
387                        SetScale d,0,0,"1/cm",$w1
388               
389                endif   //6-col data
390       
391                // Load ORNL data from Heller program
392                if(numCols == 4)                //4-column SANS or USANS data that has resolution information
393                       
394                        // put the names of the (default named) loaded waves into local names
395                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
396                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
397                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
398                        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
399                       
400                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
401                        w0 = CleanupName((basestr + "_q"),0)
402                        w1 = CleanupName((basestr + "_i"),0)
403                        w2 = CleanupName((basestr + "_s"),0)
404                        w3 = CleanupName((basestr + "sq"),0)
405                        w4 = CleanupName((basestr + "qb"),0)
406                        w5 = CleanupName((basestr + "fs"),0)
407       
408                       
409                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
410                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
411                                if(!forceOverwrite)
412                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
413                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
414                                                SetDataFolder root:
415                                                KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3               // kill the default waveX that were loaded
416                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
417                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
418                                                endif
419                                                return          //quits the macro
420                                        endif
421                                endif
422                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
423                        else
424                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
425                        endif
426       
427
428
429       
430        ////overwrite the existing data, if it exists
431                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
432                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
433                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
434                        Duplicate/O $("root:"+n3), $w3
435                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w4 // Set qb wave to nominal measured Q values
436                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w5 // Make wave of appropriate length
437                        $w4 = $w0
438                        $w5 = 1                                           //  Set all shadowfactor to 1
439       
440                        // need to switch based on SANS/USANS
441                        if (isSANSResolution($w3[0]))           //checks to see if the first point of the wave is <0]
442                                // make a resolution matrix for SANS data
443                                Variable np=numpnts($w0)
444                                Make/D/O/N=(np,4) $(baseStr+"_res")
445                               
446                                $(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]         //sigQ
447                                $(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]         //qBar
448                                $(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]         //fShad
449                                $(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]         //Qvalues
450                        else
451                                //the data is USANS data
452                                // marix calculation here, but for now, just copy the waves
453                                //$(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]               //sigQ
454                                //$(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]               //qBar
455                                //$(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]               //fShad
456                                //$(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]               //Qvalues
457                                dQv = -$w3[0]
458                               
459                                USANS_CalcWeights(baseStr,dQv)
460                               
461                        endif
462                        Killwaves/Z $w3,$w4,$w5                 //get rid of the resolution waves that are in the matrix
463       
464                        SetScale d,0,0,"1/A",$w0
465                        SetScale d,0,0,"1/cm",$w1
466               
467                endif   //4-col data
468       
469       
470                if(numCols==5)          //this is the "old-style" VAX desmeared data format
471                       
472                        // put the names of the three loaded waves into local names
473                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
474                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
475                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
476                        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
477                        n4 = StringFromList(4, S_waveNames ,";" )
478                       
479                       
480                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
481                        w0 = CleanupName((basestr+"_q"),0)
482                        w1 = CleanupName((basestr+"_i"),0)
483                        w2 = CleanupName((basestr+"_s"),0)
484                        w3 = CleanupName((basestr+"_ism"),0)
485                        w4 = CleanupName((basestr+"_fit_ism"),0)
486                       
487                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
488                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
489                                if(!forceOverwrite)
490                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
491                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
492                                                KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4,$n5               // kill the default waveX that were loaded
493                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
494                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
495                                                endif           //set the last file loaded to the one NOT loaded
496                                                return          //quits the macro
497                                        endif
498                                endif
499                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
500                        else
501                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
502                        endif
503                       
504                        ////overwrite the existing data, if it exists   
505                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
506                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
507                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
508                        Duplicate/O $("root:"+n3), $w3
509                        Duplicate/O $("root:"+n4), $w4
510                       
511                        // no resolution matrix
512                endif           //5-col data
513
514                //////
515                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
516                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
517                endif
518       
519               
520                //plot if desired
521                if(doPlot)
522                        Print GetDataFolder(1)
523                       
524                        // assign colors randomly
525                        rr = abs(trunc(enoise(65535)))
526                        gg = abs(trunc(enoise(65535)))
527                        bb = abs(trunc(enoise(65535)))
528                       
529                        // if target window is a graph, and user wants to append, do so
530                   DoWindow/B Plot_Manager
531                        if(WinType("") == 1)
532                                DoAlert 1,"Do you want to append this data to the current graph?"
533                               
534                               
535                                if(V_Flag == 1)
536                                        AppendToGraph $w1 vs $w0
537                                        ModifyGraph mode($w1)=3,marker($w1)=19,msize($w1)=2,rgb($w1) =(rr,gg,bb),tickUnit=1
538                                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
539                                        ModifyGraph tickUnit(left)=1
540                                else
541                                //new graph
542                                        SetDataFolder $("root:"+baseStr)                //sometimes I end up back in root: here, and I can't figure out why!
543                                        Display $w1 vs $w0
544                                        ModifyGraph log=1,mode($w1)=3,marker($w1)=19,msize($w1)=2,rgb($w1)=(rr,gg,bb),tickUnit=1
545                                        ModifyGraph grid=1,mirror=2,standoff=0
546                                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
547                                        ModifyGraph tickUnit(left)=1
548                                        Label left "I(q)"
549                                        Label bottom "q ("+angst+"\\S-1\\M)"
550                                        Legend
551                                endif
552                        else
553                        // graph window was not target, make new one
554                                Display $w1 vs $w0
555                                ModifyGraph log=1,mode($w1)=3,marker($w1)=19,msize($w1)=2,rgb($w1)=(rr,gg,bb),tickUnit=1
556                                ModifyGraph grid=1,mirror=2,standoff=0
557                                ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
558                                ModifyGraph tickUnit(left)=1
559                                Label left "I(q)"
560                                Label bottom "q ("+angst+"\\S-1\\M)"
561                                Legend
562                        endif
563                endif
564                       
565                //go back to the root folder and clean up before leaving
566                SetDataFolder root:
567                KillWaves/Z $n0,$n1,$n2,$n3,$n4,$n5
568               
569        endif
570End
571
572
573//procedure for loading NSE data in the format (4-columns)
574// qvals - time - I(q,t) - dI(q,t)
575//
576//
577// this does NOT load the data into separate folders...
578//
579Proc A_LoadNSEData()
580        A_LoadNSEDataWithName("",1)
581End
582
583Proc A_LoadNSEDataWithName(fileStr,doPlot)
584
585        //Load the waves, using default waveX names
586        //if no path or file is specified for LoadWave, the default Mac open dialog will appear
587        LoadWave/G/D/A  fileStr
588        String filename = S_fileName
589       
590        String w0,w1,w2,n0,n1,n2,wt,w3,n3
591        Variable rr,gg,bb
592       
593        // put the names of the three loaded waves into local names
594        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
595        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
596        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
597        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
598       
599       
600        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
601        w0 = CleanupName(("qvals_"+S_fileName),0)
602        w1 = CleanupName(("time_"+S_fileName),0)
603        w2 = CleanupName(("iqt_"+S_fileName),0)
604        w3 = CleanupName(("iqterr_"+S_fileName),0)
605       
606        if(exists(w0) !=0)
607                DoAlert 0,"This file has already been loaded. Use Append to Graph..."
608                KillWaves $n0,$n1,$n2           // kill the default waveX that were loaded
609                return
610        endif
611       
612        // Rename to give nice names
613        Rename $n0, $w0
614        Rename $n1, $w1
615        Rename $n2, $w2
616        Rename $n3, $w3
617               
618        if(doPlot)
619                // assign colors randomly
620                rr = abs(trunc(enoise(65535)))
621                gg = abs(trunc(enoise(65535)))
622                bb = abs(trunc(enoise(65535)))
623               
624                // if target window is a graph, and user wants to append, do so
625                if(WinType("") == 1)
626                        DoAlert 1,"Do you want to append this data to the current graph?"
627                        if(V_Flag == 1)
628                                AppendToGraph $w2 vs $w1
629                                ModifyGraph mode($w2)=3,marker($w2)=29,msize($w2)=2,rgb($w2) =(rr,gg,bb),grid=1,mirror=2,tickUnit=1
630                                ErrorBars/T=0 $w2 Y,wave=($w3,$w3)
631                        else
632                        //new graph
633                                Display $w2 vs $w1
634                                ModifyGraph standoff=0,mode($w2)=3,marker($w2)=29,msize($w2)=2,rgb($w2)=(rr,gg,bb),grid=1,mirror=2,tickUnit=1
635                                ErrorBars/T=0 $w2 Y,wave=($w3,$w3)
636                                Legend
637                        endif
638                else
639                // graph window was not target, make new one
640                        Display $w2 vs $w1
641                        ModifyGraph standoff=0,mode($w2)=3,marker($w2)=29,msize($w2)=2,rgb($w2)=(rr,gg,bb),grid=1,mirror=2,tickUnit=1
642                        ErrorBars/T=0 $w2 Y,wave=($w3,$w3)
643                        Legend
644                endif
645        endif //doPlot         
646
647End
648
649//procedure for loading desmeared USANS data in the format (5-columns)
650// qvals - I(q) - sig I - Ism(q) - fitted Ism(q)
651//no weighting wave is created (not needed in IGOR 4)
652//
653// not really ever used...
654//
655Proc A_LoadUSANSData()
656
657        //Load the waves, using default waveX names
658        //if no path or file is specified for LoadWave, the default Mac open dialog will appear
659        LoadWave/G/D/A
660   String filename = S_fileName
661       
662        String w0,w1,w2,n0,n1,n2,w3,n3,w4,n4
663        Variable rr,gg,bb
664       
665        // put the names of the three loaded waves into local names
666        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
667        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
668        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
669        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
670        n4 = StringFromList(4, S_waveNames ,";" )
671       
672       
673        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
674        w0 = CleanupName((S_fileName+"_q"),0)
675        w1 = CleanupName((S_fileName+"_i"),0)
676        w2 = CleanupName((S_fileName+"_s"),0)
677        w3 = CleanupName((S_fileName+"_ism"),0)
678        w4 = CleanupName((S_fileName+"_fit_ism"),0)
679       
680        if(exists(w0) !=0)              //the wave already exists
681                DoAlert 1,"This file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
682                if(V_flag==2)   //user selected No
683                        KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4           // kill the default waveX that were loaded
684                        if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
685                                String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
686                        endif           //set the last file loaded to the one NOT loaded
687                        return          //quits the macro
688                endif
689        endif
690       
691        ////overwrite the existing data, if it exists
692        Duplicate/O $n0, $w0
693        Duplicate/O $n1, $w1
694        Duplicate/O $n2, $w2
695        Duplicate/O $n3, $w3
696        Duplicate/O $n4, $w4
697        KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4
698       
699        if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
700                String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
701        endif
702               
703        // assign colors randomly
704        rr = abs(trunc(enoise(65535)))
705        gg = abs(trunc(enoise(65535)))
706        bb = abs(trunc(enoise(65535)))
707       
708                // if target window is a graph, and user wants to append, do so
709        if(WinType("") == 1)
710                DoAlert 1,"Do you want to append this data to the current graph?"
711                if(V_Flag == 1)
712                        AppendToGraph $w1 vs $w0
713                        ModifyGraph mode=3,marker=29,msize=2,rgb ($w1) =(rr,gg,bb),tickUnit=1,grid=1,mirror=2
714                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
715                else
716                //new graph
717                        Display $w1 vs $w0
718                        ModifyGraph log=1,mode=3,marker=29,msize=2,rgb=(rr,gg,bb),tickUnit=1,grid=1,mirror=2
719                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
720                        Legend
721                endif
722        else
723        // graph window was not target, make new one
724                Display $w1 vs $w0
725                ModifyGraph log=1,mode=3,marker=29,msize=2,rgb=(rr,gg,bb),tickUnit=1,grid=1,mirror=2
726                ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
727                Legend
728        endif
729               
730End
731
732
733//// Extra "Utility Procedures"
734// to pick path, get a list of data files, and make sure that a valid filename
735// is passed to LoadOneDDataWithName()
736//
737
738//prompts user to choose the local folder that contains the SANS Data
739//only one folder can be used, and its path is catPathName (and is a NAME, not a string)
740//this will overwrite the path selection
741//returns 1 if no path selected as error condition
742Function A_PickPath()
743       
744        //set the global string to the selected pathname
745        NewPath/O/M="pick the SANS data folder" catPathName
746        PathInfo/S catPathName
747        String dum = S_path
748        String alertStr = ""
749        alertStr = "You must set the path to Charlotte through a Mapped Network Drive, not through the Network Neighborhood"
750        //alertStr += "  Please see the manual for details."
751        if (V_flag == 0)
752                //path does not exist - no folder selected
753                String/G root:Packages:NIST:gCatPathStr = "no folder selected"
754                return(1)
755        else
756                //set the global to the path (as a string)
757                // need 4 \ since it is the escape character
758
759// SRK 2016, for windows 10, try to eliminate this restriction         
760//              print igorinfo(3)
761//              if(cmpstr("\\\\",dum[0,1])==0)  //Windoze user going through network neighborhood
762//                      DoAlert 0,alertStr
763//                      KillPath catPathName
764//                      return(1)
765//              endif
766               
767                String/G root:Packages:NIST:gCatPathStr = dum
768                return(0)               //no error
769        endif
770End
771
772//Function attempts to find valid filename from partial name that has been stripped of
773//the VAX version number. The partial name is tried first
774//*** the PATH is hard-wired to catPathName (which is assumed to exist)
775//version numers up to ;10 are tried
776//only the "name;vers" is returned. the path is not prepended, hence the return string
777//is not a complete specification of the file
778//
779// added 11/99 - uppercase and lowercase versions of the file are tried, if necessary
780// since from marquee, the filename field (textread[0]) must be used, and can be a mix of               // 02JUL13
781// upper/lowercase letters, while the filename on the server (should) be all caps
782// now makes repeated calls to ValidFileString()
783//
784Function/S A_FindValidFilename(partialName)
785        String PartialName
786       
787        String retStr=""
788       
789        //try name with no changes - to allow for ABS files that have spaces in the names 12APR04
790        retStr = A_ValidFileString(partialName)
791        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
792                //non-null return
793                return(retStr)
794        Endif
795       
796        //if the partial name is derived from the file header, there can be spaces at the beginning
797        //or in the middle of the filename - depending on the prefix and initials used
798        //
799        //remove any leading spaces from the name before starting
800        partialName = A_RemoveAllSpaces(partialName)
801       
802        //try name with no spaces
803        retStr = A_ValidFileString(partialName)
804        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
805                //non-null return
806                return(retStr)
807        Endif
808       
809        //try all UPPERCASE
810        partialName = UpperStr(partialName)
811        retStr = A_ValidFileString(partialName)
812        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
813                //non-null return
814                return(retStr)
815        Endif
816       
817        //try all lowercase (ret null if failure)
818        partialName = LowerStr(partialName)
819        retStr = A_ValidFileString(partialName)
820        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
821                //non-null return
822                return(retStr)
823        else
824                return(retStr)
825        Endif
826End
827
828//function to test a binary file to see if it is a RAW binary SANS file
829//first checks the total bytes in the file (which for raw data is 33316 bytes)
830//**note that the "DIV" file will also show up as a raw file by the run field
831//should be listed in CAT/SHORT and in patch windows
832//
833//Function then checks the file fname (full path:file) for "RAW" run.type field
834//if not found, the data is not raw data and zero is returned
835Function A_CheckIfRawData(fname)
836        String fname
837       
838        Variable refnum,totalBytes
839        String testStr=""
840       
841        Open/R/T="????TEXT" refNum as fname
842        //get the total number of bytes in the file, to avoid moving past EOF
843        FStatus refNum
844        totalBytes = V_logEOF
845        //Print totalBytes
846        if(totalBytes!=33316)
847                //can't possibly be a raw data file
848                Close refnum
849                return(0)               //not a raw SANS file
850        Endif
851        FSetPos refNum,75
852        FReadLine/N=3 refNum,testStr
853        Close refNum
854       
855        if(cmpstr(testStr,"RAW")==0)
856                //true, is raw data file
857                Return(1)
858        else
859                //some other file
860                Return(0)
861        Endif
862End
863
864//list (input) is a list, typically returned from IndexedFile()
865//which is semicolon-delimited, and may contain filesnames from the VAX
866//that contain version numbers, where the version number appears as a separate list item
867//(and also as a non-existent file)
868//these numbers must be purged from the list, especially for display in a popup
869//or list processing of filenames
870//the function returns the list, cleaned of version numbers (up to 11)
871//raw data files will typically never have a version number other than 1.
872Function/S A_RemoveVersNumsFromList(list)
873        String list
874       
875        //get rid of version numbers first (up to 11)
876        Variable ii,num
877        String item
878        num = ItemsInList(list,";")
879        ii=1
880        do
881                item = num2str(ii)
882                list = RemoveFromList(item, list ,";" )
883                ii+=1
884        while(ii<12)
885       
886        return (list)
887End
888
889//Function attempts to find valid filename from partial name that has been stripped of
890//the VAX version number. The partial name is tried first
891//*** the PATH is hard-wired to catPathName (which is assumed to exist)
892//version numers up to ;10 are tried
893//only the "name;vers" is returned. the path is not prepended, hence the return string
894//is not a complete specification of the file
895//
896Function/S A_ValidFileString(partialName)
897        String partialName
898       
899        String tempName = "",msg=""
900        Variable ii,refnum
901       
902        ii=0
903        do
904                if(ii==0)
905                        //first pass, try the partialName
906                        tempName = partialName
907                        Open/Z/R/T="????TEXT"/P=catPathName refnum tempName     //Does open file (/Z flag)
908                        if(V_flag == 0)
909                                //file exists
910                                Close refnum            //YES needed,
911                                break
912                        endif
913                else
914                        tempName = partialName + ";" + num2str(ii)
915                        Open/Z/R/T="????TEXT"/P=catPathName refnum tempName
916                        if(V_flag == 0)
917                                //file exists
918                                Close refnum
919                                break
920                        endif
921                Endif
922                ii+=1
923                //print "ii=",ii
924        while(ii<11)
925        //go get the selected bits of information, using tempName, which exists
926        if(ii>=11)
927                //msg = partialName + " not found. is version number > 11?"
928                //DoAlert 0, msg
929                //PathInfo catPathName
930                //Print S_Path
931                Return ("")             //use null string as error condition
932        Endif
933       
934        Return (tempName)
935End
936
937//function to remove all spaces from names when searching for filenames
938//the filename (as saved) will never have interior spaces (TTTTTnnn_AB _Bnnn)
939//but the text field in the header WILL, if less than 3 characters were used for the
940//user's initials, and can have leading spaces if prefix was less than 5 characters
941//
942//returns a string identical to the original string, except with the interior spaces removed
943//
944Function/S A_RemoveAllSpaces(str)
945        String str
946       
947        String tempstr = str
948        Variable ii,spc,len             //should never be more than 2 or 3 trailing spaces in a filename
949        ii=0
950        do
951                len = strlen(tempStr)
952                spc = strsearch(tempStr," ",0)          //is the last character a space?
953                if (spc == -1)
954                        break           //no more spaces found, get out
955                endif
956                str = tempstr
957                tempStr = str[0,(spc-1)] + str[(spc+1),(len-1)] //remove the space from the string
958        While(1)        //should never be more than 2 or 3
959       
960        If(strlen(tempStr) < 1)
961                tempStr = ""            //be sure to return a null string if problem found
962        Endif
963       
964        //Print strlen(tempstr)
965       
966        Return(tempStr)
967               
968End
969
970//AJJ Oct 2008
971//Moved from GaussUtils - makes more sense to have it here
972
973// utility used in the "PlotSmeared...() macros to get a list of data folders
974//
975//1:    Waves.
976//2:    Numeric variables.
977//3:    String variables.
978//4:    Data folders.
979Function/S GetAList(type)
980        Variable type
981       
982        SetDataFolder root:
983       
984        String objName,str=""
985        Variable index = 0
986        do
987                objName = GetIndexedObjName(":", type, index)
988                if (strlen(objName) == 0)
989                        break
990                endif
991                //Print objName
992                str += objName + ";"
993                index += 1
994        while(1)
995       
996        // remove myGlobals, Packages, etc. from the folder list
997        if(type==4)
998                str = RemoveFromList("myGlobals", str , ";" )
999                str = RemoveFromList("Packages", str, ";")
1000                str = RemoveFromList("AutoFit", str, ";")
1001                str = RemoveFromList("TISANE", str, ";")
1002                str = RemoveFromList("HayPenMSA", str, ";")
1003                str = RemoveFromList("SAS", str, ";")                   //from Irena
1004                str = RemoveFromList("USAXS", str, ";")
1005                str = RemoveFromList("RAW;SAM;EMP;BGD;DIV;MSK;ABS;CAL;COR;STO;SUB;DRK;SAS;", str  ,";")                 //root level folders present in old reduction experiments
1006                str = RemoveFromList("ToTrim", str , ";" )              //from VSANS
1007        endif
1008       
1009        return(str)
1010End
1011
1012
1013//returns the path to the file, or null if cancel
1014//
1015// either the T="????" or the /F flags work to set the filter to "all files"
1016// but the T is essentially obsolete, /F is new for Igor 6.1 and recommended
1017Function/S DoOpenFileDialog(msg)
1018        String msg
1019       
1020        Variable refNum
1021//      String message = "Select a file"
1022        String outputPath
1023       
1024        String fileFilters = "All Files:.*;"
1025               
1026//      Open/D/R/T="????"/M=msg refNum
1027        Open/D/R/F=fileFilters/M=msg refNum
1028        outputPath = S_fileName
1029       
1030        return outputPath
1031End
1032
1033// returns the path to the file, or null if the user cancelled
1034// fancy use of optional parameters
1035//
1036// enforce short file names (25 characters)
1037Function/S DoSaveFileDialog(msg,[fname,suffix])
1038        String msg,fname,suffix
1039        Variable refNum
1040//      String message = "Save the file as"
1041
1042        if(ParamIsDefault(fname))
1043//              Print "fname not supplied"
1044                fname = ""
1045        endif
1046        if(ParamIsDefault(suffix))
1047//              Print "suffix not supplied"
1048                suffix = ""
1049        endif
1050       
1051        String outputPath,tmpName,testStr
1052        Variable badLength=0,maxLength=25,l1,l2
1053       
1054       
1055        tmpName = fname + suffix
1056       
1057        do
1058                badLength=0
1059                Open/D/M=msg/T="????" refNum as tmpName         //OS will allow 255 characters, but then I can't read it back in!
1060                outputPath = S_fileName
1061               
1062                testStr = ParseFilePath(0, outputPath, ":", 1, 0)               //just the filename
1063                if(strlen(testStr)==0)
1064                        break           //cancel, allow exit
1065                endif
1066                if(strlen(testStr) > maxLength)
1067                        badlength = 1
1068                        DoAlert 2,"File name is too long. Is\r"+testStr[0,maxLength-1]+"\rOK?"
1069                        if(V_flag==3)
1070                                outputPath = ""
1071                                break
1072                        endif
1073                        if(V_flag==1)                   //my suggested name is OK, so trim the output
1074                                badlength=0
1075                                l1 = strlen(testStr)            //too long length
1076                                l1 = l1-maxLength               //number to trim
1077                                //Print outputPath
1078                                l2=strlen(outputPath)
1079                                outputPath = outputPath[0,l2-1-l1]
1080                                //Print "modified  ",outputPath
1081                        endif
1082                        //if(V_flag==2)  do nothing, let it go around again
1083                endif
1084               
1085        while(badLength)
1086       
1087        return outputPath
1088End
1089
1090// returns a shortened file name (26 characters max) so that the loader
1091// won't try to create Igor objects that have names that are longer than 31
1092//
1093Function/S ShortFileNameString(inStr)
1094        String inStr
1095
1096        String outStr=""
1097        Variable maxLength=25
1098        Variable nameTooLong=0
1099        String/G root:Packages:NIST:gShortNameStr = inStr[0,maxLength-1]
1100        SVAR newStr = root:Packages:NIST:gShortNameStr
1101
1102        if(strlen(inStr) <= maxLength)
1103                return (inStr)          //length OK
1104        else
1105                do
1106                        nameTooLong = 0
1107                       
1108                        DoAlert 1,"File name is too long. Is\r"+inStr[0,maxLength-1]+"\rOK?"
1109                        if(V_flag==1)                   //my suggested name is OK, so trim the output
1110                                outStr = inStr[0,maxLength-1]
1111                                //Print "modified  ",outStr
1112                                newStr=outStr
1113                                return(outStr)
1114                        endif
1115       
1116       
1117                        if(V_flag == 2)         //not OK, do something about it
1118                               
1119                                DoWindow/F ShorterNameInput             //it really shouldn't exist...
1120                                if(V_flag==0)
1121                               
1122                                        NewPanel /W=(166,90,666,230) as "Enter a Shorter Name"
1123                                        DoWindow/C ShorterNameInput
1124                                        SetDrawLayer UserBack
1125                                        TitleBox title0,pos={35,8},size={261,20},title=" Enter a shorter file name. It must be 25 characters or less "
1126                                        TitleBox title0,fSize=12,fStyle=1
1127                                        SetVariable setvar0,pos={21,52},size={300,15},title="New name",value= _STR:newStr
1128                                        SetVariable setvar0,proc=ShorterNameSetVarProc,fsize=12
1129                                        SetVariable setvar0 valueBackColor=(65535,49151,49151)
1130                                        Button button0,pos={259,87},size={60,20},title="Done"
1131                                        Button button0,proc=ShorterNameDoneButtonProc
1132                               
1133                                endif
1134                               
1135                                PauseForUser ShorterNameInput
1136                               
1137                                // this really should force a good name, but there could be errors that I'm not catching
1138//                              Print newStr, strlen(newStr)
1139                                nameTooLong = 0
1140                        endif
1141               
1142                while (nameTooLong)
1143               
1144                return(newStr)
1145               
1146        endif
1147               
1148End
1149
1150
1151// for the ShortFileNameString() - PauseForUser to get a shorter file name
1152Function ShorterNameSetVarProc(sva) : SetVariableControl
1153        STRUCT WMSetVariableAction &sva
1154               
1155        switch( sva.eventCode )
1156                case 1: // mouse up
1157                case 2: // Enter key
1158                case 3: // Live update
1159                                String sv = sva.sval
1160                                if( strlen(sv) > 25 )
1161                                        sv= sv[0,24]
1162                                        SetVariable  $(sva.ctrlName),win=$(sva.win),value=_STR:sv
1163                                        SetVariable setvar0 valueBackColor=(65535,49151,49151)
1164                                        Beep
1165                                else
1166                                        SetVariable setvar0 valueBackColor=(65535,65535,65535)
1167                                endif
1168                                break
1169                endswitch
1170        return 0
1171End
1172
1173// for the ShortFileNameString() - PauseForUser to get a shorter file name
1174Function ShorterNameDoneButtonProc(ba) : ButtonControl
1175        STRUCT WMButtonAction &ba
1176       
1177        String win = ba.win
1178
1179        switch (ba.eventCode)
1180                case 2:
1181                        SVAR newStr = root:Packages:NIST:gShortNameStr
1182                        ControlInfo setvar0
1183                        newStr = S_value
1184                        DoWindow/K ShorterNameInput
1185                       
1186                        break
1187        endswitch
1188
1189        return 0
1190End
1191
1192
1193// a function common to many panels, so put the basic version here that simply
1194// returns null string if no functions are present. Calling procedures can
1195// add to the list to customize as needed.
1196// show the available models
1197// not the f*(cw,xw) point calculations
1198// not the *X(cw,xw) XOPS
1199//
1200// KIND:10 should show only user-defined curve fitting functions
1201// - not XOPs
1202// - not other user-defined functions
1203Function/S User_FunctionPopupList()
1204        String list,tmp
1205        list = FunctionList("*",";","KIND:10")          //get every user defined curve fit function
1206
1207        //now start to remove everything the user doesn't need to see...
1208
1209        tmp = FunctionList("*_proto",";","KIND:10")             //prototypes
1210        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1211
1212
1213        //prototypes that show up if GF is loaded
1214        list = RemoveFromList("GFFitFuncTemplate", list)
1215        list = RemoveFromList("GFFitAllAtOnceTemplate", list)
1216        list = RemoveFromList("NewGlblFitFunc", list)
1217        list = RemoveFromList("NewGlblFitFuncAllAtOnce", list)
1218        list = RemoveFromList("GlobalFitFunc", list)
1219        list = RemoveFromList("GlobalFitAllAtOnce", list)
1220        list = RemoveFromList("GFFitAAOStructTemplate", list)
1221        list = RemoveFromList("NewGF_SetXWaveInList", list)
1222        list = RemoveFromList("NewGlblFitFuncAAOStruct", list)
1223       
1224        // more to remove as a result of 2D/Gizmo
1225        list = RemoveFromList("A_WMRunLessThanDelta", list)
1226        list = RemoveFromList("WMFindNaNValue", list)
1227        list = RemoveFromList("WM_Make3DBarChartParametricWave", list)
1228        list = RemoveFromList("UpdateQxQy2Mat", list)
1229        list = RemoveFromList("MakeBSMask", list)
1230       
1231        // MOTOFIT/GenFit bits
1232        tmp = "GEN_allatoncefitfunc;GEN_fitfunc;GetCheckBoxesState;MOTO_GFFitAllAtOnceTemplate;MOTO_GFFitFuncTemplate;MOTO_NewGF_SetXWaveInList;MOTO_NewGlblFitFunc;MOTO_NewGlblFitFuncAllAtOnce;GeneticFit_UnSmearedModel;GeneticFit_SmearedModel;"
1233        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1234
1235        // SANS Reduction bits
1236        tmp = "ASStandardFunction;Ann_1D_Graph;Avg_1D_Graph;BStandardFunction;CStandardFunction;Draw_Plot1D;MyMat2XYZ;"
1237        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1238        tmp = "NewDirection;SANSModelAAO_MCproto;Monte_SANS_Threaded;Monte_SANS_NotThreaded;Monte_SANS_W1;Monte_SANS_W2;Monte_SANS_W3;Monte_SANS_W4;Monte_SANS;FractionReachingDetector;TwoLevel_EC;SmearedTwoLevel_EC;"
1239        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1240
1241
1242        // USANS Reduction bits
1243        tmp = "DSM_Guinier_Fit;RemoveMaskedPoints;"
1244        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1245
1246        //more functions from analysis models (2008)
1247        tmp = "Barbell_Inner;Barbell_Outer;Barbell_integrand;BCC_Integrand;Integrand_BCC_Inner;Integrand_BCC_Outer;"
1248        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1249        tmp = "CapCyl;CapCyl_Inner;CapCyl_Outer;ConvLens;ConvLens_Inner;ConvLens_Outer;"
1250        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1251        tmp = "Dumb;Dumb_Inner;Dumb_Outer;FCC_Integrand;Integrand_FCC_Inner;Integrand_FCC_Outer;"
1252        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1253        tmp = "Integrand_SC_Inner;Integrand_SC_Outer;SC_Integrand;SphCyl;SphCyl_Inner;SphCyl_Outer;"
1254        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1255        tmp = "CSPP_Outer;CSPP_Inner;PP_Outer;PP_Inner;"
1256        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1257        tmp = "Guinier_Fit;"
1258        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1259
1260        tmp = FunctionList("f*",";","NPARAMS:2")                //point calculations
1261        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1262       
1263        tmp = FunctionList("fSmear*",";","NPARAMS:3")           //smeared dependency calculations
1264        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1265       
1266        // anything that might be included in Irena
1267        tmp = FunctionList("GEN_*",";","KIND:10")
1268        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1269        tmp = FunctionList("IN2G_*",";","KIND:10")
1270        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1271        tmp = FunctionList("IR1A_*",";","KIND:10")
1272        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1273        tmp = FunctionList("IR1B_*",";","KIND:10")
1274        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1275        tmp = FunctionList("IR1U_*",";","KIND:10")
1276        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1277        tmp = FunctionList("IR1V_*",";","KIND:10")
1278        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1279        tmp = FunctionList("IR1_*",";","KIND:10")
1280        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1281        tmp = FunctionList("IR2D_*",";","KIND:10")
1282        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1283
1284        tmp = FunctionList("IR2D_*",";","KIND:10")
1285        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1286        tmp = FunctionList("IR2H_*",";","KIND:10")
1287        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";") 
1288        tmp = FunctionList("IR2L_*",";","KIND:10")
1289        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1290        tmp = FunctionList("IR2Pr_*",";","KIND:10")
1291        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1292        tmp = FunctionList("IR2R_*",";","KIND:10")
1293        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1294        tmp = FunctionList("IR2S_*",";","KIND:10")
1295        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1296        tmp = FunctionList("IR2_*",";","KIND:10")
1297        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1298        tmp = FunctionList("*LogLog",";","KIND:10")
1299        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1300       
1301        //functions included in Nika
1302        tmp = FunctionList("NI1*",";","KIND:10")
1303        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1304        tmp = FunctionList("TransAx_*",";","KIND:10")
1305        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1306        tmp = FunctionList("TransformAxis*",";","KIND:10")
1307        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1308        tmp = FunctionList("erfForNormal*",";","KIND:10")
1309        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1310
1311        // functions in Indra (USAXS)
1312        tmp = FunctionList("IN2Q_*",";","KIND:10")
1313        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1314        tmp = FunctionList("IN3_*",";","KIND:10")
1315        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1316       
1317//      tmp = FunctionList("*X",";","KIND:4")           //XOPs, but these shouldn't show up if KIND:10 is used initially
1318//      Print "X* = ",tmp
1319//      print " "
1320//      list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1321       
1322        //non-fit functions that I can't seem to filter out
1323        list = RemoveFromList("BinaryHS_PSF11;BinaryHS_PSF12;BinaryHS_PSF22;EllipCyl_Integrand;PP_Inner;PP_Outer;Phi_EC;TaE_Inner;TaE_Outer;",list,";")
1324
1325        // from 2010 model functions
1326        list = RemoveFromList("fTwoYukawa;DoBoxGraph;Gauss2D_theta;",list,";")
1327       
1328        // from Debye Sphere method
1329        list = RemoveFromList("CalcIQRfromMat;ConnectPoints2D;ConnectPoints3D;ConnectPoints3D_old;ConnectedRodFill;ConvertXYZto3N;CylindersAtPoints;",list,";")
1330        list = RemoveFromList("FillSphere;FillSphere3;FillSphereRadius;FillSphereRadiusNoOverlap;FillXCylinder;FillXYCircle;FillXZCircle;FillYCylinder;",list,";")
1331        list = RemoveFromList("FillYZCircle;FillZCylinder;PadMatrix;RandomFill3DMat;RandomPoints2D;SobolFill3DMat;SphereAtEachPoint;UnConnectedRodFill;XYZV_toByteVoxels;",list,";")
1332        list = RemoveFromList("MakeTriplet;SobolPoints2D;X_CylindersAtPoints;X_CylindersHexagonalGrid;X_CylindersSquareGrid;maxDistance_Threaded;KR_MultiCylinder;KR_MultiCylinder_Units;",list,";")
1333        list = RemoveFromList("X_CoreShellCylinderHexGrid;FillPlaneHexagonal;FillPlaneSquareGrid;FillSphereRadiusPeriodic;",list,";")
1334        list = RemoveFromList("Setup_Ur;M_energy;DoRotation;Copy_xyz_to_xyz3d;MultiCyl_Loop;",list,";")
1335
1336// from Polarization
1337        list = RemoveFromList("ParseDecayRow;ParseFlipperRow;",list,";")
1338
1339// from 2012 models
1340        list = RemoveFromList("cng_integ;",list,";")
1341
1342// from 2012 Event Mode Processing
1343        list = RemoveFromList("CleanupTimes;IndexForHistogram;JointHistogram;MakeFibonacciWave;Osc_ProcessEvents;SetFibonacciBins;SetLinearBins;SetLogBins;Stream_ProcessEvents;",list,";")
1344
1345// from 2013 Simulation
1346//      list = RemoveFromList("EC_Empirical;SmearedEC_Empirical;",list,";")
1347        list = RemoveFromList("SAS_XS_Sphere;Generate_UofR;Setup_Ur_HS;",list,";")
1348
1349
1350// from 2014 Automation of reduction
1351        list = RemoveFromList("DoAnnulusGraph;DoArcGraph;",list,";")
1352       
1353// from 2017-2018 VSANS reduction
1354        tmp = FunctionList("V_*",";","KIND:10")
1355        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1356        list = RemoveFromList("V_BroadPeak_Pix2D;V_BroadPeak_Pix2D_noThread;V_CleanupTimes;V_I_BroadPeak_Pix2D;V_IndexForHistogram;V_MakeFibonacciWave;V_UpdatePix2Mat;",list,";")
1357
1358        tmp = FunctionList("*X_",";","KIND:10")         // dummy functions with "X_" at the end, for vsans (2018)
1359        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1360       
1361        list = RemoveFromList("Integrate_BuiltIn;intgrnd;xJointHistogram;",list,";")
1362
1363                               
1364        list = SortList(list)
1365        return(list)
1366End
1367
1368
1369///////////////////////////////////////////////////
1370// old SANSPreferences have been moved here to a common place and renamed to "NCNR Preferences" so that they
1371// are common to all of the packages (and will appear on all of the menus)
1372//
1373// globals moved to root:Packages:NIST: since this is generated by all packages.
1374//
1375///////////////////////////
1376// user preferences
1377//
1378// globals are created in initialize.ipf
1379//
1380// this panel allows for user modification
1381///////////////////////////
1382Proc Show_Preferences_Panel()
1383
1384        DoWindow/F Pref_Panel
1385        if(V_flag==0)
1386                // only re-initialize if the variables don't exist, so you don't overwrite what users have changed
1387                if( exists("root:Packages:NIST:gASCII_Write") != 2 || exists("root:Packages:NIST:gXML_Write") != 2 || exists("root:Packages:NIST:gNXcanSAS_Write") != 2)                //if the global variable does not exist, initialize
1388                        Initialize_Preferences()
1389                endif
1390                Pref_Panel()
1391        Endif
1392//      Print "Preferences Panel stub"
1393End
1394
1395Proc Initialize_Preferences()
1396        // create the globals here if they are not already present
1397       
1398        // each package initialization should call this to repeat the initialization
1399        // without overwriting what was already set
1400       
1401        Variable val
1402       
1403        ///// items for SANS reduction
1404        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault", 1 )
1405        Variable/G root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault=val
1406       
1407        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gAllowDRK", 0 )
1408        Variable/G root:Packages:NIST:gAllowDRK=val                     //don't show DRK as default
1409       
1410        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoTransCheck", 1 )
1411        Variable/G root:Packages:NIST:gDoTransCheck=val
1412       
1413        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gBinWidth", 1 )
1414        Variable/G root:Packages:NIST:gBinWidth=val
1415       
1416        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gNPhiSteps", 72 )
1417        Variable/G root:Packages:NIST:gNPhiSteps=val
1418       
1419        // flags to turn detector corrections on/off for testing (you should leave these ON)
1420        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr", 1 )
1421        Variable/G root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr = 1
1422       
1423        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr", 1 )
1424        Variable/G root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr = 1
1425
1426// flag to allow adding raw data files with different attenuation (normally not done)   
1427        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten",0)
1428        Variable/G root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten=val
1429       
1430        /// items for SANS Analysis
1431       
1432       
1433        /// items for USANS Reduction
1434// is the data file from NICE and in terms of QValues rather than angle
1435        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues", 1 )
1436        Variable/G root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues=val   
1437       
1438        /// items for everyone
1439        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gASCII_Write", 1 )
1440        if (val == 1)
1441                WritePref("PrefCtrl_0",1)
1442        endif
1443        Variable/G root:Packages:NIST:gASCII_Write = val
1444        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gXML_Write", 0 )
1445        if (val == 1)
1446                WritePref("PrefCtrl_0a",1)
1447        endif
1448        Variable/G root:Packages:NIST:gXML_Write = val
1449        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gNXcanSAS_Write", 0 )
1450        if (val == 1)
1451                WritePref("PrefCtrl_0b",1)
1452        endif
1453        Variable/G root:Packages:NIST:gNXcanSAS_Write = val
1454       
1455end
1456
1457Function LogScalePrefCheck(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1458        String ctrlName
1459        Variable checked
1460       
1461        NVAR gLog = root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault
1462        glog=checked
1463        //print "log pref checked = ",checked
1464End
1465
1466Function DRKProtocolPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1467        String ctrlName
1468        Variable checked
1469       
1470        NVAR gDRK = root:Packages:NIST:gAllowDRK
1471        gDRK = checked
1472        //Print "DRK preference = ",checked
1473End
1474
1475Function UnityTransPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1476        String ctrlName
1477        Variable checked
1478       
1479        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoTransCheck
1480        gVal = checked
1481End
1482
1483Function WritePref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1484        String ctrlName
1485        Variable checked
1486       
1487        NVAR asciiVal = root:Packages:NIST:gASCII_Write
1488        NVAR xmlVal = root:Packages:NIST:gXML_Write
1489        NVAR nxVal = root:Packages:NIST:gNXcanSAS_Write
1490       
1491        strswitch (ctrlName)
1492                case "PrefCtrl_0":
1493                        CheckBox PrefCtrl_0,value=1
1494                        asciiVal = checked
1495                        CheckBox PrefCtrl_0a,value=0
1496                        xmlVal = 0
1497                        CheckBox PrefCtrl_0b,value=0
1498                        nxVal = 0
1499                        break
1500                case "PrefCtrl_0a":
1501                        CheckBox PrefCtrl_0,value=0
1502                        asciiVal = 0
1503                        CheckBox PrefCtrl_0a,value=1
1504                        xmlVal = checked
1505                        CheckBox PrefCtrl_0b,value=0
1506                        nxVal = 0
1507                        break
1508                case "PrefCtrl_0b":
1509                        CheckBox PrefCtrl_0,value=0
1510                        asciiVal = 0
1511                        CheckBox PrefCtrl_0a,value=0
1512                        xmlVal = 0
1513                        CheckBox PrefCtrl_0b,value=1
1514                        nxVal = checked
1515        endswitch
1516End
1517
1518Function DoTransCorrPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1519        String ctrlName
1520        Variable checked
1521       
1522        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr
1523        gVal = checked
1524End
1525
1526Function DoEfficiencyCorrPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1527        String ctrlName
1528        Variable checked
1529       
1530        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr
1531        gVal = checked
1532End
1533
1534Function DoRawAttenAdjPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1535        String ctrlName
1536        Variable checked
1537       
1538        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten
1539        gVal = checked
1540End
1541
1542//set the angle->Q conversion factor
1543// or set the Q->Q "conversion" factor
1544// this is the same value that is set in Init_USANS_Facility()
1545// Mar 2019
1546Function RawUSANSisQPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1547        String ctrlName
1548        Variable checked
1549       
1550        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues
1551        gVal = checked
1552       
1553        if(checked == 1)
1554                Variable/G root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:deg2QConv = 1             //so that the q-values are unchanged
1555        else
1556                Variable/G root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:deg2QConv=5.55e-5         //JGB -- 2/24/01
1557        endif
1558End
1559
1560
1561
1562Function PrefDoneButtonProc(ctrlName) : ButtonControl
1563        String ctrlName
1564       
1565        DoWindow/K pref_panel
1566End
1567
1568Proc Pref_Panel()
1569        PauseUpdate; Silent 1           // building window...
1570        NewPanel /W=(646,208,1070,468)/K=2 as "NCNR Preference Panel"
1571        DoWindow/C pref_panel
1572        ModifyPanel cbRGB=(49694,61514,27679)
1573        SetDrawLayer UserBack
1574        ModifyPanel fixedSize=1
1575//////
1576//on main portion of panel, always visible
1577        Button PrefPanelButtonA,pos={354,12},size={50,20},proc=PrefDoneButtonProc,title="Done"
1578
1579        TabControl PrefTab,pos={7,49},size={410,202},tabLabel(0)="General",proc=PrefTabProc
1580        TabControl PrefTab,tabLabel(1)="SANS",tabLabel(2)="USANS",tabLabel(3)="Analysis"
1581        TabControl PrefTab,value=0
1582        TabControl PrefTab labelBack=(49694,61514,27679)
1583       
1584//on tab(0) - General - initially visible
1585        CheckBox PrefCtrl_0,pos={21,100},size={124,14},proc=WritePref,title="Use ASCII 6-column Output (default)",mode=1
1586        CheckBox PrefCtrl_0,help={"Checking this will set the default output to the NIST 6 column format"}
1587        CheckBox PrefCtrl_0,value= root:Packages:NIST:gASCII_Write
1588        CheckBox PrefCtrl_0a,pos={21,120},size={124,14},proc=WritePref,title="Use canSAS XML Output",mode=1
1589        CheckBox PrefCtrl_0a,help={"Checking this will set the default output to be canSAS XML format"}
1590        CheckBox PrefCtrl_0a,value= root:Packages:NIST:gXML_Write
1591        CheckBox PrefCtrl_0b,pos={21,140},size={124,14},proc=WritePref,title="Use NXcanSAS HDF5 Output",mode=1
1592        CheckBox PrefCtrl_0b,help={"Checking this will set the default output to be NXcanSAS HDF5 format"}
1593        CheckBox PrefCtrl_0b,value= root:Packages:NIST:gNXcanSAS_Write
1594
1595//on tab(1) - SANS
1596        CheckBox PrefCtrl_1a,pos={21,100},size={171,14},proc=LogScalePrefCheck,title="Use Log scaling for 2D data display"
1597        CheckBox PrefCtrl_1a,help={"Checking this will display 2D SANS data with a logarithmic color scale of neutron counts. If not checked, the color mapping will be linear."}
1598        CheckBox PrefCtrl_1a,value= root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault
1599        CheckBox PrefCtrl_1b,pos={21,120},size={163,14},proc=DRKProtocolPref,title="Allow DRK correction in protocols"
1600        CheckBox PrefCtrl_1b,help={"Checking this will allow DRK correction to be used in reduction protocols. You will need to re-draw the protocol panel for this change to be visible."}
1601        CheckBox PrefCtrl_1b,value= root:Packages:NIST:gAllowDRK
1602        CheckBox PrefCtrl_1c,pos={21,140},size={137,14},proc=UnityTransPref,title="Check for Transmission = 1"
1603        CheckBox PrefCtrl_1c,help={"Checking this will check for SAM or EMP Trans = 1 during data correction"}
1604        CheckBox PrefCtrl_1c,value= root:Packages:NIST:gDoTransCheck
1605        SetVariable PrefCtrl_1d,pos={21,170},size={200,15},title="Averaging Bin Width (pixels)"
1606        SetVariable PrefCtrl_1d,limits={1,100,1},value= root:Packages:NIST:gBinWidth
1607        SetVariable PrefCtrl_1e,pos={21,195},size={200,15},title="# Phi Steps (annular avg)"
1608        SetVariable PrefCtrl_1e,limits={1,360,1},value= root:Packages:NIST:gNPhiSteps
1609        CheckBox PrefCtrl_1f title="Do Transmssion Correction?",size={140,14},value=root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr,proc=DoTransCorrPref
1610        CheckBox PrefCtrl_1f pos={255,100},help={"TURN OFF ONLY FOR DEBUGGING. This corrects the data for angle dependent transmssion."}
1611        CheckBox PrefCtrl_1g title="Do Efficiency Correction?",size={140,14},proc=DoEfficiencyCorrPref
1612        CheckBox PrefCtrl_1g value=root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr,pos={255,120},help={"TURN OFF ONLY FOR DEBUGGING. This corrects the data for angle dependent detector efficiency."}
1613        CheckBox PrefCtrl_1h title="Adjust RAW attenuation?",size={140,14},proc=DoRawAttenAdjPref
1614        CheckBox PrefCtrl_1h value=root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten,pos={255,140},help={"This is normally not done"}
1615
1616        CheckBox PrefCtrl_1a,disable=1
1617        CheckBox PrefCtrl_1b,disable=1
1618        CheckBox PrefCtrl_1c,disable=1
1619        SetVariable PrefCtrl_1d,disable=1
1620        SetVariable PrefCtrl_1e,disable=1
1621        CheckBox PrefCtrl_1f,disable=1
1622        CheckBox PrefCtrl_1g,disable=1
1623        CheckBox PrefCtrl_1h,disable=1
1624
1625//on tab(2) - USANS
1626//      GroupBox PrefCtrl_2a pos={21,100},size={1,1},title="nothing to set",fSize=12
1627//      GroupBox PrefCtrl_2a,disable=1
1628        CheckBox PrefCtrl_2a,pos={21,100},size={171,14},proc=RawUSANSisQPref,title="Raw USANS Data is Q-values"
1629        CheckBox PrefCtrl_2a,help={"Check this if raw data was collected using NICE (q-values). If data was collected using ICP (angle), leave this unchecked."}
1630        CheckBox PrefCtrl_2a,value= root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues
1631
1632
1633        CheckBox PrefCtrl_2a,disable=1
1634
1635
1636
1637//on tab(3) - Analysis
1638        GroupBox PrefCtrl_3a pos={21,100},size={1,1},title="nothing to set",fSize=12
1639       
1640        GroupBox PrefCtrl_3a,disable=1
1641
1642EndMacro
1643
1644// function to control the drawing of controls in the TabControl on the main panel
1645// Naming scheme for the controls MUST be strictly adhered to... else controls will
1646// appear in odd places...
1647// all controls are named PrefCtrl_NA where N is the tab number and A is the letter denoting
1648// the controls position on that particular tab.
1649// in this way, they will always be drawn correctly..
1650//
1651Function PrefTabProc(name,tab)
1652        String name
1653        Variable tab
1654       
1655//      Print "name,number",name,tab
1656        String ctrlList = ControlNameList("",";"),item="",nameStr=""
1657        Variable num = ItemsinList(ctrlList,";"),ii,onTab
1658        for(ii=0;ii<num;ii+=1)
1659                //items all start w/"PrefCtrl_", 9 characters
1660                item=StringFromList(ii, ctrlList ,";")
1661                nameStr=item[0,8]
1662                if(cmpstr(nameStr,"PrefCtrl_")==0)
1663                        onTab = str2num(item[9])                        //[9] is a number
1664                        ControlInfo $item
1665                        switch(abs(V_flag))     
1666                                case 1:
1667                                        Button $item,disable=(tab!=onTab)
1668                                        break
1669                                case 2:
1670                                        CheckBox $item,disable=(tab!=onTab)
1671                                        break
1672                                case 5:
1673                                        SetVariable $item,disable=(tab!=onTab)
1674                                        break
1675                                case 10:       
1676                                        TitleBox $item,disable=(tab!=onTab)
1677                                        break
1678                                case 4:
1679                                        ValDisplay $item,disable=(tab!=onTab)
1680                                        break
1681                                case 9:
1682                                        GroupBox $item,disable=(tab!=onTab)
1683                                        break
1684                                // add more items to the switch if different control types are used
1685                        endswitch
1686                endif
1687        endfor
1688        return(0)
1689End
1690
1691
1692
1693
1694
1695
1696
1697////////////////////////////////////
1698// Modification from Matt Wasbrough to allow rescaling of the
1699// axes while plotting and fitting. allows export of the rescaled
1700// data and of the rescaled model
1701// Nov 2012
1702///
1703
1704Function UseRescaleAxisCheckProc(cba) : CheckBoxControl
1705        STRUCT WMCheckboxAction &cba
1706
1707        switch( cba.eventCode )
1708                case 2: // mouse up
1709                        Variable checked = cba.checked
1710                        if(checked)
1711                                Execute "OpenAxisPanel()"
1712                        else
1713                                if(exists("RescaleAxisPanel") !=0)
1714                                        DoWindow/K RescaleAxisPanel
1715                                endif
1716                        endif
1717                        break
1718        endswitch
1719
1720        return 0
1721End
1722
1723Proc OpenAxisPanel()
1724        If(WinType("RescaleAxisPanel") == 0)
1725                //create the necessary data folder
1726                NewDataFolder/O root:Packages
1727                NewDataFolder/O root:Packages:NIST
1728                NewDataFolder/O root:Packages:NIST:RescaleAxis
1729                //initialize the values
1730                Variable/G root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA = 1
1731                Variable/G root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB = 1
1732                Variable/G root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC = 1
1733                RescaleAxisPanel()
1734        else
1735                //window already exists, just bring to front for update
1736                DoWindow/F RescaleAxisPanel
1737        endif
1738End
1739
1740Window RescaleAxisPanel()
1741        PauseUpdate; Silent 1           // building window...
1742        NewPanel /W=(461,46,735,195)/K=1
1743        ModifyPanel cbRGB=(49360,30954,64507), fixedSize=1
1744        SetDrawLayer UserBack
1745        PopupMenu ymodel,pos={20,10},size={76,19},title="y-axis"
1746        PopupMenu ymodel,help={"This popup selects how the y-axis will be linearized based on the chosen data"}
1747        PopupMenu ymodel,mode=1,value= #"\"I;log(I);ln(I);1/I;I^a;Iq^a;I^a q^b;1/sqrt(I);ln(Iq);ln(Iq^2)\""
1748        Button GoRescale,pos={50,80},size={70,20},proc=RescalePlot,title="Rescale"
1749        Button GoRescale,help={"This button will rescale the axis using the selections in this panel"}
1750        Button DoneButton,pos={170,80},size={70,20},proc=RADoneButton,title="Done"
1751        Button DoneButton,help={"This button will close the panel"}
1752        Button ExportData, pos={100,110}, size={90,20}, proc=ExportData, title="Export Data"
1753        Button ExportData, help={"This button will export data from the top graph"}
1754        SetVariable expa,pos={13,45},size={80,17},title="pow \"a\""
1755        SetVariable expa,help={"This sets the exponent \"a\" for some y-axis formats. The value is ignored if the model does not use an adjustable exponent"}
1756        SetVariable expa,limits={-2,10,0},value= root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
1757        SetVariable expb,pos={98,45},size={80,17},title="pow \"b\""
1758        SetVariable expb,help={"This sets the exponent \"b\" for some x-axis formats. The value is ignored if the model does not use an adjustable exponent"}
1759        SetVariable expb,limits={0,10,0},value= root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
1760        PopupMenu xmodel,pos={155,10},size={79,19},title="x-axis"
1761        PopupMenu xmodel,help={"This popup selects how the x-axis will be linearized given the chosen data"}
1762        PopupMenu xmodel,mode=1,value= #"\"q;log(q);q^2;q^c\""
1763        SetVariable expc,pos={182,45},size={80,17},title="pow \"c\""
1764        SetVariable expc,help={"This sets the exponent \"c\" for some x-axis formats. The value is ignored if the model does not use \"c\" as an adjustable exponent"}
1765        SetVariable expc,limits={-10,10,0},value= root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
1766        Button RAHelp, pos={220,110}, size={20,20}, proc=RAHelpButtonProc, title="?"
1767EndMacro
1768
1769Proc RADoneButton(ctrlName): ButtonControl
1770        String ctrlName
1771        DoWindow/K RescaleAxisPanel
1772        DoWindow/F WrapperPanel
1773        CheckBox check_8 value=0
1774end
1775
1776Function RAHelpButtonProc(ba) : ButtonControl
1777        STRUCT WMButtonAction &ba
1778
1779        switch( ba.eventCode )
1780                case 2: // mouse up
1781                        // click code here
1782                        DisplayHelpTopic/Z/K=1 "Rescaled Axis"
1783                        if(V_flag !=0)
1784                                DoAlert 0,"The Rescaled Axis Help file could not be found"
1785                        endif
1786                        break
1787        endswitch
1788
1789        return 0
1790End
1791
1792Proc ExportData(ctrlName): ButtonControl
1793        string ctrlName
1794        WriteRescaledData()             
1795End
1796       
1797
1798Function RescalePlot (ctrlName): ButtonControl
1799        String ctrlName
1800        SetDataFolder root:
1801        String topGraph= WinName(0,1)   //this is the topmost graph
1802        if(strlen(topGraph)==0)
1803                Abort "There is no graph"
1804        endif
1805               
1806        DoWindow/F $topGraph
1807        GetWindow/Z $topGraph, wavelist
1808        wave/t W_Wavelist
1809        SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1810        if (exists("W_WaveList")==1)
1811                KillWaves/Z root:Packages:NIST:RescaleAxis:W_WaveList
1812        endif
1813        MoveWave root:W_WaveList, root:Packages:NIST:RescaleAxis:W_WaveList
1814        SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1815        variable i,j,k
1816        string DF,DF1,temp, temp2, t1
1817        for (i=0; i < numpnts(W_WaveList)/3; i+=1)
1818                temp = W_WaveList[i][1]
1819                if (stringmatch(temp, "*_i") || stringmatch(temp, "*_i_RA"))
1820                        temp = W_WaveList[i][0]
1821                        if(stringmatch(temp, "*_i"))
1822                                temp = removeending(temp, "_i")
1823                        elseif(stringmatch(temp, "*_i_RA"))
1824                                temp = removeending(temp, "_i_RA")
1825                        endif
1826                        Make/T/O $temp/Wave=tempWave
1827                        DF = ReplaceString(W_Wavelist[i][0],W_Wavelist[i][1],"")
1828                        if (strlen(DF) ==0)
1829                                DF = ":"
1830                        endif
1831                        DF1 = "root"+DF
1832                        tempWave[0] = DF1
1833                        k = 1
1834                        for(j=0;j<numpnts(W_WaveList)/3; j+=1)
1835                                if (stringmatch(W_WaveList[j][1], "*"+temp+"*"))
1836                                        tempWave[k] = W_WaveList[j][0]
1837                                        k  = k+1
1838                                endif
1839                        endfor
1840                        redimension/N=(k) tempWave
1841                elseif(stringmatch(temp, "*ywave*"))
1842                        temp = W_WaveList[i][0]
1843                        if(stringmatch(temp, "*_RA"))
1844                                temp = removeending(temp, "_RA")
1845                        endif                   
1846                        Make/T/O $temp/Wave=tempWave
1847                        DF = ReplaceString(W_Wavelist[i][0],W_Wavelist[i][1],"")
1848                        if (strlen(DF) ==0)
1849                                DF = ":"
1850                        endif
1851                        DF1 = "root"+DF
1852                        tempWave[0] = DF1
1853                        temp2 = replacestring("ywave", temp, "")
1854                        k = 1
1855                        for(j=0;j<numpnts(W_WaveList)/3; j+=1)
1856                                t1 = W_Wavelist[j][1]
1857                                if (stringmatch(W_WaveList[j][1], "*wave"+temp2+"*"))
1858                                        tempWave[k] = W_WaveList[j][1]
1859                                        k  = k+1
1860                                endif
1861                        endfor
1862                        redimension/N=(k) tempWave
1863                endif
1864        endfor
1865        KillWaves/Z W_Wavelist
1866        string listWave = Wavelist("*", ";", "TEXT:1")
1867        string WaveToRescale, WaveDataFolder,xwave, ywave, swave
1868       
1869        for (i = 0; i < ItemsInList(listWave,";"); i+=1)
1870                temp = StringFromList(i,listWave,";")
1871                Wave/T WaveString = $temp
1872                for (j=1; j < numpnts(WaveString); j+=1)
1873                         WaveToRescale = Wavestring[j]
1874                         if (stringmatch(WaveToRescale, "*_RA"))
1875                                WaveToRescale = RemoveEnding(WaveToRescale, "_RA")
1876                         endif
1877                WaveDataFolder = WaveString[0]
1878                SetDataFolder $WaveDataFolder
1879                if (stringmatch(WaveToRescale, "*_q"))
1880                xwave = WaveToRescale
1881                XRescale(xwave)
1882                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "*_i"))
1883                ywave = WaveToRescale
1884                xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i")+"_q"
1885                YRescale(ywave, xwave)
1886                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "*_s"))
1887                swave = WaveToRescale
1888                ywave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_s")+"_i"
1889                xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_s")+"_q"
1890                ERescale(swave, ywave, xwave)
1891                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "xwave_*"))
1892                xwave=WaveToRescale
1893                XRescale(xwave)
1894                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "ywave_*"))
1895                ywave = WaveToRescale
1896                xwave= ReplaceString("ywave", WaveToRescale, "xwave")
1897                YRescale(ywave, xwave)
1898                elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*_qvals"))
1899                xwave = WaveToRescale
1900                XRescale(xwave)
1901                elseif(stringmatch(WaveToRescale, "smeared*") && stringmatch(WaveToRescale, "!*_qvals"))
1902                ywave = WaveToRescale
1903                                for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1904                                        if (stringmatch(Wavestring[k], "*_qvals"))
1905                                                xwave = Wavestring[k]
1906                                        endif
1907                                endfor
1908                YRescale(ywave, xwave)
1909                else
1910                ywave = WaveToRescale
1911                        for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1912                                if (stringmatch(Wavestring[k], "*_q"))
1913                                        xwave = Wavestring[k]
1914                                endif
1915                        endfor
1916                YRescale(ywave,xwave)
1917                string yAxis = ywave+"_RA"
1918                wave yAxisWave = $yAxis
1919                SetFormula yAxisWave, "YRescale(ywave,xwave)"
1920                endif
1921                SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1922                endfor
1923        endfor
1924       
1925        string oldywave, xstr, ystr
1926        for (i = 0; i < ItemsInList(listWave,";"); i+=1)
1927                temp = StringFromList(i,listWave,";")
1928                Wave/T WaveString = $temp
1929                for (j=1; j < numpnts(WaveString); j+=1)
1930                         WaveToRescale = Wavestring[j]
1931                WaveDataFolder = WaveString[0]
1932                SetDataFolder $WaveDataFolder
1933                ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
1934                ystr = S_Value
1935                ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
1936                xstr = S_Value
1937                        if(cmpstr("I",ystr)==0 && cmpstr("q",xstr)==0)
1938                                if(stringmatch(WaveToRescale, "*_i_RA"))
1939                                        oldywave = WaveToRescale
1940                                        ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1941                                        xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i_RA")+"_q"
1942                                        replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1943                                        replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave
1944                                        swave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i_RA")+"_s"
1945                                        if(exists(swave)==1)
1946                                                ErrorBars/T=0/W=$topGraph $ywave, Y wave=($swave,$swave)       
1947                                        endif
1948                                elseif (stringmatch(WaveToRescale,  "smeared*"))
1949                                        if(stringmatch(WaveToRescale,"*_RA") && stringmatch(WaveToRescale,"!*_qvals*") )
1950                                                oldywave = WaveToRescale
1951                                                ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1952                                                xwave = "smeared_qvals"
1953                                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1954                                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave
1955                                        endif
1956                                elseif(stringmatch(WaveToRescale,"ywave*") && stringmatch(WaveToRescale,"*_RA"))
1957                                        oldywave = WaveToRescale
1958                                        ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1959                                        xwave = ReplaceString("ywave",ywave,"xwave")
1960                                        replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1961                                        replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave                                 
1962                                elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*FitYw*") && stringmatch(WaveToRescale, "*_RA"))
1963                                        oldywave = WaveToRescale
1964                                        ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1965                                        for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1966                                                if (stringmatch(Wavestring[k], "*_q"))
1967                                                        xwave = Wavestring[k]
1968                                                endif
1969                                        endfor
1970                                        replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1971                                        replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave 
1972                                endif                   
1973                        elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*_RA"))
1974                        elseif (stringmatch(WaveToRescale, "*_i"))
1975                                DoWindow/F topGraph
1976                                oldywave = WaveToRescale
1977                                xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i")+"_q_RA"
1978                                ywave = WaveToRescale + "_RA"
1979                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1980                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave
1981                                ModifyGraph log=0
1982                                swave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i")+"_s_RA"
1983                                if(exists(swave)==1)
1984                                        ErrorBars/T=0/W=$topGraph $ywave, Y wave=($swave,$swave)       
1985                                endif
1986                                DoUpdate       
1987                        elseif(stringmatch(WaveToRescale, "smeared*") && stringmatch(WaveToRescale, "!*_qvals"))
1988                                oldywave = WaveToRescale
1989                                ywave = WaveToRescale + "_RA"
1990                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1991                                xwave = "smeared_qvals_RA"
1992                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave 
1993                        elseif(stringmatch(WaveToRescale,"ywave*"))
1994                                oldywave = WaveToRescale
1995                                ywave = WaveToRescale + "_RA"
1996                                xwave = ReplaceString("ywave",ywave,"xwave")
1997                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1998                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave                                 
1999                        elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*FitYw*"))
2000                                oldywave = WaveToRescale
2001                                ywave = WaveToRescale+"_RA"
2002                                for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
2003                                        if (stringmatch(Wavestring[k], "*_q"))
2004                                                xwave = Wavestring[k]+"_RA"
2005                                        endif
2006                                endfor
2007                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
2008                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave 
2009                        endif
2010                        SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
2011                        DoUpdate
2012                endfor
2013        endfor
2014        KillWaves/A/Z
2015               
2016        string ylabel, xlabel
2017        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
2018        ystr = S_Value
2019        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2020        xstr = S_Value
2021       
2022        if(cmpstr("I",ystr)==0 && cmpstr("q",xstr)==0)
2023                modifygraph log=1
2024        else
2025                modifygraph log=0
2026        endif
2027       
2028        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2029        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2030        pow_a = V_value
2031        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2032        pow_b = V_value
2033        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2034        pow_c = V_value
2035       
2036        If (cmpstr("I",ystr) == 0)
2037                ylabel = "I(q)"
2038        elseif (cmpstr("ln(I)",ystr) == 0)
2039                ylabel = "ln(I)"
2040        elseif (cmpstr("log(I)",ystr) == 0)
2041                ylabel = "log(I)"
2042        elseif (cmpstr("1/I",ystr) == 0)
2043                ylabel = "1/I"
2044        elseif (cmpstr("I^a",ystr) == 0)
2045                ylabel = "I\S"+num2str(pow_a)+"\M"
2046        elseif (cmpstr("Iq^a",ystr) == 0)
2047                ylabel = "Iq\S"+num2str(pow_a)+"\M"
2048        elseif (cmpstr("I^a q^b",ystr) == 0)
2049                ylabel = "I\S"+num2str(pow_a)+"\Mq\S"+num2str(pow_b)+"\M"
2050        elseif (cmpstr("1/sqrt(I)",ystr) == 0)
2051                ylabel = "1/sqrt(I)"
2052        elseif (cmpstr("ln(Iq)",ystr) == 0)
2053                ylabel = "ln(Iq)"
2054        elseif (cmpstr("ln(Iq^2)",ystr) == 0)
2055                ylabel = "ln(Iq\S2\M)"
2056        endif
2057
2058        If (cmpstr("q",xstr) == 0)
2059                xlabel = "q (A\S-1\M)"
2060        elseif (cmpstr("q^2",xstr) == 0)
2061                xlabel = "q\S2\M"
2062        elseif (cmpstr("log(q)",xstr) == 0)
2063                xlabel = "log(q)"
2064        elseif (cmpstr("q^c",xstr) == 0)
2065                xlabel = "q\S"+num2str(pow_c)+"\M"
2066        endif
2067       
2068        SetAxis/A
2069        Label left ylabel
2070        Label bottom xlabel
2071       
2072        SetDataFolder root:
2073End
2074
2075Function YRescale(ywave, xwave)
2076        String ywave,xwave
2077 
2078        Wave yw = $ywave
2079        Wave xw = $xwave
2080       
2081        //Scaling exponents and background value
2082        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2083        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2084        pow_a = V_value
2085        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2086        pow_b = V_value
2087        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2088        pow_c = V_value
2089       
2090        //check for physical limits on exponent values
2091        // if bad values found, alert, and reset to good values so the rescaling can continue
2092        NVAR gA = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
2093        NVAR gB = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
2094        NVAR gC = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
2095        if((pow_a < -2) || (pow_a > 10))
2096                DoAlert 0,"Exponent a must be in the range (-2,10) - the exponent a has been reset to 1"
2097                gA = 1
2098        endif
2099        if((pow_b < 0) || (pow_b > 10))
2100                DoAlert 0,"Exponent b must be in the range (0,10) - the exponent b has been reset to 1"
2101                gB = 1
2102        endif
2103        //if q^c is the x-scaling, c must be be within limits and also non-zero
2104        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2105        If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2106                if(pow_c == 0)
2107                        DoAlert 0,"Exponent c must be non-zero, c has been reset to 1"
2108                        gC = 1
2109                endif
2110                if((pow_c < -10) || (pow_c > 10))
2111                        DoAlert 0,"Exponent c must be in the range (-10,10), c has been reset to 1"
2112                        gC = 1
2113                endif
2114        endif
2115       
2116        //variables set for each model to control look of graph
2117        String ystr, yAxis
2118        //check for proper y-scaling selection, make the necessary waves
2119//      Wave yAxisWave
2120
2121        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
2122        ystr = S_Value
2123       
2124        do
2125                If (cmpstr("I",S_Value) == 0)
2126                        yAxis = ywave+"_RA"
2127                        if (exists(yAxis)== 0)
2128                                Duplicate yw $yAxis
2129                        endif
2130                        SetScale d 0,0,"1/cm",$yAxis
2131                        wave yAxisWave = $yAxis
2132                        yAxisWave = yw
2133                        break   
2134                endif
2135                If (cmpstr("ln(I)",S_Value) == 0)
2136                        yAxis = ywave+"_RA"
2137                        if (exists(yAxis)== 0)
2138                                Duplicate yw $yAxis
2139                        endif
2140                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2141                        wave yAxisWave = $yAxis
2142                        yAxisWave = ln(yw)
2143                        break   
2144                endif
2145                If (cmpstr("log(I)",S_Value) == 0)
2146                        yAxis = ywave+"_RA"
2147                        if (exists(yAxis)== 0)
2148                                Duplicate yw $yAxis
2149                        endif
2150                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2151                        wave yAxisWave = $yAxis
2152                        yAxisWave = log(yw)
2153                        break   
2154                endif
2155                If (cmpstr("1/I",S_Value) == 0)
2156                        yAxis = ywave+"_RA"
2157                        if (exists(yAxis)== 0)
2158                                Duplicate yw $yAxis
2159                        endif
2160                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2161                        wave yAxisWave = $yAxis
2162                        yAxisWave = 1/(yw)
2163                        break
2164                endif
2165                If (cmpstr("I^a",S_Value) == 0)
2166                        yAxis = ywave+"_RA"
2167                        if (exists(yAxis)== 0)
2168                                Duplicate yw $yAxis
2169                        endif
2170                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2171                        wave yAxisWave = $yAxis
2172                        yAxisWave = yw^pow_a
2173                        break
2174                endif
2175                If (cmpstr("Iq^a",S_Value) == 0)
2176                        yAxis = ywave+"_RA"
2177                        if (exists(yAxis)== 0)
2178                                Duplicate yw $yAxis
2179                        endif
2180                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2181                        wave yAxisWave = $yAxis
2182                        yAxisWave = yw*xw^pow_a
2183                        break
2184                endif
2185                If (cmpstr("I^a q^b",S_Value) == 0)
2186                        yAxis = ywave+"_RA"
2187                        if (exists(yAxis)== 0)
2188                                Duplicate yw $yAxis
2189                        endif
2190                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2191                        wave yAxisWave = $yAxis
2192                        yAxisWave = yw^pow_a*xw^pow_b
2193                        break
2194                endif
2195                If (cmpstr("1/sqrt(I)",S_Value) == 0)
2196                        yAxis = ywave+"_RA"
2197                        if (exists(yAxis)== 0)
2198                                Duplicate yw $yAxis
2199                        endif
2200                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2201                        wave yAxisWave = $yAxis
2202                        yAxisWave = 1/sqrt(yw)
2203                        break
2204                endif
2205                If (cmpstr("ln(Iq)",S_Value) == 0)
2206                        yAxis = ywave+"_RA"
2207                        if (exists(yAxis)== 0)
2208                                Duplicate yw $yAxis
2209                        endif
2210                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2211                        wave yAxisWave = $yAxis
2212                        yAxisWave = ln(xw*yw)
2213                        break
2214                endif
2215                If (cmpstr("ln(Iq^2)",S_Value) == 0)
2216                        yAxis = ywave+"_RA"
2217                        if (exists(yAxis)== 0)
2218                                Duplicate yw $yAxis
2219                        endif
2220                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2221                        wave yAxisWave = $yAxis
2222                        yAxisWave = ln(xw*xw*yw)
2223                        break
2224                endif
2225                //more ifs for each case
2226               
2227                // if selection not found, abort
2228                DoAlert 0,"Y-axis scaling incorrect. Aborting"
2229                Abort
2230        while(0)
2231End
2232
2233Function XRescale(xwave)       
2234        String xwave
2235 
2236        Wave xw = $xwave
2237                 
2238        //Scaling exponents and background value
2239        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2240        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2241        pow_a = V_value
2242        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2243        pow_b = V_value
2244        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2245        pow_c = V_value
2246       
2247//check for physical limits on exponent values
2248// if bad values found, alert, and reset to good values so the rescaling can continue
2249        NVAR gA = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
2250        NVAR gB = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
2251        NVAR gC = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
2252        if((pow_a < -2) || (pow_a > 10))
2253                DoAlert 0,"Exponent a must be in the range (-2,10) - the exponent a has been reset to 1"
2254                gA = 1
2255        endif
2256        if((pow_b < 0) || (pow_b > 10))
2257                DoAlert 0,"Exponent b must be in the range (0,10) - the exponent b has been reset to 1"
2258                gB = 1
2259        endif
2260        //if q^c is the x-scaling, c must be be within limits and also non-zero
2261        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2262        If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2263                if(pow_c == 0)
2264                        DoAlert 0,"Exponent c must be non-zero, c has been reset to 1"
2265                        gC = 1
2266                endif
2267                if((pow_c < -10) || (pow_c > 10))
2268                        DoAlert 0,"Exponent c must be in the range (-10,10), c has been reset to 1"
2269                        gC = 1
2270                endif
2271        endif
2272       
2273        //variables set for each model to control look of graph
2274        String xstr, xAxis
2275        //check for proper y-scaling selection, make the necessary waves
2276//      Wave xAxisWave
2277
2278        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2279        xstr = S_Value
2280        do
2281                // make the new yaxis wave
2282                If (cmpstr("q",S_Value) == 0)   
2283                        xAxis = xwave+"_RA"
2284                        if (exists(xAxis)== 0)
2285                                Duplicate xw $xAxis
2286                        endif
2287                        SetScale d 0,0,"A^-1",$xAxis
2288                        wave xAxisWave = $xAxis
2289                        xAxisWave = xw
2290                        break   
2291                endif
2292                If (cmpstr("q^2",S_Value) == 0)
2293                        xAxis = xwave+"_RA"
2294                        if (exists(xAxis)== 0)
2295                                Duplicate xw $xAxis
2296                        endif
2297                        SetScale d 0,0,"A^-2",$xAxis
2298                        wave xAxisWave = $xAxis
2299                        xAxisWave = xw*xw
2300                        break   
2301                endif
2302                If (cmpstr("log(q)",S_Value) == 0)     
2303                        xAxis = xwave+"_RA"
2304                        if (exists(xAxis)== 0)
2305                                Duplicate xw $xAxis
2306                        endif
2307                        SetScale d 0,0,"",$xAxis
2308                        wave xAxisWave = $xAxis
2309                        xAxisWave = log(xw)
2310                        break   
2311                endif
2312                If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2313                        xAxis = xwave+"_RA"
2314                        if (exists(xAxis)== 0)
2315                                Duplicate xw $xAxis
2316                        endif
2317                        SetScale d 0,0,"", $xAxis
2318                        wave xAxisWave = $xAxis
2319                        xAxisWave = xw^pow_c
2320                        break
2321                endif
2322       
2323                //more ifs for each case
2324                // if selection not found, abort
2325                DoAlert 0,"X-axis scaling incorrect. Aborting"
2326                Abort
2327        while(0)        //end of "case" statement for x-axis scaling
2328End
2329
2330Function ERescale(swave, ywave, xwave) 
2331        String swave, ywave, xwave
2332 
2333        Wave ew = $swave
2334        Wave yw = $ywave
2335        Wave xw = $xwave
2336                 
2337        //Scaling exponents and background value
2338        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2339        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2340        pow_a = V_value
2341        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2342        pow_b = V_value
2343        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2344        pow_c = V_value
2345       
2346//check for physical limits on exponent values
2347// if bad values found, alert, and reset to good values so the rescaling can continue
2348        NVAR gA = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
2349        NVAR gB = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
2350        NVAR gC = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
2351        if((pow_a < -2) || (pow_a > 10))
2352                DoAlert 0,"Exponent a must be in the range (-2,10) - the exponent a has been reset to 1"
2353                gA = 1
2354        endif
2355        if((pow_b < 0) || (pow_b > 10))
2356                DoAlert 0,"Exponent b must be in the range (0,10) - the exponent b has been reset to 1"
2357                gB = 1
2358        endif
2359        //if q^c is the x-scaling, c must be be within limits and also non-zero
2360        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2361        If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2362                if(pow_c == 0)
2363                        DoAlert 0,"Exponent c must be non-zero, c has been reset to 1"
2364                        gC = 1
2365                endif
2366                if((pow_c < -10) || (pow_c > 10))
2367                        DoAlert 0,"Exponent c must be in the range (-10,10), c has been reset to 1"
2368                        gC = 1
2369                endif
2370        endif
2371       
2372        //variables set for each model to control look of graph
2373        String ystr, eWave
2374        //check for proper y-scaling selection, make the necessary waves
2375//      Wave yErrWave
2376
2377        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
2378        ystr = S_Value
2379        do
2380               
2381                If (cmpstr("I",S_Value) == 0)
2382                        eWave = swave+"_RA"
2383                        if (exists(eWave) == 0)
2384                                Duplicate ew $eWave
2385                        endif
2386                        wave yErrWave = $eWave
2387                        yErrWave = ew
2388                        break   
2389                endif
2390                If (cmpstr("ln(I)",S_Value) == 0)
2391                        eWave = swave+"_RA"
2392                        if (exists(eWave) == 0)
2393                                Duplicate ew $eWave
2394                        endif
2395                        wave yErrWave = $eWave
2396                        yErrWave = ew/yw
2397                        break   
2398                endif
2399                If (cmpstr("log(I)",S_Value) == 0)
2400                        eWave = swave+"_RA"
2401                        if (exists(eWave) == 0)
2402                                Duplicate ew $eWave
2403                        endif
2404                        wave yErrWave = $eWave
2405                        yErrWave = ew/(2.30*yw)
2406                        break   
2407                endif
2408                If (cmpstr("1/I",S_Value) == 0)
2409                        eWave = swave+"_RA"
2410                        if (exists(eWave) == 0)
2411                                Duplicate ew $eWave
2412                        endif
2413                        wave yErrWave = $eWave
2414                        yErrWave = ew/(yw^2)
2415                        break
2416                endif
2417                If (cmpstr("I^a",S_Value) == 0)
2418                        eWave = swave+"_RA"
2419                        if (exists(eWave) == 0)
2420                                Duplicate ew $eWave
2421                        endif
2422                        wave yErrWave = $eWave
2423                        yErrWave = ew*abs(pow_a*(yw^(pow_a-1)))
2424                        break
2425                endif
2426                If (cmpstr("Iq^a",S_Value) == 0)
2427                        eWave = swave+"_RA"
2428                        if (exists(eWave) == 0)
2429                                Duplicate ew $eWave
2430                        endif
2431                        wave yErrWave = $eWave
2432                        yErrWave = ew*xw^pow_a
2433                        break
2434                endif
2435                If (cmpstr("I^a q^b",S_Value) == 0)
2436                        eWave = swave+"_RA"
2437                        if (exists(eWave) == 0)
2438                                Duplicate ew $eWave
2439                        endif
2440                        wave yErrWave = $eWave
2441                        yErrWave = ew*abs(pow_a*(yw^(pow_a-1)))*xw^pow_b
2442                        break
2443                endif
2444                If (cmpstr("1/sqrt(I)",S_Value) == 0)
2445                        eWave = swave+"_RA"
2446                        if (exists(eWave) == 0)
2447                                Duplicate ew $eWave
2448                        endif
2449                        wave yErrWave = $eWave
2450                        yErrWave = 0.5*ew*yw^(-1.5)
2451                        break
2452                endif
2453                If (cmpstr("ln(Iq)",S_Value) == 0)
2454                        eWave = swave+"_RA"
2455                        if (exists(eWave) == 0)
2456                                Duplicate ew $eWave
2457                        endif
2458                        wave yErrWave = $eWave
2459                        yErrWave =ew/yw
2460                        break
2461                endif
2462                If (cmpstr("ln(Iq^2)",S_Value) == 0)
2463                        eWave = swave+"_RA"
2464                        if (exists(eWave) == 0)
2465                                Duplicate ew $eWave
2466                        endif
2467                        wave yErrWave = $eWave
2468                        yErrWave = ew/yw
2469                        break
2470                endif
2471                //more ifs for each case
2472               
2473                // if selection not found, abort
2474                DoAlert 0,"Y-axis scaling incorrect. Aborting"
2475                Abort
2476        while(0)        //end of "case" statement for y-axis scaling
2477
2478End
2479
2480///////////////////////////
2481
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.