source: sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Common/Packages/PlotManager/PlotUtilsMacro_v40.ipf @ 1133

Last change on this file since 1133 was 1133, checked in by srkline, 4 years ago

many changes to the VCALC procedures to add in the hard/soft shadowing to the calculation, visualization of the shadowed regions, and the actual q-values. Added a separate panel to view the shadowed regions.

simpe fix to the real time routine to allow easy updating of both the raw 2D data and 1-D average

update to the USANS package to handle the new NICE generated data where the data is collected in terms of q-values rather than angle. On startup asks user which style of data they have. Sets a preference that can be un-checked if you have old-style ICP data. (there is nothing in the data file that I can key on).

File size: 75.5 KB
Line 
1#pragma rtGlobals=1             // Use modern global access method.
2#pragma version=4.00
3#pragma IgorVersion=6.1
4
5// This is to be used with the Analysis packages ONLY
6// there are a number of utility procedures here for loading
7// data and generating valid lists of data files that are
8// directly copied from the Reduction package
9// -- There WILL be name conflicts if you mix the two...
10//
11// 16 DEC 05 SRK
12// prepended function names with A_ to tag them for the
13// "A"nalysis parckage, though nearly all are duplicate procedures
14// so there will be no overlap with the reduction package
15//
16//
17// these extra procedures are used by:
18// Linearized fits (duplicated in Reduction - will need to handle gently)
19// Invariant (no overlap with reduction)
20//
21// SRK MAR 2005
22
23// create a KW=string; of model=coef correspondence as the models are plotted, rather than
24// some other hard-wired solution
25Function AddModelToStrings(funcStr,coefStr,paramStr,suffix)
26        String funcStr,coefStr,paramStr,suffix
27       
28        if(exists("root:Packages:NIST:paramKWStr")==0)
29                String/G root:Packages:NIST:coefKWStr=""
30                String/G root:Packages:NIST:paramKWStr=""
31                String/G root:Packages:NIST:suffixKWStr=""
32        endif
33        SVAR coefKWStr = root:Packages:NIST:coefKWStr
34        SVAR paramKWStr = root:Packages:NIST:paramKWStr
35        SVAR suffixKWStr = root:Packages:NIST:suffixKWStr
36        coefKWStr += funcStr+"="+coefStr+";"
37        paramKWStr += funcStr+"="+paramStr+";"
38        suffixKWStr += funcStr+"="+suffix+";"
39end
40
41// always pass this the function string
42//
43// this is new in the 2009 release, so make sure that it generates itself as needed.
44// Two options: (1) search and construct as needed, ask for intervention if I need it.
45// (2) since I'm passed the function, try to replot it to re-run the function
46// to fill in the strings. (Being sure to save the coefficients)
47//
48// using method (1) to fill in what I need with no intervention
49//
50Function/S getFunctionParams(funcStr)
51        String funcStr
52
53        String paramStr=""
54        SVAR/Z listStr=root:Packages:NIST:paramKWStr
55
56        if(SVAR_Exists(listStr))
57                paramStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
58                if(strlen(paramStr)!=0)                 //will drop out of loop if string can't be found
59                        return(paramStr)
60                endif
61        else    //global string does not exist, create it and fill it in
62                Variable/G root:Pacakges:NIST:gReconstructStrings = 1                   //coefficients old style and must be rebuilt too
63                String/G root:Packages:NIST:paramKWStr=""
64                SVAR/Z listStr=root:Packages:NIST:paramKWStr
65        endif   
66       
67        // find everything to rebuild only if the model has been plotted (if so, coefficients will exist)
68        String coef = getFunctionCoef(funcStr)
69        if(strlen(coef)==0)
70                //model not plotted, don't reconstruct, return null string
71                return(paramStr)
72        endif
73       
74        ///// NEED TO BE IN PROPER DATA FOLDER FOR SMEARED FUNCTIONS
75        // FUNCTION POP MENU WILL LOOK IN ROOT OTHERWISE
76        ControlInfo/W=WrapperPanel popup_0
77        String folderStr=S_Value
78        // this if/else/endif should not ever return an error alert     
79        // it should simply set the data folder properly       
80        if(Stringmatch(funcStr,"Smear*"))               //simple test for smeared function
81                if(DataFolderExists("root:"+folderStr))
82                        SetDataFolder $("root:"+folderStr)
83                else
84                        SetDataFolder root:
85                endif
86        else
87                SetDataFolder root:
88        endif
89       
90        // model was plotted, find the suffix to fill in the parameter wave
91        SVAR suffListStr=root:Packages:NIST:suffixKWStr
92        String suffix = StringByKey(coef, suffListStr  ,"=",";",0)
93       
94        String paramWave = WaveList("*par*"+suffix,"","TEXT:1")         //should be one wave name, no trailing semicolon
95        listStr += funcStr+"="+paramWave+";"
96
97        //now look it up again
98        paramStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
99
100        return(paramStr)
101End
102
103// always pass this the function string
104//
105Function/S getFunctionCoef(funcStr)
106        String funcStr
107
108        SVAR listStr=root:Packages:NIST:coefKWStr
109        String coefStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
110
111        return(coefStr)
112End
113
114// always pass this the Function string
115//
116// does NOT return the leading "_" as part of the suffix
117// may need to set the string correctly - so lost of messing around for back-compatibility
118Function/S getModelSuffix(funcStr)
119        String funcStr
120
121        SVAR listStr=root:Packages:NIST:suffixKWStr
122        String suffixStr = StringByKey(funcStr, listStr  ,"=",";",0)
123
124        if(strlen(suffixStr) !=0)               //found it, get out
125                return(suffixStr)
126        endif
127       
128        // was the model plotted?
129        String coef = getFunctionCoef(funcStr)
130        if(strlen(coef)==0)             
131                //nothing plotted
132                return("")
133        else
134                //plotted, find the coeff
135                String suffix = StringByKey(coef, ListStr  ,"=",";",0)
136       
137                // add to the suffix list in the new style, if it was found
138                if(strlen(suffix) !=0)
139                        listStr += funcStr+"="+suffix+";"
140                endif
141                return(suffix)
142        endif
143       
144        return("")
145End
146
147
148/////////////////////////////
149
150
151
152
153// loads a 1-d (ascii) datafile and plots the data
154// will overwrite existing data if user is OK with this
155// - multiple datasets can be automatically plotted on the same graph
156//
157//substantially easier to write this as a Proc rather than a function...
158
159//
160Proc A_LoadOneDData()
161        A_LoadOneDDataWithName("",1)            //will prompt for file and plot data
162End
163
164// load the data specified by fileStr (a full path:name)
165// and plots if doPlot==1
166// if fileStr is null, a dialog is presented to select the file
167//
168// 3 cases (if)
169// - 3 columns = QIS, no resolution
170// - 6 columns = QSIG, SANS w/resolution
171// - 5 columns = old-style desmeared USANS data (from VAX)
172//
173// This loader replaces the A_LoadOneDData() which was almost completely duplicated code
174//
175//new version, 19JUN07 that loads each data set into a separate data folder
176// the data folder is given the "base name" of the data file as it's loaded
177//
178
179Proc A_LoadOneDDataWithName(fileStr,doPlot)
180        String fileStr
181        Variable doPlot
182       
183        A_LoadOneDDataToName(fileStr,"",doPlot,0)
184
185End
186
187
188///Function that takes output name as well as input
189Proc A_LoadOneDDataToName(fileStr,outStr,doPlot,forceOverwrite)
190        String fileStr, outstr
191        Variable doPlot,forceOverwrite
192       
193        Variable rr,gg,bb,refnum,dQv
194        String w0,w1,w2,n0,n1,n2
195        String w3,w4,w5,n3,n4,n5                        //3 extra waves to load
196        SetDataFolder root:             //build sub-folders for each data set under root
197
198// I can't see that we need to find dQv here.   
199//      if (exists("root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:gDQv"))
200//              //Running from USANS reduction
201//              Variable dQv = root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:gDQv
202//      endif
203//      if(exists("root:Packages:NIST:USANS_dQv"))
204//              //Running from SANS Analysis
205//              Variable dQv = root:Packages:NIST:USANS_dQv
206//      else
207//              //running from somewhere else, probably SANS Reduction, which uses common loaders
208//              Variable/G root:Packages:NIST:USANS_dQv = 0.117
209//      endif
210        String angst = StrVarOrDefault("root:Packages:NIST:gAngstStr", "A" )
211
212        // if no fileStr passed in, display dialog now
213        if (cmpStr(fileStr,"") == 0)
214                fileStr = DoOpenFileDialog("Select a data file to load")
215                if (cmpstr(fileStr,"") == 0)
216                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = ""
217                        return          //get out if no file selected
218                endif
219        endif
220
221        if (isXML(fileStr) == 1)
222                LoadNISTXMLData(fileStr,outstr,doPlot,forceOverwrite)
223        else           
224                //Load the waves, using default waveX names
225                //if no path or file is specified for LoadWave, the default Mac open dialog will appear
226                LoadWave/G/D/A/Q fileStr
227                String fileNamePath = S_Path+S_fileName
228//              String basestr = ParseFilePath(3,ParseFilePath(5,fileNamePath,":",0,0),":",0,0)
229
230                String basestr
231                if (!cmpstr(outstr, ""))                //Outstr = "", cmpstr returns 0
232//                      enforce a short enough name here to keep Igor objects < 31 chars
233                        baseStr = ShortFileNameString(CleanupName(S_fileName,0))
234                        baseStr = CleanupName(baseStr,0)                //in case the user added odd characters
235                        //baseStr = CleanupName(S_fileName,0)
236                else
237                        baseStr = outstr                        //for output, hopefully correct length as passed in
238                endif
239       
240//              print "basestr :"+basestr
241                String fileName =  ParseFilePath(0,ParseFilePath(5,filestr,":",0,0),":",1,0)
242//              print "filename :"+filename
243                Variable numCols = V_flag
244               
245                //changes JIL to allow 2-column data to be read in, "faking" a 3rd column of errors
246                if(numCols==2) //no errors
247                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
248                        Duplicate/O $("root:"+n1), errorTmp
249                        errorTmp = 0.01*(errorTmp)+ 0.03*sqrt(errorTmp)
250                        S_waveNames+="errorTmp;"
251                        numCols=3
252                endif
253               
254                if(numCols==3)          //simple 3-column data with no resolution information
255                       
256                        // put the names of the three loaded waves into local names
257                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
258                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
259                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
260                       
261                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
262                        w0 = CleanupName((basestr + "_q"),0)
263                        w1 = CleanupName((basestr + "_i"),0)
264                        w2 = CleanupName((basestr + "_s"),0)
265                       
266                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
267                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
268                                if (!forceOverwrite)
269                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
270                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
271                                                SetDataFolder root:
272                                                KillWaves $n0,$n1,$n2           // kill the default waveX that were loaded
273                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
274                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
275                                                endif
276                                                return  //quits the macro
277                                        endif
278                                endif
279                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
280                        else
281                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
282                        endif
283
284                       
285                        ////overwrite the existing data, if it exists
286                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
287                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
288                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
289       
290                        // no resolution matrix to make
291       
292                        SetScale d,0,0,"1/A",$w0
293                        SetScale d,0,0,"1/cm",$w1
294                       
295                endif           //3-col data
296               
297                if(numCols == 6)                //6-column SANS or USANS data that has resolution information
298                       
299                        // put the names of the (default named) loaded waves into local names
300                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
301                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
302                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
303                        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
304                        n4 = StringFromList(4, S_waveNames ,";" )
305                        n5 = StringFromList(5, S_waveNames ,";" )
306                       
307                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
308                        w0 = CleanupName((basestr + "_q"),0)
309                        w1 = CleanupName((basestr + "_i"),0)
310                        w2 = CleanupName((basestr + "_s"),0)
311                        w3 = CleanupName((basestr + "sq"),0)
312                        w4 = CleanupName((basestr + "qb"),0)
313                        w5 = CleanupName((basestr + "fs"),0)
314                       
315                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
316                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
317                                if(!forceOverwrite)
318                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
319                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
320                                                SetDataFolder root:
321                                                KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4,$n5               // kill the default waveX that were loaded
322                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
323                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
324                                                endif
325                                                return          //quits the macro
326                                        endif
327                                endif
328                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
329                        else
330                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
331                        endif
332
333
334
335       
336        ////overwrite the existing data, if it exists
337                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
338                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
339                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
340                        Duplicate/O $("root:"+n3), $w3
341                        Duplicate/O $("root:"+n4), $w4
342                        Duplicate/O $("root:"+n5), $w5
343       
344                        // need to switch based on SANS/USANS
345                        if (isSANSResolution($w3[0]))           //checks to see if the first point of the wave is <0]
346                                // make a resolution matrix for SANS data
347                                Variable np=numpnts($w0)
348                                Make/D/O/N=(np,4) $(baseStr+"_res")
349                               
350                                $(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]         //sigQ
351                                $(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]         //qBar
352                                $(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]         //fShad
353                                $(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]         //Qvalues
354                        else
355                                //the data is USANS data
356                                // marix calculation here, but for now, just copy the waves
357                                //$(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]               //sigQ
358                                //$(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]               //qBar
359                                //$(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]               //fShad
360                                //$(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]               //Qvalues
361                                dQv = -$w3[0]
362
363//DONE: this works correctly and can be included in either
364// a VSANS reduction experiment, or a standalone analysis package
365// -- since this is a Proc, not a function, #conditional compile does not work,
366// but, since it's a Proc, it is not compiled, so missing functions aren't flagged as a compile error
367//                              if (exists("NCNR_VSANS")==6)                    //defined in the main  VSANS #includes file.
368//                                      DoAlert 0,"**Treating data as VSANS data**"
369                                        Duplicate/O $w3,$(baseStr+"_dQv")                       //save a copy for VSANS
370                                        $(baseStr+"_dQv") = -$(baseStr+"_dQv")
371                                        USANS_CalcWeights(baseStr,dQv)
372//                              else
373//                                      DoAlert 0,"Treating data as USANS (normal slit-smeared data)"
374//                                      USANS_CalcWeights(baseStr,dQv)
375//                              endif                           
376
377                               
378                               
379                        endif
380                        Killwaves/Z $w3,$w4,$w5                 //get rid of the resolution waves that are in the matrix
381       
382                        SetScale d,0,0,"1/A",$w0
383                        SetScale d,0,0,"1/cm",$w1
384               
385                endif   //6-col data
386       
387                // Load ORNL data from Heller program
388                if(numCols == 4)                //4-column SANS or USANS data that has resolution information
389                       
390                        // put the names of the (default named) loaded waves into local names
391                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
392                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
393                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
394                        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
395                       
396                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
397                        w0 = CleanupName((basestr + "_q"),0)
398                        w1 = CleanupName((basestr + "_i"),0)
399                        w2 = CleanupName((basestr + "_s"),0)
400                        w3 = CleanupName((basestr + "sq"),0)
401                        w4 = CleanupName((basestr + "qb"),0)
402                        w5 = CleanupName((basestr + "fs"),0)
403       
404                       
405                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
406                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
407                                if(!forceOverwrite)
408                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
409                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
410                                                SetDataFolder root:
411                                                KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3               // kill the default waveX that were loaded
412                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
413                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
414                                                endif
415                                                return          //quits the macro
416                                        endif
417                                endif
418                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
419                        else
420                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
421                        endif
422       
423
424
425       
426        ////overwrite the existing data, if it exists
427                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
428                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
429                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
430                        Duplicate/O $("root:"+n3), $w3
431                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w4 // Set qb wave to nominal measured Q values
432                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w5 // Make wave of appropriate length
433                        $w4 = $w0
434                        $w5 = 1                                           //  Set all shadowfactor to 1
435       
436                        // need to switch based on SANS/USANS
437                        if (isSANSResolution($w3[0]))           //checks to see if the first point of the wave is <0]
438                                // make a resolution matrix for SANS data
439                                Variable np=numpnts($w0)
440                                Make/D/O/N=(np,4) $(baseStr+"_res")
441                               
442                                $(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]         //sigQ
443                                $(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]         //qBar
444                                $(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]         //fShad
445                                $(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]         //Qvalues
446                        else
447                                //the data is USANS data
448                                // marix calculation here, but for now, just copy the waves
449                                //$(baseStr+"_res")[][0] = $w3[p]               //sigQ
450                                //$(baseStr+"_res")[][1] = $w4[p]               //qBar
451                                //$(baseStr+"_res")[][2] = $w5[p]               //fShad
452                                //$(baseStr+"_res")[][3] = $w0[p]               //Qvalues
453                                dQv = -$w3[0]
454                               
455                                USANS_CalcWeights(baseStr,dQv)
456                               
457                        endif
458                        Killwaves/Z $w3,$w4,$w5                 //get rid of the resolution waves that are in the matrix
459       
460                        SetScale d,0,0,"1/A",$w0
461                        SetScale d,0,0,"1/cm",$w1
462               
463                endif   //4-col data
464       
465       
466                if(numCols==5)          //this is the "old-style" VAX desmeared data format
467                       
468                        // put the names of the three loaded waves into local names
469                        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
470                        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
471                        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
472                        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
473                        n4 = StringFromList(4, S_waveNames ,";" )
474                       
475                       
476                        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
477                        w0 = CleanupName((basestr+"_q"),0)
478                        w1 = CleanupName((basestr+"_i"),0)
479                        w2 = CleanupName((basestr+"_s"),0)
480                        w3 = CleanupName((basestr+"_ism"),0)
481                        w4 = CleanupName((basestr+"_fit_ism"),0)
482                       
483                        //String baseStr=w1[0,strlen(w1)-3]
484                        if(DataFolderExists("root:"+baseStr))
485                                if(!forceOverwrite)
486                                        DoAlert 1,"The file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
487                                        if(V_flag==2)   //user selected No, don't load the data
488                                                KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4,$n5               // kill the default waveX that were loaded
489                                                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
490                                                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
491                                                endif           //set the last file loaded to the one NOT loaded
492                                                return          //quits the macro
493                                        endif
494                                endif
495                                SetDataFolder $("root:"+baseStr)
496                        else
497                                NewDataFolder/S $("root:"+baseStr)
498                        endif
499                       
500                        ////overwrite the existing data, if it exists   
501                        Duplicate/O $("root:"+n0), $w0
502                        Duplicate/O $("root:"+n1), $w1
503                        Duplicate/O $("root:"+n2), $w2
504                        Duplicate/O $("root:"+n3), $w3
505                        Duplicate/O $("root:"+n4), $w4
506                       
507                        // no resolution matrix
508                endif           //5-col data
509
510                //////
511                if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
512                        String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
513                endif
514       
515               
516                //plot if desired
517                if(doPlot)
518                        Print GetDataFolder(1)
519                       
520                        // assign colors randomly
521                        rr = abs(trunc(enoise(65535)))
522                        gg = abs(trunc(enoise(65535)))
523                        bb = abs(trunc(enoise(65535)))
524                       
525                        // if target window is a graph, and user wants to append, do so
526                   DoWindow/B Plot_Manager
527                        if(WinType("") == 1)
528                                DoAlert 1,"Do you want to append this data to the current graph?"
529                               
530                               
531                                if(V_Flag == 1)
532                                        AppendToGraph $w1 vs $w0
533                                        ModifyGraph mode($w1)=3,marker($w1)=19,msize($w1)=2,rgb($w1) =(rr,gg,bb),tickUnit=1
534                                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
535                                        ModifyGraph tickUnit(left)=1
536                                else
537                                //new graph
538                                        SetDataFolder $("root:"+baseStr)                //sometimes I end up back in root: here, and I can't figure out why!
539                                        Display $w1 vs $w0
540                                        ModifyGraph log=1,mode($w1)=3,marker($w1)=19,msize($w1)=2,rgb($w1)=(rr,gg,bb),tickUnit=1
541                                        ModifyGraph grid=1,mirror=2,standoff=0
542                                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
543                                        ModifyGraph tickUnit(left)=1
544                                        Label left "I(q)"
545                                        Label bottom "q ("+angst+"\\S-1\\M)"
546                                        Legend
547                                endif
548                        else
549                        // graph window was not target, make new one
550                                Display $w1 vs $w0
551                                ModifyGraph log=1,mode($w1)=3,marker($w1)=19,msize($w1)=2,rgb($w1)=(rr,gg,bb),tickUnit=1
552                                ModifyGraph grid=1,mirror=2,standoff=0
553                                ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
554                                ModifyGraph tickUnit(left)=1
555                                Label left "I(q)"
556                                Label bottom "q ("+angst+"\\S-1\\M)"
557                                Legend
558                        endif
559                endif
560                       
561                //go back to the root folder and clean up before leaving
562                SetDataFolder root:
563                KillWaves/Z $n0,$n1,$n2,$n3,$n4,$n5
564               
565        endif
566End
567
568
569//procedure for loading NSE data in the format (4-columns)
570// qvals - time - I(q,t) - dI(q,t)
571//
572//
573// this does NOT load the data into separate folders...
574//
575Proc A_LoadNSEData()
576        A_LoadNSEDataWithName("",1)
577End
578
579Proc A_LoadNSEDataWithName(fileStr,doPlot)
580
581        //Load the waves, using default waveX names
582        //if no path or file is specified for LoadWave, the default Mac open dialog will appear
583        LoadWave/G/D/A  fileStr
584        String filename = S_fileName
585       
586        String w0,w1,w2,n0,n1,n2,wt,w3,n3
587        Variable rr,gg,bb
588       
589        // put the names of the three loaded waves into local names
590        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
591        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
592        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
593        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
594       
595       
596        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
597        w0 = CleanupName(("qvals_"+S_fileName),0)
598        w1 = CleanupName(("time_"+S_fileName),0)
599        w2 = CleanupName(("iqt_"+S_fileName),0)
600        w3 = CleanupName(("iqterr_"+S_fileName),0)
601       
602        if(exists(w0) !=0)
603                DoAlert 0,"This file has already been loaded. Use Append to Graph..."
604                KillWaves $n0,$n1,$n2           // kill the default waveX that were loaded
605                return
606        endif
607       
608        // Rename to give nice names
609        Rename $n0, $w0
610        Rename $n1, $w1
611        Rename $n2, $w2
612        Rename $n3, $w3
613               
614        if(doPlot)
615                // assign colors randomly
616                rr = abs(trunc(enoise(65535)))
617                gg = abs(trunc(enoise(65535)))
618                bb = abs(trunc(enoise(65535)))
619               
620                // if target window is a graph, and user wants to append, do so
621                if(WinType("") == 1)
622                        DoAlert 1,"Do you want to append this data to the current graph?"
623                        if(V_Flag == 1)
624                                AppendToGraph $w2 vs $w1
625                                ModifyGraph mode($w2)=3,marker($w2)=29,msize($w2)=2,rgb($w2) =(rr,gg,bb),grid=1,mirror=2,tickUnit=1
626                                ErrorBars/T=0 $w2 Y,wave=($w3,$w3)
627                        else
628                        //new graph
629                                Display $w2 vs $w1
630                                ModifyGraph standoff=0,mode($w2)=3,marker($w2)=29,msize($w2)=2,rgb($w2)=(rr,gg,bb),grid=1,mirror=2,tickUnit=1
631                                ErrorBars/T=0 $w2 Y,wave=($w3,$w3)
632                                Legend
633                        endif
634                else
635                // graph window was not target, make new one
636                        Display $w2 vs $w1
637                        ModifyGraph standoff=0,mode($w2)=3,marker($w2)=29,msize($w2)=2,rgb($w2)=(rr,gg,bb),grid=1,mirror=2,tickUnit=1
638                        ErrorBars/T=0 $w2 Y,wave=($w3,$w3)
639                        Legend
640                endif
641        endif //doPlot         
642
643End
644
645//procedure for loading desmeared USANS data in the format (5-columns)
646// qvals - I(q) - sig I - Ism(q) - fitted Ism(q)
647//no weighting wave is created (not needed in IGOR 4)
648//
649// not really ever used...
650//
651Proc A_LoadUSANSData()
652
653        //Load the waves, using default waveX names
654        //if no path or file is specified for LoadWave, the default Mac open dialog will appear
655        LoadWave/G/D/A
656   String filename = S_fileName
657       
658        String w0,w1,w2,n0,n1,n2,w3,n3,w4,n4
659        Variable rr,gg,bb
660       
661        // put the names of the three loaded waves into local names
662        n0 = StringFromList(0, S_waveNames ,";" )
663        n1 = StringFromList(1, S_waveNames ,";" )
664        n2 = StringFromList(2, S_waveNames ,";" )
665        n3 = StringFromList(3, S_waveNames ,";" )
666        n4 = StringFromList(4, S_waveNames ,";" )
667       
668       
669        //remove the semicolon AND period from files from the VAX
670        w0 = CleanupName((S_fileName+"_q"),0)
671        w1 = CleanupName((S_fileName+"_i"),0)
672        w2 = CleanupName((S_fileName+"_s"),0)
673        w3 = CleanupName((S_fileName+"_ism"),0)
674        w4 = CleanupName((S_fileName+"_fit_ism"),0)
675       
676        if(exists(w0) !=0)              //the wave already exists
677                DoAlert 1,"This file "+S_filename+" has already been loaded. Do you want to load the new data file, overwriting the data in memory?"
678                if(V_flag==2)   //user selected No
679                        KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4           // kill the default waveX that were loaded
680                        if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
681                                String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
682                        endif           //set the last file loaded to the one NOT loaded
683                        return          //quits the macro
684                endif
685        endif
686       
687        ////overwrite the existing data, if it exists
688        Duplicate/O $n0, $w0
689        Duplicate/O $n1, $w1
690        Duplicate/O $n2, $w2
691        Duplicate/O $n3, $w3
692        Duplicate/O $n4, $w4
693        KillWaves $n0,$n1,$n2,$n3,$n4
694       
695        if(DataFolderExists("root:Packages:NIST"))
696                String/G root:Packages:NIST:gLastFileName = filename
697        endif
698               
699        // assign colors randomly
700        rr = abs(trunc(enoise(65535)))
701        gg = abs(trunc(enoise(65535)))
702        bb = abs(trunc(enoise(65535)))
703       
704                // if target window is a graph, and user wants to append, do so
705        if(WinType("") == 1)
706                DoAlert 1,"Do you want to append this data to the current graph?"
707                if(V_Flag == 1)
708                        AppendToGraph $w1 vs $w0
709                        ModifyGraph mode=3,marker=29,msize=2,rgb ($w1) =(rr,gg,bb),tickUnit=1,grid=1,mirror=2
710                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
711                else
712                //new graph
713                        Display $w1 vs $w0
714                        ModifyGraph log=1,mode=3,marker=29,msize=2,rgb=(rr,gg,bb),tickUnit=1,grid=1,mirror=2
715                        ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
716                        Legend
717                endif
718        else
719        // graph window was not target, make new one
720                Display $w1 vs $w0
721                ModifyGraph log=1,mode=3,marker=29,msize=2,rgb=(rr,gg,bb),tickUnit=1,grid=1,mirror=2
722                ErrorBars/T=0 $w1 Y,wave=($w2,$w2)
723                Legend
724        endif
725               
726End
727
728
729//// Extra "Utility Procedures"
730// to pick path, get a list of data files, and make sure that a valid filename
731// is passed to LoadOneDDataWithName()
732//
733
734//prompts user to choose the local folder that contains the SANS Data
735//only one folder can be used, and its path is catPathName (and is a NAME, not a string)
736//this will overwrite the path selection
737//returns 1 if no path selected as error condition
738Function A_PickPath()
739       
740        //set the global string to the selected pathname
741        NewPath/O/M="pick the SANS data folder" catPathName
742        PathInfo/S catPathName
743        String dum = S_path
744        String alertStr = ""
745        alertStr = "You must set the path to Charlotte through a Mapped Network Drive, not through the Network Neighborhood"
746        //alertStr += "  Please see the manual for details."
747        if (V_flag == 0)
748                //path does not exist - no folder selected
749                String/G root:Packages:NIST:gCatPathStr = "no folder selected"
750                return(1)
751        else
752                //set the global to the path (as a string)
753                // need 4 \ since it is the escape character
754
755// SRK 2016, for windows 10, try to eliminate this restriction         
756//              print igorinfo(3)
757//              if(cmpstr("\\\\",dum[0,1])==0)  //Windoze user going through network neighborhood
758//                      DoAlert 0,alertStr
759//                      KillPath catPathName
760//                      return(1)
761//              endif
762               
763                String/G root:Packages:NIST:gCatPathStr = dum
764                return(0)               //no error
765        endif
766End
767
768//Function attempts to find valid filename from partial name that has been stripped of
769//the VAX version number. The partial name is tried first
770//*** the PATH is hard-wired to catPathName (which is assumed to exist)
771//version numers up to ;10 are tried
772//only the "name;vers" is returned. the path is not prepended, hence the return string
773//is not a complete specification of the file
774//
775// added 11/99 - uppercase and lowercase versions of the file are tried, if necessary
776// since from marquee, the filename field (textread[0]) must be used, and can be a mix of               // 02JUL13
777// upper/lowercase letters, while the filename on the server (should) be all caps
778// now makes repeated calls to ValidFileString()
779//
780Function/S A_FindValidFilename(partialName)
781        String PartialName
782       
783        String retStr=""
784       
785        //try name with no changes - to allow for ABS files that have spaces in the names 12APR04
786        retStr = A_ValidFileString(partialName)
787        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
788                //non-null return
789                return(retStr)
790        Endif
791       
792        //if the partial name is derived from the file header, there can be spaces at the beginning
793        //or in the middle of the filename - depending on the prefix and initials used
794        //
795        //remove any leading spaces from the name before starting
796        partialName = A_RemoveAllSpaces(partialName)
797       
798        //try name with no spaces
799        retStr = A_ValidFileString(partialName)
800        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
801                //non-null return
802                return(retStr)
803        Endif
804       
805        //try all UPPERCASE
806        partialName = UpperStr(partialName)
807        retStr = A_ValidFileString(partialName)
808        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
809                //non-null return
810                return(retStr)
811        Endif
812       
813        //try all lowercase (ret null if failure)
814        partialName = LowerStr(partialName)
815        retStr = A_ValidFileString(partialName)
816        if(cmpstr(retStr,"") !=0)
817                //non-null return
818                return(retStr)
819        else
820                return(retStr)
821        Endif
822End
823
824//function to test a binary file to see if it is a RAW binary SANS file
825//first checks the total bytes in the file (which for raw data is 33316 bytes)
826//**note that the "DIV" file will also show up as a raw file by the run field
827//should be listed in CAT/SHORT and in patch windows
828//
829//Function then checks the file fname (full path:file) for "RAW" run.type field
830//if not found, the data is not raw data and zero is returned
831Function A_CheckIfRawData(fname)
832        String fname
833       
834        Variable refnum,totalBytes
835        String testStr=""
836       
837        Open/R/T="????TEXT" refNum as fname
838        //get the total number of bytes in the file, to avoid moving past EOF
839        FStatus refNum
840        totalBytes = V_logEOF
841        //Print totalBytes
842        if(totalBytes!=33316)
843                //can't possibly be a raw data file
844                Close refnum
845                return(0)               //not a raw SANS file
846        Endif
847        FSetPos refNum,75
848        FReadLine/N=3 refNum,testStr
849        Close refNum
850       
851        if(cmpstr(testStr,"RAW")==0)
852                //true, is raw data file
853                Return(1)
854        else
855                //some other file
856                Return(0)
857        Endif
858End
859
860//list (input) is a list, typically returned from IndexedFile()
861//which is semicolon-delimited, and may contain filesnames from the VAX
862//that contain version numbers, where the version number appears as a separate list item
863//(and also as a non-existent file)
864//these numbers must be purged from the list, especially for display in a popup
865//or list processing of filenames
866//the function returns the list, cleaned of version numbers (up to 11)
867//raw data files will typically never have a version number other than 1.
868Function/S A_RemoveVersNumsFromList(list)
869        String list
870       
871        //get rid of version numbers first (up to 11)
872        Variable ii,num
873        String item
874        num = ItemsInList(list,";")
875        ii=1
876        do
877                item = num2str(ii)
878                list = RemoveFromList(item, list ,";" )
879                ii+=1
880        while(ii<12)
881       
882        return (list)
883End
884
885//Function attempts to find valid filename from partial name that has been stripped of
886//the VAX version number. The partial name is tried first
887//*** the PATH is hard-wired to catPathName (which is assumed to exist)
888//version numers up to ;10 are tried
889//only the "name;vers" is returned. the path is not prepended, hence the return string
890//is not a complete specification of the file
891//
892Function/S A_ValidFileString(partialName)
893        String partialName
894       
895        String tempName = "",msg=""
896        Variable ii,refnum
897       
898        ii=0
899        do
900                if(ii==0)
901                        //first pass, try the partialName
902                        tempName = partialName
903                        Open/Z/R/T="????TEXT"/P=catPathName refnum tempName     //Does open file (/Z flag)
904                        if(V_flag == 0)
905                                //file exists
906                                Close refnum            //YES needed,
907                                break
908                        endif
909                else
910                        tempName = partialName + ";" + num2str(ii)
911                        Open/Z/R/T="????TEXT"/P=catPathName refnum tempName
912                        if(V_flag == 0)
913                                //file exists
914                                Close refnum
915                                break
916                        endif
917                Endif
918                ii+=1
919                //print "ii=",ii
920        while(ii<11)
921        //go get the selected bits of information, using tempName, which exists
922        if(ii>=11)
923                //msg = partialName + " not found. is version number > 11?"
924                //DoAlert 0, msg
925                //PathInfo catPathName
926                //Print S_Path
927                Return ("")             //use null string as error condition
928        Endif
929       
930        Return (tempName)
931End
932
933//function to remove all spaces from names when searching for filenames
934//the filename (as saved) will never have interior spaces (TTTTTnnn_AB _Bnnn)
935//but the text field in the header WILL, if less than 3 characters were used for the
936//user's initials, and can have leading spaces if prefix was less than 5 characters
937//
938//returns a string identical to the original string, except with the interior spaces removed
939//
940Function/S A_RemoveAllSpaces(str)
941        String str
942       
943        String tempstr = str
944        Variable ii,spc,len             //should never be more than 2 or 3 trailing spaces in a filename
945        ii=0
946        do
947                len = strlen(tempStr)
948                spc = strsearch(tempStr," ",0)          //is the last character a space?
949                if (spc == -1)
950                        break           //no more spaces found, get out
951                endif
952                str = tempstr
953                tempStr = str[0,(spc-1)] + str[(spc+1),(len-1)] //remove the space from the string
954        While(1)        //should never be more than 2 or 3
955       
956        If(strlen(tempStr) < 1)
957                tempStr = ""            //be sure to return a null string if problem found
958        Endif
959       
960        //Print strlen(tempstr)
961       
962        Return(tempStr)
963               
964End
965
966//AJJ Oct 2008
967//Moved from GaussUtils - makes more sense to have it here
968
969// utility used in the "PlotSmeared...() macros to get a list of data folders
970//
971//1:    Waves.
972//2:    Numeric variables.
973//3:    String variables.
974//4:    Data folders.
975Function/S GetAList(type)
976        Variable type
977       
978        SetDataFolder root:
979       
980        String objName,str=""
981        Variable index = 0
982        do
983                objName = GetIndexedObjName(":", type, index)
984                if (strlen(objName) == 0)
985                        break
986                endif
987                //Print objName
988                str += objName + ";"
989                index += 1
990        while(1)
991       
992        // remove myGlobals, Packages, etc. from the folder list
993        if(type==4)
994                str = RemoveFromList("myGlobals", str , ";" )
995                str = RemoveFromList("Packages", str, ";")
996                str = RemoveFromList("AutoFit", str, ";")
997                str = RemoveFromList("TISANE", str, ";")
998                str = RemoveFromList("HayPenMSA", str, ";")
999                str = RemoveFromList("SAS", str, ";")                   //from Irena
1000                str = RemoveFromList("USAXS", str, ";")
1001                str = RemoveFromList("RAW;SAM;EMP;BGD;DIV;MSK;ABS;CAL;COR;STO;SUB;DRK;SAS;", str  ,";")                 //root level folders present in old reduction experiments
1002                str = RemoveFromList("ToTrim", str , ";" )              //from VSANS
1003        endif
1004       
1005        return(str)
1006End
1007
1008
1009//returns the path to the file, or null if cancel
1010//
1011// either the T="????" or the /F flags work to set the filter to "all files"
1012// but the T is essentially obsolete, /F is new for Igor 6.1 and recommended
1013Function/S DoOpenFileDialog(msg)
1014        String msg
1015       
1016        Variable refNum
1017//      String message = "Select a file"
1018        String outputPath
1019       
1020        String fileFilters = "All Files:.*;"
1021               
1022//      Open/D/R/T="????"/M=msg refNum
1023        Open/D/R/F=fileFilters/M=msg refNum
1024        outputPath = S_fileName
1025       
1026        return outputPath
1027End
1028
1029// returns the path to the file, or null if the user cancelled
1030// fancy use of optional parameters
1031//
1032// enforce short file names (25 characters)
1033Function/S DoSaveFileDialog(msg,[fname,suffix])
1034        String msg,fname,suffix
1035        Variable refNum
1036//      String message = "Save the file as"
1037
1038        if(ParamIsDefault(fname))
1039//              Print "fname not supplied"
1040                fname = ""
1041        endif
1042        if(ParamIsDefault(suffix))
1043//              Print "suffix not supplied"
1044                suffix = ""
1045        endif
1046       
1047        String outputPath,tmpName,testStr
1048        Variable badLength=0,maxLength=25,l1,l2
1049       
1050       
1051        tmpName = fname + suffix
1052       
1053        do
1054                badLength=0
1055                Open/D/M=msg/T="????" refNum as tmpName         //OS will allow 255 characters, but then I can't read it back in!
1056                outputPath = S_fileName
1057               
1058                testStr = ParseFilePath(0, outputPath, ":", 1, 0)               //just the filename
1059                if(strlen(testStr)==0)
1060                        break           //cancel, allow exit
1061                endif
1062                if(strlen(testStr) > maxLength)
1063                        badlength = 1
1064                        DoAlert 2,"File name is too long. Is\r"+testStr[0,maxLength-1]+"\rOK?"
1065                        if(V_flag==3)
1066                                outputPath = ""
1067                                break
1068                        endif
1069                        if(V_flag==1)                   //my suggested name is OK, so trim the output
1070                                badlength=0
1071                                l1 = strlen(testStr)            //too long length
1072                                l1 = l1-maxLength               //number to trim
1073                                //Print outputPath
1074                                l2=strlen(outputPath)
1075                                outputPath = outputPath[0,l2-1-l1]
1076                                //Print "modified  ",outputPath
1077                        endif
1078                        //if(V_flag==2)  do nothing, let it go around again
1079                endif
1080               
1081        while(badLength)
1082       
1083        return outputPath
1084End
1085
1086// returns a shortened file name (26 characters max) so that the loader
1087// won't try to create Igor objects that have names that are longer than 31
1088//
1089Function/S ShortFileNameString(inStr)
1090        String inStr
1091
1092        String outStr=""
1093        Variable maxLength=25
1094        Variable nameTooLong=0
1095        String/G root:Packages:NIST:gShortNameStr = inStr[0,maxLength-1]
1096        SVAR newStr = root:Packages:NIST:gShortNameStr
1097
1098        if(strlen(inStr) <= maxLength)
1099                return (inStr)          //length OK
1100        else
1101                do
1102                        nameTooLong = 0
1103                       
1104                        DoAlert 1,"File name is too long. Is\r"+inStr[0,maxLength-1]+"\rOK?"
1105                        if(V_flag==1)                   //my suggested name is OK, so trim the output
1106                                outStr = inStr[0,maxLength-1]
1107                                //Print "modified  ",outStr
1108                                newStr=outStr
1109                                return(outStr)
1110                        endif
1111       
1112       
1113                        if(V_flag == 2)         //not OK, do something about it
1114                               
1115                                DoWindow/F ShorterNameInput             //it really shouldn't exist...
1116                                if(V_flag==0)
1117                               
1118                                        NewPanel /W=(166,90,666,230) as "Enter a Shorter Name"
1119                                        DoWindow/C ShorterNameInput
1120                                        SetDrawLayer UserBack
1121                                        TitleBox title0,pos={35,8},size={261,20},title=" Enter a shorter file name. It must be 25 characters or less "
1122                                        TitleBox title0,fSize=12,fStyle=1
1123                                        SetVariable setvar0,pos={21,52},size={300,15},title="New name",value= _STR:newStr
1124                                        SetVariable setvar0,proc=ShorterNameSetVarProc,fsize=12
1125                                        SetVariable setvar0 valueBackColor=(65535,49151,49151)
1126                                        Button button0,pos={259,87},size={60,20},title="Done"
1127                                        Button button0,proc=ShorterNameDoneButtonProc
1128                               
1129                                endif
1130                               
1131                                PauseForUser ShorterNameInput
1132                               
1133                                // this really should force a good name, but there could be errors that I'm not catching
1134//                              Print newStr, strlen(newStr)
1135                                nameTooLong = 0
1136                        endif
1137               
1138                while (nameTooLong)
1139               
1140                return(newStr)
1141               
1142        endif
1143               
1144End
1145
1146
1147// for the ShortFileNameString() - PauseForUser to get a shorter file name
1148Function ShorterNameSetVarProc(sva) : SetVariableControl
1149        STRUCT WMSetVariableAction &sva
1150               
1151        switch( sva.eventCode )
1152                case 1: // mouse up
1153                case 2: // Enter key
1154                case 3: // Live update
1155                                String sv = sva.sval
1156                                if( strlen(sv) > 25 )
1157                                        sv= sv[0,24]
1158                                        SetVariable  $(sva.ctrlName),win=$(sva.win),value=_STR:sv
1159                                        SetVariable setvar0 valueBackColor=(65535,49151,49151)
1160                                        Beep
1161                                else
1162                                        SetVariable setvar0 valueBackColor=(65535,65535,65535)
1163                                endif
1164                                break
1165                endswitch
1166        return 0
1167End
1168
1169// for the ShortFileNameString() - PauseForUser to get a shorter file name
1170Function ShorterNameDoneButtonProc(ba) : ButtonControl
1171        STRUCT WMButtonAction &ba
1172       
1173        String win = ba.win
1174
1175        switch (ba.eventCode)
1176                case 2:
1177                        SVAR newStr = root:Packages:NIST:gShortNameStr
1178                        ControlInfo setvar0
1179                        newStr = S_value
1180                        DoWindow/K ShorterNameInput
1181                       
1182                        break
1183        endswitch
1184
1185        return 0
1186End
1187
1188
1189// a function common to many panels, so put the basic version here that simply
1190// returns null string if no functions are present. Calling procedures can
1191// add to the list to customize as needed.
1192// show the available models
1193// not the f*(cw,xw) point calculations
1194// not the *X(cw,xw) XOPS
1195//
1196// KIND:10 should show only user-defined curve fitting functions
1197// - not XOPs
1198// - not other user-defined functions
1199Function/S User_FunctionPopupList()
1200        String list,tmp
1201        list = FunctionList("*",";","KIND:10")          //get every user defined curve fit function
1202
1203        //now start to remove everything the user doesn't need to see...
1204
1205        tmp = FunctionList("*_proto",";","KIND:10")             //prototypes
1206        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1207
1208
1209        //prototypes that show up if GF is loaded
1210        list = RemoveFromList("GFFitFuncTemplate", list)
1211        list = RemoveFromList("GFFitAllAtOnceTemplate", list)
1212        list = RemoveFromList("NewGlblFitFunc", list)
1213        list = RemoveFromList("NewGlblFitFuncAllAtOnce", list)
1214        list = RemoveFromList("GlobalFitFunc", list)
1215        list = RemoveFromList("GlobalFitAllAtOnce", list)
1216        list = RemoveFromList("GFFitAAOStructTemplate", list)
1217        list = RemoveFromList("NewGF_SetXWaveInList", list)
1218        list = RemoveFromList("NewGlblFitFuncAAOStruct", list)
1219       
1220        // more to remove as a result of 2D/Gizmo
1221        list = RemoveFromList("A_WMRunLessThanDelta", list)
1222        list = RemoveFromList("WMFindNaNValue", list)
1223        list = RemoveFromList("WM_Make3DBarChartParametricWave", list)
1224        list = RemoveFromList("UpdateQxQy2Mat", list)
1225        list = RemoveFromList("MakeBSMask", list)
1226       
1227        // MOTOFIT/GenFit bits
1228        tmp = "GEN_allatoncefitfunc;GEN_fitfunc;GetCheckBoxesState;MOTO_GFFitAllAtOnceTemplate;MOTO_GFFitFuncTemplate;MOTO_NewGF_SetXWaveInList;MOTO_NewGlblFitFunc;MOTO_NewGlblFitFuncAllAtOnce;GeneticFit_UnSmearedModel;GeneticFit_SmearedModel;"
1229        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1230
1231        // SANS Reduction bits
1232        tmp = "ASStandardFunction;Ann_1D_Graph;Avg_1D_Graph;BStandardFunction;CStandardFunction;Draw_Plot1D;MyMat2XYZ;"
1233        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1234        tmp = "NewDirection;SANSModelAAO_MCproto;Monte_SANS_Threaded;Monte_SANS_NotThreaded;Monte_SANS_W1;Monte_SANS_W2;Monte_SANS_W3;Monte_SANS_W4;Monte_SANS;FractionReachingDetector;TwoLevel_EC;SmearedTwoLevel_EC;"
1235        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1236
1237
1238        // USANS Reduction bits
1239        tmp = "DSM_Guinier_Fit;RemoveMaskedPoints;"
1240        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1241
1242        //more functions from analysis models (2008)
1243        tmp = "Barbell_Inner;Barbell_Outer;Barbell_integrand;BCC_Integrand;Integrand_BCC_Inner;Integrand_BCC_Outer;"
1244        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1245        tmp = "CapCyl;CapCyl_Inner;CapCyl_Outer;ConvLens;ConvLens_Inner;ConvLens_Outer;"
1246        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1247        tmp = "Dumb;Dumb_Inner;Dumb_Outer;FCC_Integrand;Integrand_FCC_Inner;Integrand_FCC_Outer;"
1248        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1249        tmp = "Integrand_SC_Inner;Integrand_SC_Outer;SC_Integrand;SphCyl;SphCyl_Inner;SphCyl_Outer;"
1250        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1251        tmp = "CSPP_Outer;CSPP_Inner;PP_Outer;PP_Inner;"
1252        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1253        tmp = "Guinier_Fit;"
1254        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1255
1256        tmp = FunctionList("f*",";","NPARAMS:2")                //point calculations
1257        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1258       
1259        tmp = FunctionList("fSmear*",";","NPARAMS:3")           //smeared dependency calculations
1260        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1261       
1262        // anything that might be included in Irena
1263        tmp = FunctionList("GEN_*",";","KIND:10")
1264        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1265        tmp = FunctionList("IN2G_*",";","KIND:10")
1266        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1267        tmp = FunctionList("IR1A_*",";","KIND:10")
1268        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1269        tmp = FunctionList("IR1B_*",";","KIND:10")
1270        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1271        tmp = FunctionList("IR1U_*",";","KIND:10")
1272        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1273        tmp = FunctionList("IR1V_*",";","KIND:10")
1274        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1275        tmp = FunctionList("IR1_*",";","KIND:10")
1276        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1277        tmp = FunctionList("IR2D_*",";","KIND:10")
1278        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1279
1280        tmp = FunctionList("IR2D_*",";","KIND:10")
1281        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1282        tmp = FunctionList("IR2H_*",";","KIND:10")
1283        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";") 
1284        tmp = FunctionList("IR2L_*",";","KIND:10")
1285        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1286        tmp = FunctionList("IR2Pr_*",";","KIND:10")
1287        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1288        tmp = FunctionList("IR2R_*",";","KIND:10")
1289        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1290        tmp = FunctionList("IR2S_*",";","KIND:10")
1291        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1292        tmp = FunctionList("IR2_*",";","KIND:10")
1293        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1294        tmp = FunctionList("*LogLog",";","KIND:10")
1295        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1296       
1297        //functions included in Nika
1298        tmp = FunctionList("NI1*",";","KIND:10")
1299        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1300        tmp = FunctionList("TransAx_*",";","KIND:10")
1301        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1302        tmp = FunctionList("TransformAxis*",";","KIND:10")
1303        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1304        tmp = FunctionList("erfForNormal*",";","KIND:10")
1305        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1306
1307        // functions in Indra (USAXS)
1308        tmp = FunctionList("IN2Q_*",";","KIND:10")
1309        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1310        tmp = FunctionList("IN3_*",";","KIND:10")
1311        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1312       
1313//      tmp = FunctionList("*X",";","KIND:4")           //XOPs, but these shouldn't show up if KIND:10 is used initially
1314//      Print "X* = ",tmp
1315//      print " "
1316//      list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1317       
1318        //non-fit functions that I can't seem to filter out
1319        list = RemoveFromList("BinaryHS_PSF11;BinaryHS_PSF12;BinaryHS_PSF22;EllipCyl_Integrand;PP_Inner;PP_Outer;Phi_EC;TaE_Inner;TaE_Outer;",list,";")
1320
1321        // from 2010 model functions
1322        list = RemoveFromList("fTwoYukawa;DoBoxGraph;Gauss2D_theta;",list,";")
1323       
1324        // from Debye Sphere method
1325        list = RemoveFromList("CalcIQRfromMat;ConnectPoints2D;ConnectPoints3D;ConnectPoints3D_old;ConnectedRodFill;ConvertXYZto3N;CylindersAtPoints;",list,";")
1326        list = RemoveFromList("FillSphere;FillSphere3;FillSphereRadius;FillSphereRadiusNoOverlap;FillXCylinder;FillXYCircle;FillXZCircle;FillYCylinder;",list,";")
1327        list = RemoveFromList("FillYZCircle;FillZCylinder;PadMatrix;RandomFill3DMat;RandomPoints2D;SobolFill3DMat;SphereAtEachPoint;UnConnectedRodFill;XYZV_toByteVoxels;",list,";")
1328        list = RemoveFromList("MakeTriplet;SobolPoints2D;X_CylindersAtPoints;X_CylindersHexagonalGrid;X_CylindersSquareGrid;maxDistance_Threaded;KR_MultiCylinder;KR_MultiCylinder_Units;",list,";")
1329        list = RemoveFromList("X_CoreShellCylinderHexGrid;FillPlaneHexagonal;FillPlaneSquareGrid;FillSphereRadiusPeriodic;",list,";")
1330        list = RemoveFromList("Setup_Ur;M_energy;DoRotation;Copy_xyz_to_xyz3d;MultiCyl_Loop;",list,";")
1331
1332// from Polarization
1333        list = RemoveFromList("ParseDecayRow;ParseFlipperRow;",list,";")
1334
1335// from 2012 models
1336        list = RemoveFromList("cng_integ;",list,";")
1337
1338// from 2012 Event Mode Processing
1339        list = RemoveFromList("CleanupTimes;IndexForHistogram;JointHistogram;MakeFibonacciWave;Osc_ProcessEvents;SetFibonacciBins;SetLinearBins;SetLogBins;Stream_ProcessEvents;",list,";")
1340
1341// from 2013 Simulation
1342//      list = RemoveFromList("EC_Empirical;SmearedEC_Empirical;",list,";")
1343        list = RemoveFromList("SAS_XS_Sphere;Generate_UofR;Setup_Ur_HS;",list,";")
1344
1345
1346// from 2014 Automation of reduction
1347        list = RemoveFromList("DoAnnulusGraph;DoArcGraph;",list,";")
1348       
1349// from 2017-2018 VSANS reduction
1350        tmp = FunctionList("V_*",";","KIND:10")
1351        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1352        list = RemoveFromList("V_BroadPeak_Pix2D;V_BroadPeak_Pix2D_noThread;V_CleanupTimes;V_I_BroadPeak_Pix2D;V_IndexForHistogram;V_MakeFibonacciWave;V_UpdatePix2Mat;",list,";")
1353
1354        tmp = FunctionList("*X_",";","KIND:10")         // dummy functions with "X_" at the end, for vsans (2018)
1355        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";")
1356       
1357        list = RemoveFromList("Integrate_BuiltIn;intgrnd;xJointHistogram;",list,";")
1358
1359                               
1360        list = SortList(list)
1361        return(list)
1362End
1363
1364
1365///////////////////////////////////////////////////
1366// old SANSPreferences have been moved here to a common place and renamed to "NCNR Preferences" so that they
1367// are common to all of the packages (and will appear on all of the menus)
1368//
1369// globals moved to root:Packages:NIST: since this is generated by all packages.
1370//
1371///////////////////////////
1372// user preferences
1373//
1374// globals are created in initialize.ipf
1375//
1376// this panel allows for user modification
1377///////////////////////////
1378Proc Show_Preferences_Panel()
1379
1380        DoWindow/F Pref_Panel
1381        if(V_flag==0)
1382                // only re-initialize if the variables don't exist, so you don't overwrite what users have changed
1383                if( exists("root:Packages:NIST:gXML_Write") != 2 )              //if the global variable does not exist, initialize
1384                        Initialize_Preferences()
1385                endif
1386                Pref_Panel()
1387        Endif
1388//      Print "Preferences Panel stub"
1389End
1390
1391Proc Initialize_Preferences()
1392        // create the globals here if they are not already present
1393       
1394        // each package initialization should call this to repeat the initialization
1395        // without overwriting what was already set
1396       
1397        Variable val
1398       
1399        ///// items for SANS reduction
1400        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault", 1 )
1401        Variable/G root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault=val
1402       
1403        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gAllowDRK", 0 )
1404        Variable/G root:Packages:NIST:gAllowDRK=val                     //don't show DRK as default
1405       
1406        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoTransCheck", 1 )
1407        Variable/G root:Packages:NIST:gDoTransCheck=val
1408       
1409        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gBinWidth", 1 )
1410        Variable/G root:Packages:NIST:gBinWidth=val
1411       
1412        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gNPhiSteps", 72 )
1413        Variable/G root:Packages:NIST:gNPhiSteps=val
1414       
1415        // flags to turn detector corrections on/off for testing (you should leave these ON)
1416        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr", 1 )
1417        Variable/G root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr = 1
1418       
1419        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr", 1 )
1420        Variable/G root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr = 1
1421
1422// flag to allow adding raw data files with different attenuation (normally not done)   
1423        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten",0)
1424        Variable/G root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten=val
1425       
1426        /// items for SANS Analysis
1427       
1428       
1429        /// items for USANS Reduction
1430// is the data file from NICE and in terms of QValues rather than angle
1431        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues", 1 )
1432        Variable/G root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues=val   
1433       
1434        /// items for everyone
1435        val = NumVarOrDefault("root:Packages:NIST:gXML_Write", 0 )
1436        Variable/G root:Packages:NIST:gXML_Write = val
1437       
1438       
1439end
1440
1441Function LogScalePrefCheck(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1442        String ctrlName
1443        Variable checked
1444       
1445        NVAR gLog = root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault
1446        glog=checked
1447        //print "log pref checked = ",checked
1448End
1449
1450Function DRKProtocolPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1451        String ctrlName
1452        Variable checked
1453       
1454        NVAR gDRK = root:Packages:NIST:gAllowDRK
1455        gDRK = checked
1456        //Print "DRK preference = ",checked
1457End
1458
1459Function UnityTransPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1460        String ctrlName
1461        Variable checked
1462       
1463        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoTransCheck
1464        gVal = checked
1465End
1466
1467Function XMLWritePref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1468        String ctrlName
1469        Variable checked
1470       
1471        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gXML_Write
1472        gVal = checked
1473End
1474
1475Function DoTransCorrPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1476        String ctrlName
1477        Variable checked
1478       
1479        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr
1480        gVal = checked
1481End
1482
1483Function DoEfficiencyCorrPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1484        String ctrlName
1485        Variable checked
1486       
1487        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr
1488        gVal = checked
1489End
1490
1491Function DoRawAttenAdjPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1492        String ctrlName
1493        Variable checked
1494       
1495        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten
1496        gVal = checked
1497End
1498
1499//set the angle->Q conversion factor
1500// or set the Q->Q "conversion" factor
1501// this is the same value that is set in Init_USANS_Facility()
1502// Mar 2019
1503Function RawUSANSisQPref(ctrlName,checked) : CheckBoxControl
1504        String ctrlName
1505        Variable checked
1506       
1507        NVAR gVal = root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues
1508        gVal = checked
1509       
1510        if(checked == 1)
1511                Variable/G root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:deg2QConv = 1             //so that the q-values are unchanged
1512        else
1513                Variable/G root:Packages:NIST:USANS:Globals:MainPanel:deg2QConv=5.55e-5         //JGB -- 2/24/01
1514        endif
1515End
1516
1517
1518
1519Function PrefDoneButtonProc(ctrlName) : ButtonControl
1520        String ctrlName
1521       
1522        DoWindow/K pref_panel
1523End
1524
1525Proc Pref_Panel()
1526        PauseUpdate; Silent 1           // building window...
1527        NewPanel /W=(646,208,1070,468)/K=2 as "NCNR Preference Panel"
1528        DoWindow/C pref_panel
1529        ModifyPanel cbRGB=(49694,61514,27679)
1530        SetDrawLayer UserBack
1531        ModifyPanel fixedSize=1
1532//////
1533//on main portion of panel, always visible
1534        Button PrefPanelButtonA,pos={354,12},size={50,20},proc=PrefDoneButtonProc,title="Done"
1535
1536        TabControl PrefTab,pos={7,49},size={410,202},tabLabel(0)="General",proc=PrefTabProc
1537        TabControl PrefTab,tabLabel(1)="SANS",tabLabel(2)="USANS",tabLabel(3)="Analysis"
1538        TabControl PrefTab,value=0
1539        TabControl PrefTab labelBack=(49694,61514,27679)
1540       
1541//on tab(0) - General - initially visible
1542        CheckBox PrefCtrl_0a,pos={21,96},size={124,14},proc=XMLWritePref,title="Use canSAS XML Output"
1543        CheckBox PrefCtrl_0a,help={"Checking this will set the default output format to be canSAS XML rather than NIST 6 column"}
1544        CheckBox PrefCtrl_0a,value= root:Packages:NIST:gXML_Write
1545
1546//on tab(1) - SANS
1547        CheckBox PrefCtrl_1a,pos={21,100},size={171,14},proc=LogScalePrefCheck,title="Use Log scaling for 2D data display"
1548        CheckBox PrefCtrl_1a,help={"Checking this will display 2D SANS data with a logarithmic color scale of neutron counts. If not checked, the color mapping will be linear."}
1549        CheckBox PrefCtrl_1a,value= root:Packages:NIST:gLogScalingAsDefault
1550        CheckBox PrefCtrl_1b,pos={21,120},size={163,14},proc=DRKProtocolPref,title="Allow DRK correction in protocols"
1551        CheckBox PrefCtrl_1b,help={"Checking this will allow DRK correction to be used in reduction protocols. You will need to re-draw the protocol panel for this change to be visible."}
1552        CheckBox PrefCtrl_1b,value= root:Packages:NIST:gAllowDRK
1553        CheckBox PrefCtrl_1c,pos={21,140},size={137,14},proc=UnityTransPref,title="Check for Transmission = 1"
1554        CheckBox PrefCtrl_1c,help={"Checking this will check for SAM or EMP Trans = 1 during data correction"}
1555        CheckBox PrefCtrl_1c,value= root:Packages:NIST:gDoTransCheck
1556        SetVariable PrefCtrl_1d,pos={21,170},size={200,15},title="Averaging Bin Width (pixels)"
1557        SetVariable PrefCtrl_1d,limits={1,100,1},value= root:Packages:NIST:gBinWidth
1558        SetVariable PrefCtrl_1e,pos={21,195},size={200,15},title="# Phi Steps (annular avg)"
1559        SetVariable PrefCtrl_1e,limits={1,360,1},value= root:Packages:NIST:gNPhiSteps
1560        CheckBox PrefCtrl_1f title="Do Transmssion Correction?",size={140,14},value=root:Packages:NIST:gDoTransmissionCorr,proc=DoTransCorrPref
1561        CheckBox PrefCtrl_1f pos={255,100},help={"TURN OFF ONLY FOR DEBUGGING. This corrects the data for angle dependent transmssion."}
1562        CheckBox PrefCtrl_1g title="Do Efficiency Correction?",size={140,14},proc=DoEfficiencyCorrPref
1563        CheckBox PrefCtrl_1g value=root:Packages:NIST:gDoDetectorEffCorr,pos={255,120},help={"TURN OFF ONLY FOR DEBUGGING. This corrects the data for angle dependent detector efficiency."}
1564        CheckBox PrefCtrl_1h title="Adjust RAW attenuation?",size={140,14},proc=DoRawAttenAdjPref
1565        CheckBox PrefCtrl_1h value=root:Packages:NIST:gDoAdjustRAW_Atten,pos={255,140},help={"This is normally not done"}
1566
1567        CheckBox PrefCtrl_1a,disable=1
1568        CheckBox PrefCtrl_1b,disable=1
1569        CheckBox PrefCtrl_1c,disable=1
1570        SetVariable PrefCtrl_1d,disable=1
1571        SetVariable PrefCtrl_1e,disable=1
1572        CheckBox PrefCtrl_1f,disable=1
1573        CheckBox PrefCtrl_1g,disable=1
1574        CheckBox PrefCtrl_1h,disable=1
1575
1576//on tab(2) - USANS
1577//      GroupBox PrefCtrl_2a pos={21,100},size={1,1},title="nothing to set",fSize=12
1578//      GroupBox PrefCtrl_2a,disable=1
1579        CheckBox PrefCtrl_2a,pos={21,100},size={171,14},proc=RawUSANSisQPref,title="Raw USANS Data is Q-values"
1580        CheckBox PrefCtrl_2a,help={"Check this if raw data was collected using NICE (q-values). If data was collected using ICP (angle), leave this unchecked."}
1581        CheckBox PrefCtrl_2a,value= root:Packages:NIST:gRawUSANSisQvalues
1582
1583
1584        CheckBox PrefCtrl_2a,disable=1
1585
1586
1587
1588//on tab(3) - Analysis
1589        GroupBox PrefCtrl_3a pos={21,100},size={1,1},title="nothing to set",fSize=12
1590       
1591        GroupBox PrefCtrl_3a,disable=1
1592
1593EndMacro
1594
1595// function to control the drawing of controls in the TabControl on the main panel
1596// Naming scheme for the controls MUST be strictly adhered to... else controls will
1597// appear in odd places...
1598// all controls are named PrefCtrl_NA where N is the tab number and A is the letter denoting
1599// the controls position on that particular tab.
1600// in this way, they will always be drawn correctly..
1601//
1602Function PrefTabProc(name,tab)
1603        String name
1604        Variable tab
1605       
1606//      Print "name,number",name,tab
1607        String ctrlList = ControlNameList("",";"),item="",nameStr=""
1608        Variable num = ItemsinList(ctrlList,";"),ii,onTab
1609        for(ii=0;ii<num;ii+=1)
1610                //items all start w/"PrefCtrl_", 9 characters
1611                item=StringFromList(ii, ctrlList ,";")
1612                nameStr=item[0,8]
1613                if(cmpstr(nameStr,"PrefCtrl_")==0)
1614                        onTab = str2num(item[9])                        //[9] is a number
1615                        ControlInfo $item
1616                        switch(abs(V_flag))     
1617                                case 1:
1618                                        Button $item,disable=(tab!=onTab)
1619                                        break
1620                                case 2:
1621                                        CheckBox $item,disable=(tab!=onTab)
1622                                        break
1623                                case 5:
1624                                        SetVariable $item,disable=(tab!=onTab)
1625                                        break
1626                                case 10:       
1627                                        TitleBox $item,disable=(tab!=onTab)
1628                                        break
1629                                case 4:
1630                                        ValDisplay $item,disable=(tab!=onTab)
1631                                        break
1632                                case 9:
1633                                        GroupBox $item,disable=(tab!=onTab)
1634                                        break
1635                                // add more items to the switch if different control types are used
1636                        endswitch
1637                endif
1638        endfor
1639        return(0)
1640End
1641
1642
1643
1644
1645
1646
1647
1648////////////////////////////////////
1649// Modification from Matt Wasbrough to allow rescaling of the
1650// axes while plotting and fitting. allows export of the rescaled
1651// data and of the rescaled model
1652// Nov 2012
1653///
1654
1655Function UseRescaleAxisCheckProc(cba) : CheckBoxControl
1656        STRUCT WMCheckboxAction &cba
1657
1658        switch( cba.eventCode )
1659                case 2: // mouse up
1660                        Variable checked = cba.checked
1661                        if(checked)
1662                                Execute "OpenAxisPanel()"
1663                        else
1664                                if(exists("RescaleAxisPanel") !=0)
1665                                        DoWindow/K RescaleAxisPanel
1666                                endif
1667                        endif
1668                        break
1669        endswitch
1670
1671        return 0
1672End
1673
1674Proc OpenAxisPanel()
1675        If(WinType("RescaleAxisPanel") == 0)
1676                //create the necessary data folder
1677                NewDataFolder/O root:Packages
1678                NewDataFolder/O root:Packages:NIST
1679                NewDataFolder/O root:Packages:NIST:RescaleAxis
1680                //initialize the values
1681                Variable/G root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA = 1
1682                Variable/G root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB = 1
1683                Variable/G root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC = 1
1684                RescaleAxisPanel()
1685        else
1686                //window already exists, just bring to front for update
1687                DoWindow/F RescaleAxisPanel
1688        endif
1689End
1690
1691Window RescaleAxisPanel()
1692        PauseUpdate; Silent 1           // building window...
1693        NewPanel /W=(461,46,735,195)/K=1
1694        ModifyPanel cbRGB=(49360,30954,64507), fixedSize=1
1695        SetDrawLayer UserBack
1696        PopupMenu ymodel,pos={20,10},size={76,19},title="y-axis"
1697        PopupMenu ymodel,help={"This popup selects how the y-axis will be linearized based on the chosen data"}
1698        PopupMenu ymodel,mode=1,value= #"\"I;log(I);ln(I);1/I;I^a;Iq^a;I^a q^b;1/sqrt(I);ln(Iq);ln(Iq^2)\""
1699        Button GoRescale,pos={50,80},size={70,20},proc=RescalePlot,title="Rescale"
1700        Button GoRescale,help={"This button will rescale the axis using the selections in this panel"}
1701        Button DoneButton,pos={170,80},size={70,20},proc=RADoneButton,title="Done"
1702        Button DoneButton,help={"This button will close the panel"}
1703        Button ExportData, pos={100,110}, size={90,20}, proc=ExportData, title="Export Data"
1704        Button ExportData, help={"This button will export data from the top graph"}
1705        SetVariable expa,pos={13,45},size={80,17},title="pow \"a\""
1706        SetVariable expa,help={"This sets the exponent \"a\" for some y-axis formats. The value is ignored if the model does not use an adjustable exponent"}
1707        SetVariable expa,limits={-2,10,0},value= root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
1708        SetVariable expb,pos={98,45},size={80,17},title="pow \"b\""
1709        SetVariable expb,help={"This sets the exponent \"b\" for some x-axis formats. The value is ignored if the model does not use an adjustable exponent"}
1710        SetVariable expb,limits={0,10,0},value= root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
1711        PopupMenu xmodel,pos={155,10},size={79,19},title="x-axis"
1712        PopupMenu xmodel,help={"This popup selects how the x-axis will be linearized given the chosen data"}
1713        PopupMenu xmodel,mode=1,value= #"\"q;log(q);q^2;q^c\""
1714        SetVariable expc,pos={182,45},size={80,17},title="pow \"c\""
1715        SetVariable expc,help={"This sets the exponent \"c\" for some x-axis formats. The value is ignored if the model does not use \"c\" as an adjustable exponent"}
1716        SetVariable expc,limits={-10,10,0},value= root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
1717        Button RAHelp, pos={220,110}, size={20,20}, proc=RAHelpButtonProc, title="?"
1718EndMacro
1719
1720Proc RADoneButton(ctrlName): ButtonControl
1721        String ctrlName
1722        DoWindow/K RescaleAxisPanel
1723        DoWindow/F WrapperPanel
1724        CheckBox check_8 value=0
1725end
1726
1727Function RAHelpButtonProc(ba) : ButtonControl
1728        STRUCT WMButtonAction &ba
1729
1730        switch( ba.eventCode )
1731                case 2: // mouse up
1732                        // click code here
1733                        DisplayHelpTopic/Z/K=1 "Rescaled Axis"
1734                        if(V_flag !=0)
1735                                DoAlert 0,"The Rescaled Axis Help file could not be found"
1736                        endif
1737                        break
1738        endswitch
1739
1740        return 0
1741End
1742
1743Proc ExportData(ctrlName): ButtonControl
1744        string ctrlName
1745        WriteRescaledData()             
1746End
1747       
1748
1749Function RescalePlot (ctrlName): ButtonControl
1750        String ctrlName
1751        SetDataFolder root:
1752        String topGraph= WinName(0,1)   //this is the topmost graph
1753        if(strlen(topGraph)==0)
1754                Abort "There is no graph"
1755        endif
1756               
1757        DoWindow/F $topGraph
1758        GetWindow/Z $topGraph, wavelist
1759        wave/t W_Wavelist
1760        SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1761        if (exists("W_WaveList")==1)
1762                KillWaves/Z root:Packages:NIST:RescaleAxis:W_WaveList
1763        endif
1764        MoveWave root:W_WaveList, root:Packages:NIST:RescaleAxis:W_WaveList
1765        SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1766        variable i,j,k
1767        string DF,DF1,temp, temp2, t1
1768        for (i=0; i < numpnts(W_WaveList)/3; i+=1)
1769                temp = W_WaveList[i][1]
1770                if (stringmatch(temp, "*_i") || stringmatch(temp, "*_i_RA"))
1771                        temp = W_WaveList[i][0]
1772                        if(stringmatch(temp, "*_i"))
1773                                temp = removeending(temp, "_i")
1774                        elseif(stringmatch(temp, "*_i_RA"))
1775                                temp = removeending(temp, "_i_RA")
1776                        endif
1777                        Make/T/O $temp/Wave=tempWave
1778                        DF = ReplaceString(W_Wavelist[i][0],W_Wavelist[i][1],"")
1779                        if (strlen(DF) ==0)
1780                                DF = ":"
1781                        endif
1782                        DF1 = "root"+DF
1783                        tempWave[0] = DF1
1784                        k = 1
1785                        for(j=0;j<numpnts(W_WaveList)/3; j+=1)
1786                                if (stringmatch(W_WaveList[j][1], "*"+temp+"*"))
1787                                        tempWave[k] = W_WaveList[j][0]
1788                                        k  = k+1
1789                                endif
1790                        endfor
1791                        redimension/N=(k) tempWave
1792                elseif(stringmatch(temp, "*ywave*"))
1793                        temp = W_WaveList[i][0]
1794                        if(stringmatch(temp, "*_RA"))
1795                                temp = removeending(temp, "_RA")
1796                        endif                   
1797                        Make/T/O $temp/Wave=tempWave
1798                        DF = ReplaceString(W_Wavelist[i][0],W_Wavelist[i][1],"")
1799                        if (strlen(DF) ==0)
1800                                DF = ":"
1801                        endif
1802                        DF1 = "root"+DF
1803                        tempWave[0] = DF1
1804                        temp2 = replacestring("ywave", temp, "")
1805                        k = 1
1806                        for(j=0;j<numpnts(W_WaveList)/3; j+=1)
1807                                t1 = W_Wavelist[j][1]
1808                                if (stringmatch(W_WaveList[j][1], "*wave"+temp2+"*"))
1809                                        tempWave[k] = W_WaveList[j][1]
1810                                        k  = k+1
1811                                endif
1812                        endfor
1813                        redimension/N=(k) tempWave
1814                endif
1815        endfor
1816        KillWaves/Z W_Wavelist
1817        string listWave = Wavelist("*", ";", "TEXT:1")
1818        string WaveToRescale, WaveDataFolder,xwave, ywave, swave
1819       
1820        for (i = 0; i < ItemsInList(listWave,";"); i+=1)
1821                temp = StringFromList(i,listWave,";")
1822                Wave/T WaveString = $temp
1823                for (j=1; j < numpnts(WaveString); j+=1)
1824                         WaveToRescale = Wavestring[j]
1825                         if (stringmatch(WaveToRescale, "*_RA"))
1826                                WaveToRescale = RemoveEnding(WaveToRescale, "_RA")
1827                         endif
1828                WaveDataFolder = WaveString[0]
1829                SetDataFolder $WaveDataFolder
1830                if (stringmatch(WaveToRescale, "*_q"))
1831                xwave = WaveToRescale
1832                XRescale(xwave)
1833                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "*_i"))
1834                ywave = WaveToRescale
1835                xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i")+"_q"
1836                YRescale(ywave, xwave)
1837                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "*_s"))
1838                swave = WaveToRescale
1839                ywave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_s")+"_i"
1840                xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_s")+"_q"
1841                ERescale(swave, ywave, xwave)
1842                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "xwave_*"))
1843                xwave=WaveToRescale
1844                XRescale(xwave)
1845                elseif (stringmatch(WaveToRescale, "ywave_*"))
1846                ywave = WaveToRescale
1847                xwave= ReplaceString("ywave", WaveToRescale, "xwave")
1848                YRescale(ywave, xwave)
1849                elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*_qvals"))
1850                xwave = WaveToRescale
1851                XRescale(xwave)
1852                elseif(stringmatch(WaveToRescale, "smeared*") && stringmatch(WaveToRescale, "!*_qvals"))
1853                ywave = WaveToRescale
1854                                for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1855                                        if (stringmatch(Wavestring[k], "*_qvals"))
1856                                                xwave = Wavestring[k]
1857                                        endif
1858                                endfor
1859                YRescale(ywave, xwave)
1860                else
1861                ywave = WaveToRescale
1862                        for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1863                                if (stringmatch(Wavestring[k], "*_q"))
1864                                        xwave = Wavestring[k]
1865                                endif
1866                        endfor
1867                YRescale(ywave,xwave)
1868                string yAxis = ywave+"_RA"
1869                wave yAxisWave = $yAxis
1870                SetFormula yAxisWave, "YRescale(ywave,xwave)"
1871                endif
1872                SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1873                endfor
1874        endfor
1875       
1876        string oldywave, xstr, ystr
1877        for (i = 0; i < ItemsInList(listWave,";"); i+=1)
1878                temp = StringFromList(i,listWave,";")
1879                Wave/T WaveString = $temp
1880                for (j=1; j < numpnts(WaveString); j+=1)
1881                         WaveToRescale = Wavestring[j]
1882                WaveDataFolder = WaveString[0]
1883                SetDataFolder $WaveDataFolder
1884                ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
1885                ystr = S_Value
1886                ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
1887                xstr = S_Value
1888                        if(cmpstr("I",ystr)==0 && cmpstr("q",xstr)==0)
1889                                if(stringmatch(WaveToRescale, "*_i_RA"))
1890                                        oldywave = WaveToRescale
1891                                        ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1892                                        xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i_RA")+"_q"
1893                                        replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1894                                        replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave
1895                                        swave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i_RA")+"_s"
1896                                        if(exists(swave)==1)
1897                                                ErrorBars/T=0/W=$topGraph $ywave, Y wave=($swave,$swave)       
1898                                        endif
1899                                elseif (stringmatch(WaveToRescale,  "smeared*"))
1900                                        if(stringmatch(WaveToRescale,"*_RA") && stringmatch(WaveToRescale,"!*_qvals*") )
1901                                                oldywave = WaveToRescale
1902                                                ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1903                                                xwave = "smeared_qvals"
1904                                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1905                                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave
1906                                        endif
1907                                elseif(stringmatch(WaveToRescale,"ywave*") && stringmatch(WaveToRescale,"*_RA"))
1908                                        oldywave = WaveToRescale
1909                                        ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1910                                        xwave = ReplaceString("ywave",ywave,"xwave")
1911                                        replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1912                                        replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave                                 
1913                                elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*FitYw*") && stringmatch(WaveToRescale, "*_RA"))
1914                                        oldywave = WaveToRescale
1915                                        ywave = RemoveEnding(WaveToRescale,"_RA")
1916                                        for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1917                                                if (stringmatch(Wavestring[k], "*_q"))
1918                                                        xwave = Wavestring[k]
1919                                                endif
1920                                        endfor
1921                                        replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1922                                        replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave 
1923                                endif                   
1924                        elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*_RA"))
1925                        elseif (stringmatch(WaveToRescale, "*_i"))
1926                                DoWindow/F topGraph
1927                                oldywave = WaveToRescale
1928                                xwave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i")+"_q_RA"
1929                                ywave = WaveToRescale + "_RA"
1930                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1931                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave
1932                                ModifyGraph log=0
1933                                swave = RemoveEnding(WaveToRescale, "_i")+"_s_RA"
1934                                if(exists(swave)==1)
1935                                        ErrorBars/T=0/W=$topGraph $ywave, Y wave=($swave,$swave)       
1936                                endif
1937                                DoUpdate       
1938                        elseif(stringmatch(WaveToRescale, "smeared*") && stringmatch(WaveToRescale, "!*_qvals"))
1939                                oldywave = WaveToRescale
1940                                ywave = WaveToRescale + "_RA"
1941                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1942                                xwave = "smeared_qvals_RA"
1943                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave 
1944                        elseif(stringmatch(WaveToRescale,"ywave*"))
1945                                oldywave = WaveToRescale
1946                                ywave = WaveToRescale + "_RA"
1947                                xwave = ReplaceString("ywave",ywave,"xwave")
1948                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1949                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave                                 
1950                        elseif(stringmatch(WaveToRescale, "*FitYw*"))
1951                                oldywave = WaveToRescale
1952                                ywave = WaveToRescale+"_RA"
1953                                for (k=1; k < numpnts(WaveString); k+=1)
1954                                        if (stringmatch(Wavestring[k], "*_q"))
1955                                                xwave = Wavestring[k]+"_RA"
1956                                        endif
1957                                endfor
1958                                replacewave/Y/W=$topGraph trace=$oldywave, $ywave
1959                                replacewave/X/W=$topGraph trace=$ywave, $xwave 
1960                        endif
1961                        SetDataFolder root:Packages:NIST:RescaleAxis
1962                        DoUpdate
1963                endfor
1964        endfor
1965        KillWaves/A/Z
1966               
1967        string ylabel, xlabel
1968        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
1969        ystr = S_Value
1970        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
1971        xstr = S_Value
1972       
1973        if(cmpstr("I",ystr)==0 && cmpstr("q",xstr)==0)
1974                modifygraph log=1
1975        else
1976                modifygraph log=0
1977        endif
1978       
1979        Variable pow_a,pow_b,pow_c
1980        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
1981        pow_a = V_value
1982        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
1983        pow_b = V_value
1984        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
1985        pow_c = V_value
1986       
1987        If (cmpstr("I",ystr) == 0)
1988                ylabel = "I(q)"
1989        elseif (cmpstr("ln(I)",ystr) == 0)
1990                ylabel = "ln(I)"
1991        elseif (cmpstr("log(I)",ystr) == 0)
1992                ylabel = "log(I)"
1993        elseif (cmpstr("1/I",ystr) == 0)
1994                ylabel = "1/I"
1995        elseif (cmpstr("I^a",ystr) == 0)
1996                ylabel = "I\S"+num2str(pow_a)+"\M"
1997        elseif (cmpstr("Iq^a",ystr) == 0)
1998                ylabel = "Iq\S"+num2str(pow_a)+"\M"
1999        elseif (cmpstr("I^a q^b",ystr) == 0)
2000                ylabel = "I\S"+num2str(pow_a)+"\Mq\S"+num2str(pow_b)+"\M"
2001        elseif (cmpstr("1/sqrt(I)",ystr) == 0)
2002                ylabel = "1/sqrt(I)"
2003        elseif (cmpstr("ln(Iq)",ystr) == 0)
2004                ylabel = "ln(Iq)"
2005        elseif (cmpstr("ln(Iq^2)",ystr) == 0)
2006                ylabel = "ln(Iq\S2\M)"
2007        endif
2008
2009        If (cmpstr("q",xstr) == 0)
2010                xlabel = "q (A\S-1\M)"
2011        elseif (cmpstr("q^2",xstr) == 0)
2012                xlabel = "q\S2\M"
2013        elseif (cmpstr("log(q)",xstr) == 0)
2014                xlabel = "log(q)"
2015        elseif (cmpstr("q^c",xstr) == 0)
2016                xlabel = "q\S"+num2str(pow_c)+"\M"
2017        endif
2018       
2019        SetAxis/A
2020        Label left ylabel
2021        Label bottom xlabel
2022       
2023        SetDataFolder root:
2024End
2025
2026Function YRescale(ywave, xwave)
2027        String ywave,xwave
2028 
2029        Wave yw = $ywave
2030        Wave xw = $xwave
2031       
2032        //Scaling exponents and background value
2033        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2034        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2035        pow_a = V_value
2036        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2037        pow_b = V_value
2038        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2039        pow_c = V_value
2040       
2041        //check for physical limits on exponent values
2042        // if bad values found, alert, and reset to good values so the rescaling can continue
2043        NVAR gA = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
2044        NVAR gB = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
2045        NVAR gC = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
2046        if((pow_a < -2) || (pow_a > 10))
2047                DoAlert 0,"Exponent a must be in the range (-2,10) - the exponent a has been reset to 1"
2048                gA = 1
2049        endif
2050        if((pow_b < 0) || (pow_b > 10))
2051                DoAlert 0,"Exponent b must be in the range (0,10) - the exponent b has been reset to 1"
2052                gB = 1
2053        endif
2054        //if q^c is the x-scaling, c must be be within limits and also non-zero
2055        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2056        If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2057                if(pow_c == 0)
2058                        DoAlert 0,"Exponent c must be non-zero, c has been reset to 1"
2059                        gC = 1
2060                endif
2061                if((pow_c < -10) || (pow_c > 10))
2062                        DoAlert 0,"Exponent c must be in the range (-10,10), c has been reset to 1"
2063                        gC = 1
2064                endif
2065        endif
2066       
2067        //variables set for each model to control look of graph
2068        String ystr, yAxis
2069        //check for proper y-scaling selection, make the necessary waves
2070//      Wave yAxisWave
2071
2072        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
2073        ystr = S_Value
2074       
2075        do
2076                If (cmpstr("I",S_Value) == 0)
2077                        yAxis = ywave+"_RA"
2078                        if (exists(yAxis)== 0)
2079                                Duplicate yw $yAxis
2080                        endif
2081                        SetScale d 0,0,"1/cm",$yAxis
2082                        wave yAxisWave = $yAxis
2083                        yAxisWave = yw
2084                        break   
2085                endif
2086                If (cmpstr("ln(I)",S_Value) == 0)
2087                        yAxis = ywave+"_RA"
2088                        if (exists(yAxis)== 0)
2089                                Duplicate yw $yAxis
2090                        endif
2091                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2092                        wave yAxisWave = $yAxis
2093                        yAxisWave = ln(yw)
2094                        break   
2095                endif
2096                If (cmpstr("log(I)",S_Value) == 0)
2097                        yAxis = ywave+"_RA"
2098                        if (exists(yAxis)== 0)
2099                                Duplicate yw $yAxis
2100                        endif
2101                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2102                        wave yAxisWave = $yAxis
2103                        yAxisWave = log(yw)
2104                        break   
2105                endif
2106                If (cmpstr("1/I",S_Value) == 0)
2107                        yAxis = ywave+"_RA"
2108                        if (exists(yAxis)== 0)
2109                                Duplicate yw $yAxis
2110                        endif
2111                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2112                        wave yAxisWave = $yAxis
2113                        yAxisWave = 1/(yw)
2114                        break
2115                endif
2116                If (cmpstr("I^a",S_Value) == 0)
2117                        yAxis = ywave+"_RA"
2118                        if (exists(yAxis)== 0)
2119                                Duplicate yw $yAxis
2120                        endif
2121                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2122                        wave yAxisWave = $yAxis
2123                        yAxisWave = yw^pow_a
2124                        break
2125                endif
2126                If (cmpstr("Iq^a",S_Value) == 0)
2127                        yAxis = ywave+"_RA"
2128                        if (exists(yAxis)== 0)
2129                                Duplicate yw $yAxis
2130                        endif
2131                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2132                        wave yAxisWave = $yAxis
2133                        yAxisWave = yw*xw^pow_a
2134                        break
2135                endif
2136                If (cmpstr("I^a q^b",S_Value) == 0)
2137                        yAxis = ywave+"_RA"
2138                        if (exists(yAxis)== 0)
2139                                Duplicate yw $yAxis
2140                        endif
2141                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2142                        wave yAxisWave = $yAxis
2143                        yAxisWave = yw^pow_a*xw^pow_b
2144                        break
2145                endif
2146                If (cmpstr("1/sqrt(I)",S_Value) == 0)
2147                        yAxis = ywave+"_RA"
2148                        if (exists(yAxis)== 0)
2149                                Duplicate yw $yAxis
2150                        endif
2151                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2152                        wave yAxisWave = $yAxis
2153                        yAxisWave = 1/sqrt(yw)
2154                        break
2155                endif
2156                If (cmpstr("ln(Iq)",S_Value) == 0)
2157                        yAxis = ywave+"_RA"
2158                        if (exists(yAxis)== 0)
2159                                Duplicate yw $yAxis
2160                        endif
2161                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2162                        wave yAxisWave = $yAxis
2163                        yAxisWave = ln(xw*yw)
2164                        break
2165                endif
2166                If (cmpstr("ln(Iq^2)",S_Value) == 0)
2167                        yAxis = ywave+"_RA"
2168                        if (exists(yAxis)== 0)
2169                                Duplicate yw $yAxis
2170                        endif
2171                        SetScale d 0,0,"",$yAxis
2172                        wave yAxisWave = $yAxis
2173                        yAxisWave = ln(xw*xw*yw)
2174                        break
2175                endif
2176                //more ifs for each case
2177               
2178                // if selection not found, abort
2179                DoAlert 0,"Y-axis scaling incorrect. Aborting"
2180                Abort
2181        while(0)
2182End
2183
2184Function XRescale(xwave)       
2185        String xwave
2186 
2187        Wave xw = $xwave
2188                 
2189        //Scaling exponents and background value
2190        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2191        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2192        pow_a = V_value
2193        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2194        pow_b = V_value
2195        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2196        pow_c = V_value
2197       
2198//check for physical limits on exponent values
2199// if bad values found, alert, and reset to good values so the rescaling can continue
2200        NVAR gA = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
2201        NVAR gB = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
2202        NVAR gC = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
2203        if((pow_a < -2) || (pow_a > 10))
2204                DoAlert 0,"Exponent a must be in the range (-2,10) - the exponent a has been reset to 1"
2205                gA = 1
2206        endif
2207        if((pow_b < 0) || (pow_b > 10))
2208                DoAlert 0,"Exponent b must be in the range (0,10) - the exponent b has been reset to 1"
2209                gB = 1
2210        endif
2211        //if q^c is the x-scaling, c must be be within limits and also non-zero
2212        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2213        If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2214                if(pow_c == 0)
2215                        DoAlert 0,"Exponent c must be non-zero, c has been reset to 1"
2216                        gC = 1
2217                endif
2218                if((pow_c < -10) || (pow_c > 10))
2219                        DoAlert 0,"Exponent c must be in the range (-10,10), c has been reset to 1"
2220                        gC = 1
2221                endif
2222        endif
2223       
2224        //variables set for each model to control look of graph
2225        String xstr, xAxis
2226        //check for proper y-scaling selection, make the necessary waves
2227//      Wave xAxisWave
2228
2229        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2230        xstr = S_Value
2231        do
2232                // make the new yaxis wave
2233                If (cmpstr("q",S_Value) == 0)   
2234                        xAxis = xwave+"_RA"
2235                        if (exists(xAxis)== 0)
2236                                Duplicate xw $xAxis
2237                        endif
2238                        SetScale d 0,0,"A^-1",$xAxis
2239                        wave xAxisWave = $xAxis
2240                        xAxisWave = xw
2241                        break   
2242                endif
2243                If (cmpstr("q^2",S_Value) == 0)
2244                        xAxis = xwave+"_RA"
2245                        if (exists(xAxis)== 0)
2246                                Duplicate xw $xAxis
2247                        endif
2248                        SetScale d 0,0,"A^-2",$xAxis
2249                        wave xAxisWave = $xAxis
2250                        xAxisWave = xw*xw
2251                        break   
2252                endif
2253                If (cmpstr("log(q)",S_Value) == 0)     
2254                        xAxis = xwave+"_RA"
2255                        if (exists(xAxis)== 0)
2256                                Duplicate xw $xAxis
2257                        endif
2258                        SetScale d 0,0,"",$xAxis
2259                        wave xAxisWave = $xAxis
2260                        xAxisWave = log(xw)
2261                        break   
2262                endif
2263                If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2264                        xAxis = xwave+"_RA"
2265                        if (exists(xAxis)== 0)
2266                                Duplicate xw $xAxis
2267                        endif
2268                        SetScale d 0,0,"", $xAxis
2269                        wave xAxisWave = $xAxis
2270                        xAxisWave = xw^pow_c
2271                        break
2272                endif
2273       
2274                //more ifs for each case
2275                // if selection not found, abort
2276                DoAlert 0,"X-axis scaling incorrect. Aborting"
2277                Abort
2278        while(0)        //end of "case" statement for x-axis scaling
2279End
2280
2281Function ERescale(swave, ywave, xwave) 
2282        String swave, ywave, xwave
2283 
2284        Wave ew = $swave
2285        Wave yw = $ywave
2286        Wave xw = $xwave
2287                 
2288        //Scaling exponents and background value
2289        Variable pow_a,pow_b,pow_c
2290        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expa
2291        pow_a = V_value
2292        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expb
2293        pow_b = V_value
2294        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel expc
2295        pow_c = V_value
2296       
2297//check for physical limits on exponent values
2298// if bad values found, alert, and reset to good values so the rescaling can continue
2299        NVAR gA = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpA
2300        NVAR gB = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpB
2301        NVAR gC = root:Packages:NIST:RescaleAxis:gRAExpC
2302        if((pow_a < -2) || (pow_a > 10))
2303                DoAlert 0,"Exponent a must be in the range (-2,10) - the exponent a has been reset to 1"
2304                gA = 1
2305        endif
2306        if((pow_b < 0) || (pow_b > 10))
2307                DoAlert 0,"Exponent b must be in the range (0,10) - the exponent b has been reset to 1"
2308                gB = 1
2309        endif
2310        //if q^c is the x-scaling, c must be be within limits and also non-zero
2311        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel xModel
2312        If (cmpstr("q^c",S_Value) == 0)
2313                if(pow_c == 0)
2314                        DoAlert 0,"Exponent c must be non-zero, c has been reset to 1"
2315                        gC = 1
2316                endif
2317                if((pow_c < -10) || (pow_c > 10))
2318                        DoAlert 0,"Exponent c must be in the range (-10,10), c has been reset to 1"
2319                        gC = 1
2320                endif
2321        endif
2322       
2323        //variables set for each model to control look of graph
2324        String ystr, eWave
2325        //check for proper y-scaling selection, make the necessary waves
2326//      Wave yErrWave
2327
2328        ControlInfo/W=RescaleAxisPanel yModel
2329        ystr = S_Value
2330        do
2331               
2332                If (cmpstr("I",S_Value) == 0)
2333                        eWave = swave+"_RA"
2334                        if (exists(eWave) == 0)
2335                                Duplicate ew $eWave
2336                        endif
2337                        wave yErrWave = $eWave
2338                        yErrWave = ew
2339                        break   
2340                endif
2341                If (cmpstr("ln(I)",S_Value) == 0)
2342                        eWave = swave+"_RA"
2343                        if (exists(eWave) == 0)
2344                                Duplicate ew $eWave
2345                        endif
2346                        wave yErrWave = $eWave
2347                        yErrWave = ew/yw
2348                        break   
2349                endif
2350                If (cmpstr("log(I)",S_Value) == 0)
2351                        eWave = swave+"_RA"
2352                        if (exists(eWave) == 0)
2353                                Duplicate ew $eWave
2354                        endif
2355                        wave yErrWave = $eWave
2356                        yErrWave = ew/(2.30*yw)
2357                        break   
2358                endif
2359                If (cmpstr("1/I",S_Value) == 0)
2360                        eWave = swave+"_RA"
2361                        if (exists(eWave) == 0)
2362                                Duplicate ew $eWave
2363                        endif
2364                        wave yErrWave = $eWave
2365                        yErrWave = ew/(yw^2)
2366                        break
2367                endif
2368                If (cmpstr("I^a",S_Value) == 0)
2369                        eWave = swave+"_RA"
2370                        if (exists(eWave) == 0)
2371                                Duplicate ew $eWave
2372                        endif
2373                        wave yErrWave = $eWave
2374                        yErrWave = ew*abs(pow_a*(yw^(pow_a-1)))
2375                        break
2376                endif
2377                If (cmpstr("Iq^a",S_Value) == 0)
2378                        eWave = swave+"_RA"
2379                        if (exists(eWave) == 0)
2380                                Duplicate ew $eWave
2381                        endif
2382                        wave yErrWave = $eWave
2383                        yErrWave = ew*xw^pow_a
2384                        break
2385                endif
2386                If (cmpstr("I^a q^b",S_Value) == 0)
2387                        eWave = swave+"_RA"
2388                        if (exists(eWave) == 0)
2389                                Duplicate ew $eWave
2390                        endif
2391                        wave yErrWave = $eWave
2392                        yErrWave = ew*abs(pow_a*(yw^(pow_a-1)))*xw^pow_b
2393                        break
2394                endif
2395                If (cmpstr("1/sqrt(I)",S_Value) == 0)
2396                        eWave = swave+"_RA"
2397                        if (exists(eWave) == 0)
2398                                Duplicate ew $eWave
2399                        endif
2400                        wave yErrWave = $eWave
2401                        yErrWave = 0.5*ew*yw^(-1.5)
2402                        break
2403                endif
2404                If (cmpstr("ln(Iq)",S_Value) == 0)
2405                        eWave = swave+"_RA"
2406                        if (exists(eWave) == 0)
2407                                Duplicate ew $eWave
2408                        endif
2409                        wave yErrWave = $eWave
2410                        yErrWave =ew/yw
2411                        break
2412                endif
2413                If (cmpstr("ln(Iq^2)",S_Value) == 0)
2414                        eWave = swave+"_RA"
2415                        if (exists(eWave) == 0)
2416                                Duplicate ew $eWave
2417                        endif
2418                        wave yErrWave = $eWave
2419                        yErrWave = ew/yw
2420                        break
2421                endif
2422                //more ifs for each case
2423               
2424                // if selection not found, abort
2425                DoAlert 0,"Y-axis scaling incorrect. Aborting"
2426                Abort
2427        while(0)        //end of "case" statement for y-axis scaling
2428
2429End
2430
2431///////////////////////////
2432
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.