Changeset 455


Ignore:
Timestamp:
Nov 24, 2008 12:54:13 PM (14 years ago)
Author:
srkline
Message:

Two changes: (1) remove threading of Cyl-PolyRad? model until WM can fix the crashing bug related to compiling/threadsafe...
(2) fixed bug in the calculation of the random deviate for MC calculations. The wrong scattering cross section was calculated depending on wavelength. This has been corrected.

Location:
sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures
Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Analysis/Models/NewModels_2006/Cylinder_PolyRadius_v40.ipf

    r379 r455  
    290290Function Cyl_PolyRadius(cw,yw,xw) : FitFunc 
    291291        Wave cw,yw,xw 
    292          
    293 #if exists("Cyl_PolyRadiusX") 
    294  
    295         Variable npt=numpnts(yw) 
    296         Variable i,nthreads= ThreadProcessorCount 
    297         variable mt= ThreadGroupCreate(nthreads) 
    298292 
    299293//      Variable t1=StopMSTimer(-2) 
    300          
    301         for(i=0;i<nthreads;i+=1) 
    302         //      Print (i*npt/nthreads),((i+1)*npt/nthreads-1) 
    303                 ThreadStart mt,i,Cyl_PolyRadius_T(cw,yw,xw,(i*npt/nthreads),((i+1)*npt/nthreads-1)) 
    304         endfor 
    305  
    306         do 
    307                 variable tgs= ThreadGroupWait(mt,100) 
    308         while( tgs != 0 ) 
    309  
    310         variable dummy= ThreadGroupRelease(mt) 
    311          
     294 
     295///////NON-THREADED VERSION /////// 
     296#if exists("Cyl_PolyRadiusX")    
     297        yw = Cyl_PolyRadiusX(cw,xw) 
     298#else 
     299        yw = fCyl_PolyRadius(cw,xw) 
     300#endif 
     301 
     302/// THREADED VERSION HAS BEEN REMOVED DUE TO CRASHES //////      
     303//#if exists("Cyl_PolyRadiusX") 
     304// 
     305//      Variable npt=numpnts(yw) 
     306//      Variable i,nthreads= ThreadProcessorCount 
     307//      variable mt= ThreadGroupCreate(nthreads) 
     308// 
     309//      for(i=0;i<nthreads;i+=1) 
     310//      //      Print (i*npt/nthreads),((i+1)*npt/nthreads-1) 
     311//              ThreadStart mt,i,Cyl_PolyRadius_T(cw,yw,xw,(i*npt/nthreads),((i+1)*npt/nthreads-1)) 
     312//      endfor 
     313// 
     314//      do 
     315//              variable tgs= ThreadGroupWait(mt,100) 
     316//      while( tgs != 0 ) 
     317// 
     318//      variable dummy= ThreadGroupRelease(mt) 
     319//       
     320//#else 
     321//              yw = fCyl_PolyRadius(cw,xw)             //the Igor, non-XOP, non-threaded calculation, messy to make ThreadSafe 
     322//#endif 
     323 
    312324//      Print "elapsed time = ",(StopMSTimer(-2) - t1)/1e6 
    313          
    314 #else 
    315                 yw = fCyl_PolyRadius(cw,xw)             //the Igor, non-XOP, non-threaded calculation 
    316 #endif 
     325 
    317326        return(0) 
    318327End 

  • sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Analysis/Models/NewModels_2008/BCC_ParaCrystal_v40.ipf

    r451 r455  
    9797End 
    9898 
    99  
    100 // nothing to change here 
    101 // 
    102 //AAO version, uses XOP if available 
    103 // simply calls the original single point calculation with 
    104 // a wave assignment (this will behave nicely if given point ranges) 
     99// Threaded version 
     100// Threaded XOP = 2.4 s 
     101// non-threaded, non-XOP = 46.8 s 
     102// = x 19.5 speedup ! 
     103// 
    105104Function BCC_ParaCrystal(cw,yw,xw) : FitFunc 
    106105        Wave cw,yw,xw 
    107          
     106 
     107///// NO threading ///////// 
    108108#if exists("BCC_ParaCrystalX") 
    109109        yw = BCC_ParaCrystalX(cw,xw) 
    … …  
    111111        yw = fBCC_ParaCrystal(cw,xw) 
    112112#endif 
     113 
     114 
     115/// THREADING /////// 
     116 
     117////    Variable t1=StopMSTimer(-2) 
     118//               
     119//#if exists("BCC_ParaCrystalX") 
     120// 
     121//      Variable npt=numpnts(yw) 
     122//      Variable i,nthreads= ThreadProcessorCount 
     123//      variable mt= ThreadGroupCreate(nthreads) 
     124// 
     125//      for(i=0;i<nthreads;i+=1) 
     126//      //      Print (i*npt/nthreads),((i+1)*npt/nthreads-1) 
     127//              ThreadStart mt,i,BCC_ParaCrystal_T(cw,yw,xw,(i*npt/nthreads),((i+1)*npt/nthreads-1)) 
     128//      endfor 
     129// 
     130//      do 
     131//              variable tgs= ThreadGroupWait(mt,100) 
     132//      while( tgs != 0 ) 
     133// 
     134//      variable dummy= ThreadGroupRelease(mt) 
     135//       
     136//#else 
     137//              yw = fBCC_ParaCrystal(cw,xw)            //the Igor, non-XOP, non-threaded calculation, messy to make ThreadSafe 
     138//#endif 
     139// 
     140////    Print "elapsed time = ",(StopMSTimer(-2) - t1)/1e6 
     141 
     142 
     143 
     144        return(0) 
     145End 
     146 
     147 
     148 
     149// nothing to change here 
     150// 
     151//AAO version, uses XOP if available 
     152// simply calls the original single point calculation with 
     153// a wave assignment (this will behave nicely if given point ranges) 
     154// 
     155// Threaded Version 
     156ThreadSafe Function BCC_ParaCrystal_T(cw,yw,xw,p1,p2) : FitFunc 
     157        Wave cw,yw,xw 
     158        Variable p1,p2 
     159 
     160//      Variable t1=StopMSTimer(-2) 
     161 
     162#if exists("BCC_ParaCrystalX") 
     163        yw[p1,p2] = BCC_ParaCrystalX(cw,xw) 
     164#else 
     165        yw[p1,p2] = fBCC_ParaCrystal(cw,xw) 
     166#endif 
     167 
     168//      Print "elapsed time = ",(StopMSTimer(-2) - t1)/1e6 
     169 
    113170        return(0) 
    114171End 

  • sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Analysis/Models/NewModels_2008/FCC_ParaCrystal_v40.ipf

    r451 r455  
    271271 
    272272//      the name of your unsmeared model (AAO) is the first argument 
    273         Smear_Model_76(FCC_ParaCrystal,s.coefW,s.xW,s.yW,s.resW) 
     273        Smear_Model_20(FCC_ParaCrystal,s.coefW,s.xW,s.yW,s.resW) 
    274274 
    275275        return(0) 

  • sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Analysis/Packages/ModelPicker/SANSModelPicker_v40.ipf

    r449 r455  
    563563         
    564564        Variable num=numpnts(selToDel),ii 
    565         String fname="" 
     565        String fname="",funcToDelStr="" 
    566566         
    567567        ii=num-1                //work backwards 
    … …  
    575575                        //delete the point  
    576576                        DeletePoints ii, 1, includedFileWave,selToDel 
     577                        // 
     578                        // be sure to kill the dependencies, otherwise some nasty crashes can result 
     579                        // (a bug in the WM's threading??? 
     580                        funcToDelStr = FunctionList("*",";","WIN:"+fname+fileVerExt+".ipf") 
     581                        KillAllDependentObjects("root:",funcToDelStr, 1, 1, 0) 
     582                          
    577583                endif 
    578584                ii-=1 
    579585        while(ii>=0) 
    580 //      Execute/P "COMPILEPROCEDURES ";Execute/P/Q/Z "RefreshMenu()" 
    581586        Execute/P "COMPILEPROCEDURES " 
    582587         
    … …  
    586591        Sort filewave,filewave 
    587592        return(0) 
     593End 
     594 
     595Function KillDependentVariables(folderStr,funcToDelStr) 
     596        String folderStr,funcToDelStr 
     597         
     598        String objName,formStr,funcStr,matchStr 
     599        Variable index = 0,loc 
     600         
     601        do 
     602                objName = GetIndexedObjName(folderStr, 2, index) 
     603                if (strlen(objName) == 0) 
     604                        break 
     605                endif 
     606                formStr = GetFormula($(folderStr+objName)) 
     607                if(strlen(formStr) != 0) 
     608                        loc = strsearch(formStr,"(",0) 
     609                        funcStr = formStr[0,loc-1] 
     610//                      Print objName,funcStr 
     611                        matchStr = ListMatch(funcToDelStr, funcStr ,";") 
     612                        if(strlen(matchStr) != 0) 
     613                                SetFormula $(folderStr+objName),""              //kill the dependency 
     614                                Printf "killed the dependency of %s on the function %s\r",folderStr+objName,matchStr 
     615                        endif 
     616                                 
     617                endif 
     618                                 
     619                index += 1 
     620        while(1) 
     621End 
     622 
     623 
     624 
     625// doesn't really kill all objects... 
     626// kills the dependency formula for any variable that has a formula that contains a function name 
     627// that matches anything in the funcToDelStr, which are functions that are about to be removed 
     628// from the experiment by DELETEINCLUDE 
     629// 
     630// recursively looks through all data folders 
     631// 
     632// on the first call: 
     633// pass "root:" as the pathName 
     634// full = 1 
     635// recurse = 1 
     636// level = 0 
     637// 
     638Function KillAllDependentObjects(pathName,funcToDelStr, full, recurse, level) 
     639        String pathName         // Name of symbolic path in which to look for folders. 
     640        String funcToDelStr             //list of functions to look for 
     641        Variable full                   // True to print full paths instead of just folder name. 
     642        Variable recurse                // True to recurse (do it for subfolders too). 
     643        Variable level          // Recursion level. Pass 0 for the top level. 
     644         
     645        Variable ii 
     646        String prefix 
     647         
     648//      SVAR allFiles=root:Packages:NIST:FileList:allFiles 
     649        // Build a prefix (a number of tabs to indicate the folder level by indentation) 
     650        prefix = "" 
     651        ii = 0 
     652        do 
     653                if (ii >= level) 
     654                        break 
     655                endif 
     656                prefix += "\t"                                  // Indent one more tab 
     657                ii += 1 
     658        while(1) 
     659         
     660//      Printf "%s%s\r", prefix, pathName 
     661//      Print IndexedFile($pathName,-1,"????") 
     662        //allFiles += IndexedFile($pathName,-1,"????") 
     663         
     664        KillDependentVariables(pathName,funcToDelStr) 
     665         
     666        String path 
     667        ii = 0 
     668        do 
     669                path = GetIndexedObjName(pathName, 4, ii) 
     670                if (strlen(path) == 0) 
     671                        break                                                   // No more folders 
     672                endif 
     673                path = pathName+path+":"                        //the full path 
     674//              Print "ii, path = ",ii,path 
     675 
     676                if (recurse)                                            // Do we want to go into subfolder? 
     677                        KillAllDependentObjects(path, funcToDelStr, full, recurse, level+1) 
     678                endif 
     679                 
     680                ii += 1 
     681        while(1) 
    588682End 
    589683 

  • sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Common/NCNR_Package_Loader.ipf

    r451 r455  
    3939        SVAR gMenuStr1b = root:Packages:NCNRItemStr1b 
    4040         
    41         String SANSAna_WinList = "wrapperPanel;Procedure_List;" 
     41        String SANSAna_WinList = "wrapperPanel;Procedure_List;Report;" 
    4242        strswitch(itemStr)      // string switch 
    4343                case "Load NCNR Analysis Macros":        
    … …  
    121121        SVAR gMenuStr2b = root:Packages:NCNRItemStr2b 
    122122         
    123         String SANSRed_WinList = "Main_Panel;CatVSTable;" 
     123        String SANSRed_WinList = "Main_Panel;CatVSTable;SANS_Data;Plot_Manager;Average_Panel;Plot_1d;CatWin;Surface_3D;FitPanel;FitWindow;" 
     124        SANSRed_WinList += "FitRPAPanel;SANS_Histo;drawMaskWin;Multiple_Reduce_Panel;NSORT_Panel;NSORT_Graph;CombineTable;ToCombine;Patch_Panel;" 
     125        SANSRed_WinList += "ProtocolPanel;Schematic_Layout;Tile_2D;RAW_to_ASCII;Trans_Panel;TransFileTable;ScatterFileTable;Convert_to_Trans;" 
     126        SANSRed_WinList += "WorkFileMath;Pref_Panel;Subtract_1D_Panel;Plot_Sub1D;SASCALC;MC_SASCALC;Saved_Configurations;TISANE;" 
    124127        strswitch(itemStr)      // string switch 
    125128                case "Load NCNR SANS Reduction Macros":  
    … …  
    187190        SVAR gMenuStr3b = root:Packages:NCNRItemStr3b 
    188191         
    189         String USANS_WinList = "USANS_Panel;COR_Graph;RawDataWin;Desmear_Graph;" 
     192        String USANS_WinList = "USANS_Panel;COR_Graph;RawDataWin;Desmear_Graph;USANS_Slope;" 
    190193         
    191194        strswitch(itemStr)      // string switch 

  • sans/Dev/trunk/NCNR_User_Procedures/Reduction/SANS/MultScatter_MonteCarlo_2D.ipf

    r454 r455  
    572572        Integrate/METH=1 Gq/D=Gq_INT 
    573573         
    574         SASxs = lam*lam/2/pi*Gq_INT[nPts_ran-1] 
     574//      SASxs = lam*lam/2/pi*Gq_INT[nPts_ran-1]                 //if the approximation is used 
     575        SASxs = lam*Gq_INT[nPts_ran-1] 
    575576         
    576577        Gq_INT /= Gq_INT[nPts_ran-1] 
    … …  
    687688        list = RemoveFromList("BinaryHS_PSF11;BinaryHS_PSF12;BinaryHS_PSF22;EllipCyl_Integrand;PP_Inner;PP_Outer;Phi_EC;TaE_Inner;TaE_Outer;",list,";") 
    688689//////////////// 
     690 
     691        //more functions from analysis models (2008) 
     692        tmp = "Barbell_Inner;Barbell_Outer;Barbell_integrand;BCC_Integrand;Integrand_BCC_Inner;Integrand_BCC_Outer;" 
     693        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";") 
     694        tmp = "CapCyl;CapCyl_Inner;CapCyl_Outer;ConvLens;ConvLens_Inner;ConvLens_Outer;" 
     695        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";") 
     696        tmp = "Dumb;Dumb_Inner;Dumb_Outer;FCC_Integrand;Integrand_FCC_Inner;Integrand_FCC_Outer;" 
     697        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";") 
     698        tmp = "Integrand_SC_Inner;Integrand_SC_Outer;SC_Integrand;SphCyl;SphCyl_Inner;SphCyl_Outer;" 
     699        list = RemoveFromList(tmp, list  ,";") 
    689700 
    690701        //simplify the display, forcing smeared calculations behind the scenes 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.